; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh10G007100 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh10G007100
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionTranscription factor
Genome locationCma_Chr10:3195733..3197344
RNA-Seq ExpressionCmaCh10G007100
SyntenyCmaCh10G007100
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR001878 - Zinc finger, CCHC-type
IPR006447 - Myb domain, plants
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017884 - SANT domain
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6589987.1 Transcription factor MYBS3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.4e-16296.94Show/hide
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KAG7023651.1 Transcription factor MYBS3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-16096.05Show/hide
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XP_022987786.1 uncharacterized protein DDB_G0271670-like [Cucurbita maxima]2.7e-169100Show/hide
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XP_023515620.1 uncharacterized protein DDB_G0271670-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-16496.96Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BPK2 transcription factor MYB1R1-like isoform X21.5e-8074.61Show/hide
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        FDMVGTAY+TTTT ALSQCLKISSNSQ   + +  NI      KKEL L L+E+ +
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A0A1S3BR73 probable serine/threonine-protein kinase DDB_G0282963 isoform X17.2e-9665.75Show/hide
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        LI+S LKS                  +  SSSS    P LELTLA+P ASNLE EQ K P T S+
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A0A6J1D2T3 myb-like protein J2.6e-8561.33Show/hide
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        RI +D + +     NGYLSDGLL  +Q+RKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTT+TPTQVASHAQKY+LRQSTINKKNRRSSLFDMVG 
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                T   TTT   SQCLK+SSNSQ  S   +    ++L LPLL+   TT+F S+    + MEV+N              ASSSS +W+YGLI DS
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        QLK +S        CSS   SS A GPDLELTLAAP  ASNLE + +KK   GSLLV PI V
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A0A6J1H8A8 uncharacterized protein DDB_G0271670-like5.6e-16597.55Show/hide
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A0A6J1JFB4 uncharacterized protein DDB_G0271670-like1.3e-169100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BI93 Transcription factor MYBS22.2e-2570.13Show/hide
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Q7XC51 Transcription factor MYBS22.2e-2570.13Show/hide
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        QERKKGVPWTEEEH+ FL GL +LG+GDWRGIS+N+VT++T TQVASHAQKY+LRQ+   KK RR+SLFD+V    D
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Q7XC57 Transcription factor MYBS32.4e-3246.11Show/hide
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        M R+CSHC + GHNSRTC N               +++FGV L   S   S+S  + S                    LSS++ S+S   S    D    
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           +A+GY SD  + G     ++RKKGVPWTEEEHR FL+GL+KLG+GDWRGISRN+V ++TPTQVASHAQKY++RQS + ++ RRSSLFDMV
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Q9FKF9 Probable transcription factor At5g616204.0e-2740.31Show/hide
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        + + CSHCG+ GHN+RTC N          V    ++LFGV++ S        +              A++KS S    D L ++  S+        +D 
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                 GY SDG ++  +     E+KKG PWTEEEHR FLIGL KLG+GDWRGI++++V+T+TPTQVASHAQKY++R +  +K+ RR+SLFD+
Subjt:  NLEPSKSANGYLSDGLLNGDQ-----ERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQSTINKKNRRSSLFDM

Q9LVS0 Transcription factor KUA19.3e-3246.35Show/hide
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        M R+CSHC + GHNSRTC N               ++LFGV L   S   S+S  + S  + S +                + S++  S   +  DH   
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Query:  PSKSANGYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQSTINKKNRRSSLFDMV
           + +GY S+  + G    +ERKKG PWTEEEHR+FL+GL+KLG+GDWRGISRNYVTT+TPTQVASHAQKY++RQS ++++ RRSSLFDMV
Subjt:  PSKSANGYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQSTINKKNRRSSLFDMV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70000.1 myb-like transcription factor family protein2.5e-3235.25Show/hide
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        M R CS CGN GHNSRTC     +   N + G G   I LFGV +  +SSS                            C   S S ++ S    Q D  
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Query:  LEPSKSAN-GYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQSTINKKNRRSSLFDMVGTAYD
         +P+ + + GY SD +++    ++ERK+G PWTEEEHR+FL GL K+G+GDWRGISRN+V T+TPTQVASHAQKY+LR++  N++ RRSSLFD+   ++ 
Subjt:  LEPSKSAN-GYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQSTINKKNRRSSLFDMVGTAYD

Query:  TTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPL----------LESKITTTFASSQQLASSMEVMNNNNQASSSSS
                   I S+ + +  +  + + + + +P+          L      T A+++    S+ +   ++  SSSS+
Subjt:  TTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPL----------LESKITTTFASSQQLASSMEVMNNNNQASSSSS

AT1G70000.2 myb-like transcription factor family protein2.5e-3235.25Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSG--LIRLFGVHLDSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSFSTSRIQLDHN
        M R CS CGN GHNSRTC     +   N + G G   I LFGV +  +SSS                            C   S S ++ S    Q D  
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Query:  LEPSKSAN-GYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQSTINKKNRRSSLFDMVGTAYD
         +P+ + + GY SD +++    ++ERK+G PWTEEEHR+FL GL K+G+GDWRGISRN+V T+TPTQVASHAQKY+LR++  N++ RRSSLFD+   ++ 
Subjt:  LEPSKSAN-GYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQSTINKKNRRSSLFDMVGTAYD

Query:  TTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPL----------LESKITTTFASSQQLASSMEVMNNNNQASSSSS
                   I S+ + +  +  + + + + +P+          L      T A+++    S+ +   ++  SSSS+
Subjt:  TTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPL----------LESKITTTFASSQQLASSMEVMNNNNQASSSSS

AT3G16350.1 Homeodomain-like superfamily protein1.0e-3341.26Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSG-----------LIRLFGVHL-DSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSF
        M R+CSHC N GHNSRTC             G G            ++LFGV L D S    S+S  + S  + ++AAA   + S S+   +S+ + S  
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSG-----------LIRLFGVHL-DSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSF

Query:  S--TSRIQLDHNLEPSKSANGYLSDGLLNGD------QERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQSTINKKN
        S       L HN        GYLSD   +G        ERK+GVPWTEEEHR+FL+GL+KLG+GDWRGISRNYVT++TPTQVASHAQKY++R ++ +++ 
Subjt:  S--TSRIQLDHNLEPSKSANGYLSDGLLNGD------QERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQSTINKKN

Query:  RRSSLFDMV--GTAYDTTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPLLESKITTTFASSQQLASS
        RRSSLFDMV      D++ T   Q L  SS S+    K+         LP LE  +  T  + + +A++
Subjt:  RRSSLFDMV--GTAYDTTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPLLESKITTTFASSQQLASS

AT5G47390.1 myb-like transcription factor family protein6.6e-3346.35Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSGLIRLFGVHLDSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSFSTSRIQLDHNLE
        M R+CSHC + GHNSRTC N               ++LFGV L   S   S+S  + S  + S +                + S++  S   +  DH   
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSGLIRLFGVHLDSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSFSTSRIQLDHNLE

Query:  PSKSANGYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQSTINKKNRRSSLFDMV
           + +GY S+  + G    +ERKKG PWTEEEHR+FL+GL+KLG+GDWRGISRNYVTT+TPTQVASHAQKY++RQS ++++ RRSSLFDMV
Subjt:  PSKSANGYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQSTINKKNRRSSLFDMV

AT5G56840.1 myb-like transcription factor family protein4.7e-4743.33Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSGLIRLFGVHLDSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSFSTSRIQLDHNLE
        MGR+CSHCGN+GHNSRTC++++  +          +RLFGVHLD       ++SSS       S  A AIKKSFS DCL + SSSSS             
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSGLIRLFGVHLDSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSFSTSRIQLDHNLE

Query:  PSKSANGYLSDGLLNGDQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQ-STINKKNRRSSLFDMVGTAYDTTTTA
           S  GYLSDGL +   +RKKGVPWT EEHR FLIGLEKLG+GDWRGISRN+V TK+PTQVASHAQKY+LRQ +T++ K RR+SLFDMV          
Subjt:  PSKSANGYLSDGLLNGDQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQ-STINKKNRRSSLFDMVGTAYDTTTTA

Query:  LSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPLLESKITTTFASSQQLASSMEVMNNNNQASSSSSIWLYGLIDSQLKSASQTMICSSSSGAGGPDLELTLAA
              +  NS T                                    + + N++  SSS  +W  GL++ +L      +  S S  +GG DLEL LA+
Subjt:  LSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPLLESKITTTFASSQQLASSMEVMNNNNQASSSSSIWLYGLIDSQLKSASQTMICSSSSGAGGPDLELTLAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCAGGAAATGCTCACATTGTGGCAACATAGGTCACAATTCAAGGACTTGCACCAACTTTAGACCCTCAATCACACCCAATTTCAACGTTGGAAGCGGCTTAATTAG
GCTCTTTGGAGTTCATCTTGATTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTACTACTTCTTCTTCAAGTGCTGCTGCTTTCGCCATTAAGAAAAGCT
TTAGCACCGATTGCTTGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCTTTCTCTACTTCTCGAATTCAACTCGATCATAATCTTGAACCTTCCAAGTCTGCCAATGGCTACCTCTCT
GATGGCCTTCTGAATGGAGACCAAGAAAGGAAGAAAGGGGTTCCATGGACAGAAGAGGAGCACAGAATATTCCTAATTGGGCTTGAAAAGCTTGGAAGAGGAGATTGGAG
AGGCATCTCGAGAAACTACGTTACCACGAAAACTCCGACCCAAGTGGCTAGTCATGCTCAAAAGTATTATCTTAGACAATCGACCATCAACAAAAAGAACCGTCGCTCGA
GCCTCTTTGACATGGTTGGGACAGCATATGATACAACAACCACAGCACTGTCTCAATGTTTGAAGATATCTTCAAATTCTCAAACTCATAGCAATAAGAATGAGATGAAT
ATCAAGAAGGAGCTGAATTTGCCTCTTTTAGAGAGTAAAATCACCACTACTTTTGCAAGCTCCCAACAATTGGCTTCTTCCATGGAAGTGATGAACAACAATAATCAAGC
TTCTTCTTCTTCATCAATTTGGCTTTATGGGTTGATTGATTCACAACTCAAATCAGCTTCTCAAACGATGATTTGTTCTTCATCTTCTGGAGCAGGTGGGCCAGATCTTG
AGCTCACTTTGGCAGCCCCAAGAGCTTCCAATTTGGAGTACGAACAAACCAAAAAGCCATCAACTGGTTCCCTCCTTGTTGACCCAATTAGGGTTCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GCTCTTTGGAGTTCATCTTGATTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTACTACTTCTTCTTCAAGTGCTGCTGCTTTCGCCATTAAGAAAAGCT
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AGTGACAAATTTATATATATGTTATTCGTCTTAATTTGTTTAGCTATAGCTCTCGAGAAGAAGCGCAAAGGTTGTAAAATGGCTCTTTAATGTCTTAATCCGTTAGCTAT
GCTCGAGAAGAAGCACAAAGTTCATAAAATGGTTCTTTAATGTTTTAATCCGTTTAGCTATGCTCGAAAAGAAGCACAAAGTTTGTAAAATGGCTCTTTAATGTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSGLIRLFGVHLDSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSFSTSRIQLDHNLEPSKSANGYLS
DGLLNGDQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYYLRQSTINKKNRRSSLFDMVGTAYDTTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEMN
IKKELNLPLLESKITTTFASSQQLASSMEVMNNNNQASSSSSIWLYGLIDSQLKSASQTMICSSSSGAGGPDLELTLAAPRASNLEYEQTKKPSTGSLLVDPIRVP