; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh09G005120 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh09G005120
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionCryptochrome DASH
Genome locationCma_Chr09:2291467..2296707
RNA-Seq ExpressionCmaCh09G005120
SyntenyCmaCh09G005120
Gene Ontology termsGO:0000719 - photoreactive repair (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003913 - DNA photolyase activity (molecular function)
GO:0071949 - FAD binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002081 - Cryptochrome/DNA photolyase class 1
IPR006050 - DNA photolyase, N-terminal
IPR014729 - Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold
IPR036155 - Cryptochrome/photolyase, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6591617.1 Cryptochrome DASH, chloroplastic/mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.0e-14198.86Show/hide
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KAG7024500.1 Cryptochrome DASH, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-14098.48Show/hide
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XP_023535244.1 cryptochrome DASH, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.6e-14198.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LEG3 Cryptochrome DASH2.2e-12087.97Show/hide
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A0A6J1CNT8 Cryptochrome DASH4.2e-12486.52Show/hide
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A0A6J1F5Y0 Cryptochrome DASH1.9e-14098.48Show/hide
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A0A6J1IDX9 cryptochrome DASH, chloroplastic/mitochondrial-like7.1e-18895.56Show/hide
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A0A6J1IEZ9 Cryptochrome DASH5.3e-143100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q38JU2 Cryptochrome DASH, chloroplastic/mitochondrial8.9e-7964.91Show/hide
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        F  N S K+ S +  ++ ++  VPGL  EEM+R+ EQ F+RY S      ++GKGVAIVWFRNDLRVLDNEAL +AW+SSEA+LPVYCVDPRLFG+T YF
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        G PKTGALRAQFI+ECL DLKRNL+ RGL+LLIQHGKPE+I+PSLAKA  AHTVYA  ETCSEE+ VE+MV++ L+ +V   +      P S  +  L+L
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        VWG+TMYHIDDLPFD  SLPDVYTQFRK
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Q651U1 Cryptochrome DASH, chloroplastic/mitochondrial9.5e-7358.08Show/hide
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        +L  L +SS L P    +   SA  R+ +    S + S SSSSS        VP L ++E    A++ F RY SPS      G GVAIVWFRNDLRVLDN
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        EA+ +AW +S+AVLPVYCVDPR+  GST YFGFPKTGALRAQF++ECL DLKRNL  +GL+LLI+HGKPE+ILPS+AKA+ AHTVYA  ETCSEEL VE 
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Query:  MVSKGLKTVVL-SPTSEKSAKPSSAKSLTLQLVWGTTMYHIDDLPFDTNSLPDVYTQFRK
        +V KGL+ VV+    +    KP + K   LQL+WG T+YH+DDLPF  N+LPDVYTQFRK
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Q7NMD1 Cryptochrome DASH5.8e-3040.94Show/hide
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        +VW+RNDLRV D+E L  A   +  V+ +YC DPR FG    FGF KTG  RA+F++E +ADL+R+L   G +LL++ G PEE++P+L   L    V+  
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Query:  METCSEELYVERMVSKGLKTVVLSPTSEKSAKPSSAKSLTLQLVWGTTMYHIDDLPFDTNSLPDVYTQFRK
         E  SEEL VER +   L  +                ++ ++  WGTT+ H DDLPF   ++P+++T FRK
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Q84KJ5 Cryptochrome DASH, chloroplastic/mitochondrial2.0e-7056.86Show/hide
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        +SSL  +   +N   R        SK    SSS  +C          +VP L  EE+D +A + F RYA PSSSSVKR GKGV I+WFRNDLRVLDN+AL
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        YKAW SS+ +LPVYC+DPRLF +T +F FPKTGALR  F++ECL DL++NL+ RGLNLLI+ GKPEEILPSLAK  GA TV+A  ETCSEE+ VER+V++
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Query:  GLKTVVLSPTSEKSAKPSSAKSLTLQLVWGTTMYHIDDLPFDTNSLPDVYTQFRK
        GLK V                S  L+L+WG+TMYH DDLPFD   LPDVYTQFRK
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Q8LB72 Blue-light photoreceptor PHR23.0e-3442.02Show/hide
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        RR   PSS++  R    A+VWFRNDLRV DNE L  A     +VLPVYC DPR +G +   GF KTG  RAQF++E +++L++NL  RG NL+++ GKPE
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         +L  LAK +GA  VYA  E   +E+  E  +   +K                 + + ++  WG+T+YH+DDLPF    LP  Y  F+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G47590.1 photolyase/blue-light receptor 22.1e-3542.02Show/hide
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        RR   PSS++  R    A+VWFRNDLRV DNE L  A     +VLPVYC DPR +G +   GF KTG  RAQF++E +++L++NL  RG NL+++ GKPE
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Query:  EILPSLAKALGAHTVYAQMETCSEELYVERMVSKGLKTVVLSPTSEKSAKPSSAKSLTLQLVWGTTMYHIDDLPFDTNSLPDVYTQFR
         +L  LAK +GA  VYA  E   +E+  E  +   +K                 + + ++  WG+T+YH+DDLPF    LP  Y  F+
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AT3G15620.1 DNA photolyase family protein1.2e-0937.96Show/hide
Query:  SPSS------SSVKRGKGVAIVWFRNDLRVLDNEALYKAWISSEAVLPVYCVDPRLF---GSTCYFGFPKTGALRAQFIVECLADLKRNLINRGLNLLIQ
        SPSS      +S+  G G +++WFR  LRV DN AL  A   SE + PV+ +DP       S    G  + G  R +F++E L DL  +L   G  LL+ 
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Query:  HGKPEEIL
         G+P E+L
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AT3G15620.2 DNA photolyase family protein1.2e-0937.96Show/hide
Query:  SPSS------SSVKRGKGVAIVWFRNDLRVLDNEALYKAWISSEAVLPVYCVDPRLF---GSTCYFGFPKTGALRAQFIVECLADLKRNLINRGLNLLIQ
        SPSS      +S+  G G +++WFR  LRV DN AL  A   SE + PV+ +DP       S    G  + G  R +F++E L DL  +L   G  LL+ 
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         G+P E+L
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AT4G25290.1 DNA photolyases;DNA photolyases6.9e-1028.02Show/hide
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        SS       A+VWF++DLRV D+  L  A     AV+P+Y +D R+           T  L    I   L DL++ L  +G NL++++G  E ++  L K
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Query:  ALGAHTVYAQMETCSEELYVERMVSKGLKTVVLSPTSEKSAKPSSAKSLTLQLVWGTTMYHIDDLPFDTNSLPDVYTQFRKV
         + A  V+ + E       V   V   L+ V LS  S +             + W T  Y   +L      LP  + +F+K+
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AT5G24850.1 cryptochrome 32.2e-7264.29Show/hide
Query:  ICQVPGLESEEMDRIAEQMFRRYASPSSSSVKR-GKGVAIVWFRNDLRVLDNEALYKAWISSEAVLPVYCVDPRLFGSTCYFGFPKTGALRAQFIVECLA
        I +VP L  EE+D +A + F RYA PSSSSVKR GKGV I+WFRNDLRVLDN+ALYKAW SS+ +LPVYC+DPRLF +T +F FPKTGALR  F++ECL 
Subjt:  ICQVPGLESEEMDRIAEQMFRRYASPSSSSVKR-GKGVAIVWFRNDLRVLDNEALYKAWISSEAVLPVYCVDPRLFGSTCYFGFPKTGALRAQFIVECLA

Query:  DLKRNLINRGLNLLIQHGKPEEILPSLAKALGAHTVYAQMETCSEELYVERMVSKGLKTVVLSPTSEKSAKPSSAKSLTLQLVWGTTMYHIDDLPFDTNS
        DL++NL+ RGLNLLI+ GKPEEILPSLAK  GA TV+A  ETCSEE+ VER+V++GLK V                S  L+L+WG+TMYH DDLPFD   
Subjt:  DLKRNLINRGLNLLIQHGKPEEILPSLAKALGAHTVYAQMETCSEELYVERMVSKGLKTVVLSPTSEKSAKPSSAKSLTLQLVWGTTMYHIDDLPFDTNS

Query:  LPDVYTQFRK
        LPDVYTQFRK
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTTTGTCATGAATTCTAGCTCGAAGCTTGATTCTAGGTCGTCTTCGTCGTCGATATGTCAAGTTCCGGGGCTAGAATCGGAGGAGATGGACAGGATTGCGGAACAAATGT
TCCGGCGGTATGCGTCTCCTTCTTCTTCGAGTGTTAAGAGAGGAAAAGGAGTGGCCATTGTATGGTTCAGAAATGACCTCCGTGTGCTGGACAATGAGGCCCTGTATAAG
GCCTGGATTTCGTCAGAGGCTGTGTTGCCGGTGTATTGCGTTGATCCGAGACTTTTTGGTTCTACCTGCTACTTTGGATTTCCTAAAACTGGAGCATTGAGAGCTCAATT
TATTGTTGAATGCTTGGCTGATTTGAAAAGGAATTTAATAAACCGAGGTCTTAACTTGCTTATTCAACATGGGAAGCCTGAAGAAATTCTCCCTTCTCTTGCTAAAGCTC
TTGGTGCCCACACAGTCTATGCTCAAATGGAAACTTGTAGTGAGGAACTATACGTTGAAAGAATGGTAAGCAAAGGACTCAAAACAGTGGTGCTATCACCAACCTCAGAG
AAGTCTGCCAAGCCAAGCTCTGCTAAAAGCCTTACTTTGCAACTTGTTTGGGGCACCACGATGTACCACATAGATGACCTTCCATTTGATACCAACAGTTTGCCTGATGT
CTACACTCAATTTCGTAAAGTACCGTATATTCTCTATATAGTTTTAGGTTCGTTATNCGACGACGGATTTCACCAATCTCGAATCGAACTGAGTTCCTCTCACGGCGGAT
CCGAACGCGATCTCGCCTTGACCAATCTGCGTAACCTTAATGAAACCTTGCTGATTCCTGGCAGCGCCGCTTGCCTGAAACAGAGTGGTGAGAACGGTAGTATTATCGGA
AGACAATCTAGCAAGCTTCTGAGCATCGTAATCCTTCTCAGGACGTCCAATGGCTTTCCAGATAGGCCAGAAACGGCGCCGTTGTCGAGGGCGAGGATAGTGATGGTTTT
ACGGCTGTTAATGTCACCGGCGAGATTTGTTTGTGTGAGGACATCGTTCAAATTATTGAAATCGGGGAACTGGCTTAGGAGCTTAGTGATATTGAAAGCGGAGGCTGCAG
AGAAGAGGAGGAAACTCAAAAGCAGGGCGGCGGAAGTGGCTCTGGAATCCATTCGATCACAAGTAGTGAAGCAAATGGACGGGGTGAGAACTGAGAAAGGAAGCAACAAG
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GGACACGCGAGTTTTCCATAAAGTGTCTACGAGATTAGTTAATGACATCTTAAGTCTCGAGATGACACCTGATAAATGGGTTTCCAATGTTATAAGTGTCATGGGTTTTC
ATGGTGTCGGTAAAGCCAGAAACACCGAGATCACAGCCATAACAGCCGCAGCTCCGATGAAGCTACCGCGTGAGGCGCCGGATTCATCGCTAGGTGCTGGAGCAGCCGCA
TCATCATCACCGTCGGCTGCTTTCGGTGGAGACCTTGCCGGCGAATCGGCAACAACCTTCGGTTTTTTGGCGGGAGGAGCCCTAGCCTTTGACGGAGTCTTAGCGGAAGG
AGCCGGTGCCTTTTTAGGTGATCCGACGGGAGAAAACGACGACGGTGGTGGTGGTGTTGGAGAGGAGCGAGATATTGTACGGCTGTGCGACGACGGATTTCACCAATCTC
GAATCGAACTGAGTTCCTCTCACGGCGGATCCGAACGCGATCTCACCTTGACCATTCTGCGTAACCTTGATGAAACCTTGCTGATTCCTGGCAGCGCCGCTTGCCTGAAA
CAGAGTGGTGAGAACAGTAGTATTATCGGAAGACAATCTAGCAAGCTTCTGAGCATCGTAATCCTTCTCAGAACGTCCAACGGCTTTCCAGATAGGCCAGAAACGGCGCT
GTTGTCGAGGGCGAGGATAGTGATGGTTCTACGGCTGTTAATTTCACCGGCGAGATTTGTTTGTGTGAGGAAATCATTCAAACTATTGAAATCGGGGAACTGGCTTAGGA
GATTAGTGATATTGAAAGCGGAGGCTGCAGAGAAGAGGAGGAAACTCAAAATCAGGGCAGCGGAAATGGCTCTGGAATCCATTTATAAATTTTCCTCTGTTCTTGGCTTC
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GGAATTCTACGTCTTCCCGATAGAAATGCTGACCCAATGGAAAAAAAATTACATAAAAGGTAAACGTGGTTGTAAGGTATAA
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CTGCTCACCGTCGAATCTTTGTCATGAATTCTAGCTCGAAGCTTGATTCTAGGTCGTCTTCGTCGTCGATATGTCAAGTTCCGGGGCTAGAATCGGAGGAGATGGACAGG
ATTGCGGAACAAATGTTCCGGCGGTATGCGTCTCCTTCTTCTTCGAGTGTTAAGAGAGGAAAAGGAGTGGCCATTGTATGGTTCAGAAATGACCTCCGTGTGCTGGACAA
TGAGGCCCTGTATAAGGCCTGGATTTCGTCAGAGGCTGTGTTGCCGGTGTATTGCGTTGATCCGAGACTTTTTGGTTCTACCTGCTACTTTGGATTTCCTAAAACTGGAG
CATTGAGAGCTCAATTTATTGTTGAATGCTTGGCTGATTTGAAAAGGAATTTAATAAACCGAGGTCTTAACTTGCTTATTCAACATGGGAAGCCTGAAGAAATTCTCCCT
TCTCTTGCTAAAGCTCTTGGTGCCCACACAGTCTATGCTCAAATGGAAACTTGTAGTGAGGAACTATACGTTGAAAGAATGGTAAGCAAAGGACTCAAAACAGTGGTGCT
ATCACCAACCTCAGAGAAGTCTGCCAAGCCAAGCTCTGCTAAAAGCCTTACTTTGCAACTTGTTTGGGGCACCACGATGTACCACATAGATGACCTTCCATTTGATACCA
ACAGTTTGCCTGATGTCTACACTCAATTTCGTAAAGTACCGTATATTCTCTATATAGTTTTAGGTTCGTTATNCGACGACGGATTTCACCAATCTCGAATCGAACTGAGT
TCCTCTCACGGCGGATCCGAACGCGATCTCGCCTTGACCAATCTGCGTAACCTTAATGAAACCTTGCTGATTCCTGGCAGCGCCGCTTGCCTGAAACAGAGTGGTGAGAA
CGGTAGTATTATCGGAAGACAATCTAGCAAGCTTCTGAGCATCGTAATCCTTCTCAGGACGTCCAATGGCTTTCCAGATAGGCCAGAAACGGCGCCGTTGTCGAGGGCGA
GGATAGTGATGGTTTTACGGCTGTTAATGTCACCGGCGAGATTTGTTTGTGTGAGGACATCGTTCAAATTATTGAAATCGGGGAACTGGCTTAGGAGCTTAGTGATATTG
AAAGCGGAGGCTGCAGAGAAGAGGAGGAAACTCAAAAGCAGGGCGGCGGAAGTGGCTCTGGAATCCATTCGATCACAAGTAGTGAAGCAAATGGACGGGGTGAGAACTGA
GAAAGGAAGCAACAAGGATGATGCTCATATTGAAAGAAAAGCTGTGGATGGAAGGATTCTAGCCGGGGATGGTGTTGTAGCAGTCCACAGAGTTGATAGGGCATGTTTCG
TTTGCTCTTCTTCTTTGGACACGCGAGTTTTCCATAAAGTGTCTACGAGATTAGTTAATGACATCTTAAGTCTCGAGATGACACCTGATAAATGGGTTTCCAATGTTATA
AGTGTCATGGGTTTTCATGGTGTCGGTAAAGCCAGAAACACCGAGATCACAGCCATAACAGCCGCAGCTCCGATGAAGCTACCGCGTGAGGCGCCGGATTCATCGCTAGG
TGCTGGAGCAGCCGCATCATCATCACCGTCGGCTGCTTTCGGTGGAGACCTTGCCGGCGAATCGGCAACAACCTTCGGTTTTTTGGCGGGAGGAGCCCTAGCCTTTGACG
GAGTCTTAGCGGAAGGAGCCGGTGCCTTTTTAGGTGATCCGACGGGAGAAAACGACGACGGTGGTGGTGGTGTTGGAGAGGAGCGAGATATTGTACGGCTGTGCGACGAC
GGATTTCACCAATCTCGAATCGAACTGAGTTCCTCTCACGGCGGATCCGAACGCGATCTCACCTTGACCATTCTGCGTAACCTTGATGAAACCTTGCTGATTCCTGGCAG
CGCCGCTTGCCTGAAACAGAGTGGTGAGAACAGTAGTATTATCGGAAGACAATCTAGCAAGCTTCTGAGCATCGTAATCCTTCTCAGAACGTCCAACGGCTTTCCAGATA
GGCCAGAAACGGCGCTGTTGTCGAGGGCGAGGATAGTGATGGTTCTACGGCTGTTAATTTCACCGGCGAGATTTGTTTGTGTGAGGAAATCATTCAAACTATTGAAATCG
GGGAACTGGCTTAGGAGATTAGTGATATTGAAAGCGGAGGCTGCAGAGAAGAGGAGGAAACTCAAAATCAGGGCAGCGGAAATGGCTCTGGAATCCATTTATAAATTTTC
CTCTGTTCTTGGCTTCAAGCTAGAATGTTGTGCATTTAAACTGAAAAAGGGCGGGAATGTTGTGCATTTACCATTTTACCCCGTACATGAAAATCCGATTCAAACTGAAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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DDAHIERKAVDGRILAGDGVVAVHRVDRACFVCSSSLDTRVFHKVSTRLVNDILSLEMTPDKWVSNVISVMGFHGVGKARNTEITAITAAAPMKLPREAPDSSLGAGAAA
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QSGENSSIIGRQSSKLLSIVILLRTSNGFPDRPETALLSRARIVMVLRLLISPARFVCVRKSFKLLKSGNWLRRLVILKAEAAEKRRKLKIRAAEMALESIYKFSSVLGF
KLECCAFKLKKGGNVVHLPFYPVHENPIQTEKREGTMEFYVFPIEMLTQWKKNYIKGKRGCKV