; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh09G007780 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh09G007780
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Descriptionprotein HAPLESS 2 isoform X1
Genome locationCma_Chr09:3759984..3762354
RNA-Seq ExpressionCmaCh09G007780
SyntenyCmaCh09G007780
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022976879.1 uncharacterized protein LOC111477113 isoform X1 [Cucurbita maxima]4.2e-7274.02Show/hide
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        VRSS
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XP_022976880.1 uncharacterized protein LOC111477113 isoform X2 [Cucurbita maxima]9.5e-3277Show/hide
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XP_023534929.1 uncharacterized protein LOC111796509 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.7e-3157.05Show/hide
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XP_023534930.1 uncharacterized protein LOC111796509 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.1e-2769.23Show/hide
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        LSYF
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XP_038897053.1 uncharacterized protein LOC120085227 isoform X1 [Benincasa hispida]1.1e-2439.17Show/hide
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        NVASSL SG    + K     L F L G + S                    SVCGST DF   IENFCV++LLKMGM+LILSYFV              
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                        LL LCLLHK+G+FG                                                    ESEEGK +HGSTSDSSNV
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        P+HVESR+SRR   RW RNHR  ++R SL P+ HGIRVRS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L1V0 Uncharacterized protein2.1e-2144.08Show/hide
Query:  NVASSLASGFSRPLAKHLDPHLIFSLEGPAGSLLFFIEYCYLILSLLAHVPISVCGSTRDF---IENFCVADLLKMGMILILSYFV-IRSKLAHKIKGNF
        NVASSLAS     + K     L F L G + S                    SVCGST DF   IENFCVA+LLKMGM+ ILSYFV +   L HKI G F
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Query:  --FGKGSKSSLDVLVTS--------DGLLLLCLL------------HKVGVFGESEEGKRRHGSTSDSSNVPKHVESRTSRRVSCRWMRNHRGFQVRTSL
           G+G    +   + S         G + + L               +    E EEGK RH STSDS+NV +HVES++SRRVS RW RNHR  Q R SL
Subjt:  --FGKGSKSSLDVLVTS--------DGLLLLCLL------------HKVGVFGESEEGKRRHGSTSDSSNVPKHVESRTSRRVSCRWMRNHRGFQVRTSL

Query:  WPKSHGIRVRS
         PK HG+RVRS
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A0A1S4DVV8 protein HAPLESS 2 isoform X19.0e-2042.65Show/hide
Query:  NVASSLASGFSRPLAKHLDPHLIFSLEGPAGSLLFFIEYCYLILSLLAHVPISVCGSTRDF---IENFCVADLLKMGMILILSYFV-IRSKLAHKIKGNF
        NVASSLAS     + K     L F L G + S                    SVCGST DF   IENFCVA+L+KMGM+ ILSYFV +   L HKI G F
Subjt:  NVASSLASGFSRPLAKHLDPHLIFSLEGPAGSLLFFIEYCYLILSLLAHVPISVCGSTRDF---IENFCVADLLKMGMILILSYFV-IRSKLAHKIKGNF

Query:  --FGKGSKSSLDVLVTSDGLL------LLCL--------------LHKVGVFGESEEGKRRHGSTSDSSNVPKHVESRTSRRVSCRWMRNHRGFQVRTSL
           G+G    +   + S           +C+                 +    ESEEGK +H STSDSSNV +HVESR+SR  S RW RNH+  Q R SL
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Query:  WPKSHGIRVRS
         PK HG+RVRS
Subjt:  WPKSHGIRVRS

A0A6J1DMF3 uncharacterized protein LOC1110213523.1e-2040.83Show/hide
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        +++ NVASS+ASGF   + K     L F L G + S                    SVCGST DF   IENFCVA+LLK+GM+LILS FVI    L HKI
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Query:  KGNFFGKGSKSSLDVLVTSDG---------LLLLCLLHKVGVFG----------------ESEEGKRRHGSTSDSSNVPKHVESRTSRRVSCRWMRNHRG
            FG   +    +  T               +C+  K+G                   ESE GK R+GS+SDSS+VP+ +E R+S+R S RW  NHRG
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Query:  FQVRTSLWPKSHGIRVRS
         Q+R +L PKS GIRVRS
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A0A6J1IKP7 uncharacterized protein LOC111477113 isoform X24.6e-3277Show/hide
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A0A6J1IPW7 uncharacterized protein LOC111477113 isoform X12.0e-7274.02Show/hide
Query:  MFSEIDYPITLWRANLICNVASSLASGFSRPLAKHLDPHLIFSLEGPAGSLLFFIEYCYLILSLLAHVPISVCGSTRDFIENFCVADLLKMGMILILSYF
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Subjt:  MFSEIDYPITLWRANLICNVASSLASGFSRPLAKHLDPHLIFSLEGPAGSLLFFIEYCYLILSLLAHVPISVCGSTRDFIENFCVADLLKMGMILILSYF

Query:  VIRSKLAHKIKGNFFGKGSKSSLDVLVTSDGLLLLCLLHKVGVFGESEEGKRRHGSTSDSSNVPKHVESRTSRRVSCRWMRNHRGFQVRTSLWPKSHGIR
                                      GLLLLCLLHKVGVFGESEEGKRRHGSTSDSSNVPKHVESRTSRRVSCRWMRNHRGFQVRTSLWPKSHGIR
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Query:  VRSS
        VRSS
Subjt:  VRSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCTCCGAAATCGATTATCCGATCACGCTCTGGCGTGCAAATCTCATCTGTAATGTAGCCAGCTCATTGGCCTCTGGTTTTTCTCGGCCATTGGCGAAGCATTTGGA
TCCTCACTTGATTTTCTCTCTGGAAGGACCTGCAGGTTCTTTGCTTTTCTTTATTGAATATTGTTACCTGATTTTGTCACTGCTCGCACATGTTCCCATTTCAGTTTGTG
GATCAACAAGGGATTTCATAGAAAATTTCTGCGTTGCCGATTTGCTAAAGATGGGCATGATCTTGATTCTTTCATACTTTGTTATCAGATCGAAGTTGGCTCACAAGATC
AAAGGAAACTTCTTCGGAAAGGGATCCAAATCCAGTTTAGATGTTTTAGTTACAAGTGATGGTCTTTTACTCCTATGTTTATTACATAAAGTTGGCGTCTTCGGCGAAAG
TGAAGAAGGAAAACGTCGGCATGGGTCAACAAGCGATTCGAGCAATGTCCCCAAACATGTCGAGTCGAGAACTAGCAGACGGGTGTCTTGTAGATGGATGAGGAACCACA
GAGGTTTTCAAGTTAGAACGTCATTGTGGCCAAAAAGTCATGGAATTCGCGTAAGGAGCAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGGTGGAAATGAGACACCCTCCGCCCTCCATTCTTCTTCCATCTGCTGTTCTTTAAGCATTCTAATCGATGTAACTGTTTCATTTTAAATTTCTCTCTTTCTGCGTATGT
TCTCCGAAATCGATTATCCGATCACGCTCTGGCGTGCAAATCTCATCTGTAATGTAGCCAGCTCATTGGCCTCTGGTTTTTCTCGGCCATTGGCGAAGCATTTGGATCCT
CACTTGATTTTCTCTCTGGAAGGACCTGCAGGTTCTTTGCTTTTCTTTATTGAATATTGTTACCTGATTTTGTCACTGCTCGCACATGTTCCCATTTCAGTTTGTGGATC
AACAAGGGATTTCATAGAAAATTTCTGCGTTGCCGATTTGCTAAAGATGGGCATGATCTTGATTCTTTCATACTTTGTTATCAGATCGAAGTTGGCTCACAAGATCAAAG
GAAACTTCTTCGGAAAGGGATCCAAATCCAGTTTAGATGTTTTAGTTACAAGTGATGGTCTTTTACTCCTATGTTTATTACATAAAGTTGGCGTCTTCGGCGAAAGTGAA
GAAGGAAAACGTCGGCATGGGTCAACAAGCGATTCGAGCAATGTCCCCAAACATGTCGAGTCGAGAACTAGCAGACGGGTGTCTTGTAGATGGATGAGGAACCACAGAGG
TTTTCAAGTTAGAACGTCATTGTGGCCAAAAAGTCATGGAATTCGCGTAAGGAGCAGTTGAGTGTTGGTCTATGGTAAGCACAGAAGAAAATCTGTTGAGGTTGGGACTC
ATTTGAATGAGATTCATAGCTTGGGGATGTCTGGATCATCCAAATTTGTGCATAGAGAAAGACAATATAGAAGAGGAAGGCAAAGATGTTAGCAGCTGGCTGGGATTTGT
TCAAGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFSEIDYPITLWRANLICNVASSLASGFSRPLAKHLDPHLIFSLEGPAGSLLFFIEYCYLILSLLAHVPISVCGSTRDFIENFCVADLLKMGMILILSYFVIRSKLAHKI
KGNFFGKGSKSSLDVLVTSDGLLLLCLLHKVGVFGESEEGKRRHGSTSDSSNVPKHVESRTSRRVSCRWMRNHRGFQVRTSLWPKSHGIRVRSS