; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh10G010780 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh10G010780
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionGlycoprotein membrane precursor GPI-anchored
Genome locationCma_Chr10:6953418..6955493
RNA-Seq ExpressionCmaCh10G010780
SyntenyCmaCh10G010780
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6590391.1 putative GPI-anchored protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.7e-9291.75Show/hide
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KAG7023953.1 putative GPI-anchored protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-9292.27Show/hide
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XP_022961524.1 uncharacterized GPI-anchored protein At5g19250-like isoform X1 [Cucurbita moschata]2.0e-9292.27Show/hide
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XP_022968795.1 uncharacterized GPI-anchored protein At3g06035-like [Cucurbita maxima]1.4e-101100Show/hide
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XP_023516540.1 uncharacterized GPI-anchored protein At5g19250-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-9191.24Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BQD0 uncharacterized GPI-anchored protein At5g19250-like3.0e-6568.37Show/hide
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        R+F L FF VI+ FLL PN VLCDV+D  IL+AIN YRQ K+LS F+YNKNAACLA + VYKLRDEPCSS ++FNKEI+SE  LADF KLL+KCHIAYNS
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        ++DGI+LP+CVP LDP SV++NYT S D +YIN +N+TGAGVGT +D W+VLILSTNTSTGN+ + GSSSLVVA GG +G+M   LG+FV  LL F
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A0A5D3CFH2 Putative GPI-anchored protein3.0e-6568.37Show/hide
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        R+F L FF VI+ FLL PN VLCDV+D  IL+AIN YRQ K+LS F+YNKNAACLA + VYKLRDEPCSS ++FNKEI+SE  LADF KLL+KCHIAYNS
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        ++DGI+LP+CVP LDP SV++NYT S D +YIN +N+TGAGVGT +D W+VLILSTNTSTGN+ + GSSSLVVA GG +G+M   LG+FV  LL F
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A0A6J1HCG9 uncharacterized GPI-anchored protein At3g06035-like isoform X21.9e-7580.93Show/hide
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        MRVFAL FFAVIATFLLLPNAVLCD                            ACLASRFVYKLRDEPCSSPDDF+KEINSENTLADF KLLKKCHIAYN
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A0A6J1HEB1 uncharacterized GPI-anchored protein At5g19250-like isoform X19.9e-9392.27Show/hide
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        MRVFAL FFAVIATFLLLPNAVLCDV+D EILNAINNYRQ K LSN T+NKNAACLASRFVYKLRDEPCSSPDDF+KEINSENTLADF KLLKKCHIAYN
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A0A6J1HY77 uncharacterized GPI-anchored protein At3g06035-like6.8e-102100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P59833 Uncharacterized GPI-anchored protein At5g192503.3e-2133.87Show/hide
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        +++ FL L   VL D  D E  +L  IN+YR   +L+   +N NA CLA     + +++PC++         +     +   LL KC +    T DG +L
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        PACVP+LDP  V  N+T S+    +N   FTG G+G+ D+WIV++L+T+T  G+++   +S       G  G+++  L +F+L  F
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Q84MC0 Uncharacterized GPI-anchored protein At3g060352.1e-2336.36Show/hide
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        ++  L L   VL D  + +I L  IN+YR  ++L+  + N+NA CLA     + +++PC++         +E   A++ ++L KCH+  + T DG ++PA
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        CVP L+   V  N+TKS+    +N   FTG G+G  DDWIV++L+TNT  G+++
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Q84VZ5 Uncharacterized GPI-anchored protein At5g192407.7e-1834.91Show/hide
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        L   +++ FL L   VL +     +L    N YR+  +L+N   NKNA CLA   V +L+++PC++         ++  + +F  LL KC +  N T DG
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Query:  IMLPACVP--HLDPE--SVSNNYTKSRDVDYINSKNFTGAGVGTSDD--WIVLILSTNTSTGNFANGGS
        ++L  C P  H  P+  S +N  TK+     +N   FTGAGVG   D  W+V +L+TNT  G+++N G+
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Q8GUL8 Uncharacterized GPI-anchored protein At5g192302.8e-1230.32Show/hide
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        +++ FL L   VL   D  D  +L   N YR   +L   T N+NA CLA   V +L+++PC++         + +     + LL KC +      DG+++
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Query:  PACVPHLDPESVSNNYTKSRDVDYINSKNFTGAGVGTSDDWIVLILSTNTSTGNFANGGSSSLVVARGG--CIGIMAGFLGLFVLLLF
          C P  D     +N+  S  +  +N    TG G+G+ D W+V+IL+TNT       GG S L     G    G+       F+ LLF
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G54860.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored1.7e-2031.11Show/hide
Query:  FLLLPNAVLCDVRDIEILNAINNYRQKKSLSNFTYNKNAACLASRFVYKLRDEPCSSPDDFNKEI--NSENTLADFHKLLKKCHIAYNSTVDGIMLPACV
        F L+   V+ +  +  +L  +N+YR  + +  F  N+ A C+A     KL D+PC++    +     +    L ++  +L +C I  N+T DG++LP C+
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Query:  PHLDPESVSNNYTKSRDVDYINSKNFTGAGVGTSDDWIVLILSTNTSTGNFANGGSSSLVVARGGCIGIMAGFLGLFVLL
        P+  P     NYT++    Y+N   + GAGVG+  +W+V++L+T+T  G+F  G    +   +   + +MAG LGL  LL
Subjt:  PHLDPESVSNNYTKSRDVDYINSKNFTGAGVGTSDDWIVLILSTNTSTGNFANGGSSSLVVARGGCIGIMAGFLGLFVLL

AT3G06035.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored1.5e-2436.36Show/hide
Query:  IATFLLLPNAVLCDVRDIEI-LNAINNYRQKKSLSNFTYNKNAACLASRFVYKLRDEPCSSPDDFNKEINSENTLADFHKLLKKCHIAYNSTVDGIMLPA
        ++  L L   VL D  + +I L  IN+YR  ++L+  + N+NA CLA     + +++PC++         +E   A++ ++L KCH+  + T DG ++PA
Subjt:  IATFLLLPNAVLCDVRDIEI-LNAINNYRQKKSLSNFTYNKNAACLASRFVYKLRDEPCSSPDDFNKEINSENTLADFHKLLKKCHIAYNSTVDGIMLPA

Query:  CVPHLDPESVSNNYTKSRDVDYINSKNFTGAGVGTSDDWIVLILSTNTSTGNFA
        CVP L+   V  N+TKS+    +N   FTG G+G  DDWIV++L+TNT  G+++
Subjt:  CVPHLDPESVSNNYTKSRDVDYINSKNFTGAGVGTSDDWIVLILSTNTSTGNFA

AT5G19230.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored2.0e-1330.32Show/hide
Query:  VIATFLLLPNAVL--CDVRDIEILNAINNYRQKKSLSNFTYNKNAACLASRFVYKLRDEPCSSPDDFNKEINSENTLADFHKLLKKCHIAYNSTVDGIML
        +++ FL L   VL   D  D  +L   N YR   +L   T N+NA CLA   V +L+++PC++         + +     + LL KC +      DG+++
Subjt:  VIATFLLLPNAVL--CDVRDIEILNAINNYRQKKSLSNFTYNKNAACLASRFVYKLRDEPCSSPDDFNKEINSENTLADFHKLLKKCHIAYNSTVDGIML

Query:  PACVPHLDPESVSNNYTKSRDVDYINSKNFTGAGVGTSDDWIVLILSTNTSTGNFANGGSSSLVVARGG--CIGIMAGFLGLFVLLLF
          C P  D     +N+  S  +  +N    TG G+G+ D W+V+IL+TNT       GG S L     G    G+       F+ LLF
Subjt:  PACVPHLDPESVSNNYTKSRDVDYINSKNFTGAGVGTSDDWIVLILSTNTSTGNFANGGSSSLVVARGG--CIGIMAGFLGLFVLLLF

AT5G19240.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored5.5e-1934.91Show/hide
Query:  LFFAVIATFLLLPNAVLCDVRDIEIL-NAINNYRQKKSLSNFTYNKNAACLASRFVYKLRDEPCSSPDDFNKEINSENTLADFHKLLKKCHIAYNSTVDG
        L   +++ FL L   VL +     +L    N YR+  +L+N   NKNA CLA   V +L+++PC++         ++  + +F  LL KC +  N T DG
Subjt:  LFFAVIATFLLLPNAVLCDVRDIEIL-NAINNYRQKKSLSNFTYNKNAACLASRFVYKLRDEPCSSPDDFNKEINSENTLADFHKLLKKCHIAYNSTVDG

Query:  IMLPACVP--HLDPE--SVSNNYTKSRDVDYINSKNFTGAGVGTSDD--WIVLILSTNTSTGNFANGGS
        ++L  C P  H  P+  S +N  TK+     +N   FTGAGVG   D  W+V +L+TNT  G+++N G+
Subjt:  IMLPACVP--HLDPE--SVSNNYTKSRDVDYINSKNFTGAGVGTSDD--WIVLILSTNTSTGNFANGGS

AT5G19250.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored2.4e-2233.87Show/hide
Query:  VIATFLLLPNAVLCDVRDIE--ILNAINNYRQKKSLSNFTYNKNAACLASRFVYKLRDEPCSSPDDFNKEINSENTLADFHKLLKKCHIAYNSTVDGIML
        +++ FL L   VL D  D E  +L  IN+YR   +L+   +N NA CLA     + +++PC++         +     +   LL KC +    T DG +L
Subjt:  VIATFLLLPNAVLCDVRDIE--ILNAINNYRQKKSLSNFTYNKNAACLASRFVYKLRDEPCSSPDDFNKEINSENTLADFHKLLKKCHIAYNSTVDGIML

Query:  PACVPHLDPESVSNNYTKSRDVDYINSKNFTGAGVGTSDDWIVLILSTNTSTGNFANGGSSSLVVARGGCIGIMAGFLGLFVLLLF
        PACVP+LDP  V  N+T S+    +N   FTG G+G+ D+WIV++L+T+T  G+++   +S       G  G+++  L +F+L  F
Subjt:  PACVPHLDPESVSNNYTKSRDVDYINSKNFTGAGVGTSDDWIVLILSTNTSTGNFANGGSSSLVVARGGCIGIMAGFLGLFVLLLF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAGTGTTTGCTTTGTTCTTTGCTGTCATCGCCACCTTCCTCCTTCTGCCCAATGCTGTTCTTTGTGATGTGAGAGATATAGAGATTCTAAACGCCATCAAC
AATTACAGACAAAAAAAGAGCCTATCTAATTTTACTTATAACAAAAATGCAGCATGTTTAGCAAGCAGGTTCGTTTATAAGCTAAGAGATGAGCCTTGTTCAAGT
CCAGATGATTTCAACAAAGAAATCAACTCTGAAAATACCCTTGCAGATTTTCACAAGCTCTTGAAAAAGTGTCACATAGCCTACAACTCGACCGTTGATGGCATC
ATGCTCCCCGCTTGCGTCCCCCACCTCGATCCCGAGTCCGTCTCCAATAACTATACCAAATCCCGTGACGTCGATTATATTAATAGTAAGAACTTTACGGGCGCT
GGGGTCGGGACGTCTGACGATTGGATTGTCCTCATTCTTAGCACCAATACATCGACGGGGAACTTTGCTAACGGTGGATCTTCGTCTTTGGTTGTCGCCCGGGGT
GGTTGCATTGGTATCATGGCTGGTTTCTTAGGGTTGTTTGTTCTTTTGTTATTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTTATTGCTTTGGGTTCGCAGTTTATTTGTGAATTGTTTCCCACAAATATGAGAGTGTTTGCTTTGTTCTTTGCTGTCATCGCCACCTTCCTCCTTCTGCCCA
ATGCTGTTCTTTGTGATGTGAGAGATATAGAGATTCTAAACGCCATCAACAATTACAGACAAAAAAAGAGCCTATCTAATTTTACTTATAACAAAAATGCAGCAT
GTTTAGCAAGCAGGTTCGTTTATAAGCTAAGAGATGAGCCTTGTTCAAGTCCAGATGATTTCAACAAAGAAATCAACTCTGAAAATACCCTTGCAGATTTTCACA
AGCTCTTGAAAAAGTGTCACATAGCCTACAACTCGACCGTTGATGGCATCATGCTCCCCGCTTGCGTCCCCCACCTCGATCCCGAGTCCGTCTCCAATAACTATA
CCAAATCCCGTGACGTCGATTATATTAATAGTAAGAACTTTACGGGCGCTGGGGTCGGGACGTCTGACGATTGGATTGTCCTCATTCTTAGCACCAATACATCGA
CGGGGAACTTTGCTAACGGTGGATCTTCGTCTTTGGTTGTCGCCCGGGGTGGTTGCATTGGTATCATGGCTGGTTTCTTAGGGTTGTTTGTTCTTTTGTTATTTT
GATGAGGTGAGGGAAAAGGCTTTTGGGTCTGGGTTTAAAGCATTGTATTTAATTTGTTCATGCTCAAATGTTGATATTTATCGTCTATCATAAAAGATTAATAGA
GGTGTACACAGGTCGAGTTAACTGAATTGGTAACCTAAATAACACAATTGTTTTACAACTCGAATTTAATTAACCCTGTACTATCGGGTTGAATGAATTAGGTTG
TT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRVFALFFAVIATFLLLPNAVLCDVRDIEILNAINNYRQKKSLSNFTYNKNAACLASRFVYKLRDEPCSSPDDFNKEINSENTLADFHKLLKKCHIAYNSTVDGI
MLPACVPHLDPESVSNNYTKSRDVDYINSKNFTGAGVGTSDDWIVLILSTNTSTGNFANGGSSSLVVARGGCIGIMAGFLGLFVLLLF