; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh09G006080 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh09G006080
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUbiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1
Genome locationCma_Chr09:2858630..2861090
RNA-Seq ExpressionCmaCh09G006080
SyntenyCmaCh09G006080
Gene Ontology termsGO:1990592 - protein K69-linked ufmylation (biological process)
GO:0061657 - UFM1 conjugating enzyme activity (molecular function)
InterPro domainsIPR014806 - Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136240.1 ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1 [Cucumis sativus]3.5e-5195Show/hide
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XP_022142980.1 ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1 [Momordica charantia]1.3e-5094Show/hide
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XP_022937420.1 ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1-like [Cucurbita moschata]3.5e-5195Show/hide
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XP_023535437.1 ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.5e-5195Show/hide
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XP_038896748.1 ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1 [Benincasa hispida]1.3e-5094Show/hide
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A0A0A0LHR4 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 11.7e-5195Show/hide
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A0A1S3CRV9 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 11.7e-5195Show/hide
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A0A5D3E6S1 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 11.7e-5195Show/hide
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A0A6J1CMG1 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 16.4e-5194Show/hide
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A0A6J1FGK7 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 11.7e-5195Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2Z5S8 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 15.4e-4781Show/hide
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B3RTL9 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 11.5e-4176.53Show/hide
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        NK  DNDWFR+  +N EGTRW GKCWY+HNLLKY    EFDIPVTYP TAPE+ LPELDGKT KMYRGGKICLT HFKPLWA+N P+FGIAHA+ LGL
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Q178A5 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 14.4e-4173.74Show/hide
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Q8S625 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 15.4e-4781Show/hide
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Q9SXC8 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 13.3e-5288Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G27530.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like (InterPro:IPR016135), Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1 (InterPro:IPR014806); Has 269 Blast hits to 269 proteins in 110 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 175; Fungi - 0; Plants - 42; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 52 (source: NCBI BLink).2.3e-5388Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACAAGTCCAATGACAACGACTGGTTCAGGATATCGGCTGCGAATCCAGAGGGAACACGATGGATCGGAAAGTGCTGGTACATCCACAACCTTCTCAAGTACGAATT
CGATATTCCTGTCACGTATCCGTCCACCGCGCCAGAGCTCGAGCTCCCGGAGCTCGATGGAAAAACACAGAAGATGTATAGAGGCGGAAAGATCTGCTTAACCATTCATT
TCAAACCTCTCTGGGCGAAAAACTGTCCTAGGTTTGGAATAGCTCACGCTCTTTGTTTGGGACTTAGCACCATGGCTTGCTGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGACTTGTAAGATGTAATTCCGAAAATGCCCTCTCTATCAACTTCCAAGAGGCACAAGGTACCATTCCACCTTGGGAATCAGAACAACCAATCGACGGCCACGAGCCAT
AAAAGGGAGTTGCAGGAACCGACGTGTAAGATGAAAGTGTCGGTTGATTTAGGGATACACTCTCCATTGTGTATAGTCGTGTTCGTCTAACACGACGCAAGTCGGAATCT
CGGTTAGCGTTAGCAGAGAAGAAGTATGGAGGGTTGGGATCCGAATACCAAACCCAAATCCCTCTGCTAACGACGAAAGCCGGGCCCAGAGATGGTGCGCCATGGACGCA
GAGGCTGAAGGAGTACAAGGCATTGATCGCGTACACTCAGATGAACAAGTCCAATGACAACGACTGGTTCAGGATATCGGCTGCGAATCCAGAGGGAACACGATGGATCG
GAAAGTGCTGGTACATCCACAACCTTCTCAAGTACGAATTCGATATTCCTGTCACGTATCCGTCCACCGCGCCAGAGCTCGAGCTCCCGGAGCTCGATGGAAAAACACAG
AAGATGTATAGAGGCGGAAAGATCTGCTTAACCATTCATTTCAAACCTCTCTGGGCGAAAAACTGTCCTAGGTTTGGAATAGCTCACGCTCTTTGTTTGGGACTTAGCAC
CATGGCTTGCTGCTGATGTTCCAGTTCTAGTCGATTCTGGTATGATCAAGCACAAAGATAACACATCGACCAGTGAATCTTAGCAGAAGAATGGAGAAAGAAAAAAGGCC
TGTTTTAGGACACCACCAAAATGAGTTCAGCTAGCGTAGCTGCATACTTGGACGGGTGCAACCATGATGAATGCTGCTCCAAAACAGGCTGAGAATGTTGCCTGTGGCTC
GTTTACACCATCCTCGGTCCCAGCCACCTGATTTTGCAACAAGATTTAAGCTCAAAATGGCATAGCTAAGGCCTCATTTGACGATCCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNKSNDNDWFRISAANPEGTRWIGKCWYIHNLLKYEFDIPVTYPSTAPELELPELDGKTQKMYRGGKICLTIHFKPLWAKNCPRFGIAHALCLGLSTMACC