; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh11G010680 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh11G010680
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCma_Chr11:5857604..5860764
RNA-Seq ExpressionCmaCh11G010680
SyntenyCmaCh11G010680
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588411.1 hypothetical protein SDJN03_16976, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.1e-4962.16Show/hide
Query:  TKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLNQMKLPAFLRHFRLL------------------------------Q
        T+L+  +  + WALGPLTKLDPVLG R WALGPLTK+DPVLG R WALGPLTK NQMKLPAF+RHFRLL                              Q
Subjt:  TKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLNQMKLPAFLRHFRLL------------------------------Q

Query:  IKIRLPYPLAIASLLGPFVRSVNLEEIELVHLLFHCGTLSLCFLSFVQSSDEIVMDLIVLDIYLSEELATDLNERWSLSFDVKVK
        IKIRLPYPLAIASLLGPFVRSVNLEEIELVHLLFHC                  +D+ VLDIY SEELATDLNERWSLSFD K K
Subjt:  IKIRLPYPLAIASLLGPFVRSVNLEEIELVHLLFHCGTLSLCFLSFVQSSDEIVMDLIVLDIYLSEELATDLNERWSLSFDVKVK

KAG7022254.1 hypothetical protein SDJN02_15985, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.3e-2552.57Show/hide
Query:  LDPVLGFRFWALGPLTKLD-----PVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLNQMKLPAFLRHFRLLQIKIRLPYPLA
        LD VLGFR     P+ ++      P LGFR       +   P LGFR     P+ + +        A  P + L+   +  F +  +  QIKIRLPYPLA
Subjt:  LDPVLGFRFWALGPLTKLD-----PVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLNQMKLPAFLRHFRLLQIKIRLPYPLA

Query:  IASLLGPFVRSVNLEEIELVHLLFHCGTLSLCFLSFVQSSDEIVMDLIVLDIYLSEELATDLNERWSLSFDVKVK
        IASLLGPFVRSVNLEEIELVHLLFHCGT          SSDEIVMDLIV     SEELATDLNERWSLSFD K K
Subjt:  IASLLGPFVRSVNLEEIELVHLLFHCGTLSLCFLSFVQSSDEIVMDLIVLDIYLSEELATDLNERWSLSFDVKVK

XP_042174355.1 uncharacterized protein LOC112238147 isoform X23 [Oncorhynchus tshawytscha]7.4e-0625.97Show/hide
Query:  LTTPSVHLRFDGTEPPNLDTVLGFRFWTLRPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTK-----------LDPVLGFRFWALGPLTKLDPV
        LT  +  +R+       L   + +R+     LT+L+  + +R+   G LT+L   + +R+   G LT+           L   + +R+   G LT+L   
Subjt:  LTTPSVHLRFDGTEPPNLDTVLGFRFWTLRPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTK-----------LDPVLGFRFWALGPLTKLDPV

Query:  LGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTK
        + +R+   G LT+L   + +R+   G LT+L   + +R+   G LT+L   + +R+   G LT+L   + +R+   G LT+
Subjt:  LGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTK

XP_042174361.1 uncharacterized protein LOC112238147 isoform X29 [Oncorhynchus tshawytscha]1.1e-0628.29Show/hide
Query:  LGFRFWTLRPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLD
        + +R+     LT+L   + +R+   G LT+    + +R+   G LT+L+  + +R+   G LT+L   + +R+   G LT+L   + +R+   G LT+L 
Subjt:  LGFRFWTLRPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLD

Query:  PVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLNQ
          + +R+   G LT+L   + +R+   G LT+L   + +R+   G LT+L +
Subjt:  PVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLNQ

XP_042174367.1 uncharacterized protein LOC112238147 isoform X35 [Oncorhynchus tshawytscha]3.3e-0626.99Show/hide
Query:  LGFRFWTLRPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTK-----------LDPVLGFR
        + +R+     LT+L   + +R+   G LT+L   + +R+   G LT+L+  + +R+   G LT+L   + +R+   G LT+           L   + +R
Subjt:  LGFRFWTLRPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTK-----------LDPVLGFR

Query:  FWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLNQ
        +   G LT+L   + +R+   G LT+L   + +R+   G LT+L   + +R+   G LT+L +
Subjt:  FWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLNQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
No hits found
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTAACAACGCCGTCTGTTCATTTACGGTTCGACGGAACTGAACCGCCGAATTTGGATACAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGACTTTACGCCCATTGACGAAG
CTGGATCCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACAAAGCTGGATCCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTG
GATCCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTGGATCCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTGGAT
CCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTGGATCCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTGGATCCA
GTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTGGATCCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTGAATCAAATG
AAGCTACCAGCATTTCTGCGCCACTTCCGTCTTCTTCAGATCAAGATTCGCCTTCCATATCCACTTGCCATTGCATCTCTGTTAGGTCCTTTTGTTCGTTCTGTT
AATTTGGAGGAGATTGAGCTGGTTCATCTTCTGTTTCATTGCGGTACGCTGAGCTTGTGTTTTTTGTCGTTTGTTCAGAGCTCTGATGAAATTGTTATGGACTTG
ATAGTGTTGGACATTTATCTCTCTGAAGAACTTGCTACAGACTTGAATGAGCGATGGTCATTATCTTTTGATGTTAAAGTAAAATGCTGCTTTGGAATATGTCCT
CAAAATTACTTCTGCGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTAACAACGCCGTCTGTTCATTTACGGTTCGACGGAACTGAACCGCCGAATTTGGATACAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGACTTTACGCCCATTGACGAAG
CTGGATCCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACAAAGCTGGATCCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTG
GATCCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTGGATCCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTGGAT
CCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTGGATCCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTGGATCCA
GTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTGGATCCAGTGTTGGGCTTCCGGTTTTGGGCTTTAGGCCCATTGACGAAGCTGAATCAAATG
AAGCTACCAGCATTTCTGCGCCACTTCCGTCTTCTTCAGATCAAGATTCGCCTTCCATATCCACTTGCCATTGCATCTCTGTTAGGTCCTTTTGTTCGTTCTGTT
AATTTGGAGGAGATTGAGCTGGTTCATCTTCTGTTTCATTGCGGTACGCTGAGCTTGTGTTTTTTGTCGTTTGTTCAGAGCTCTGATGAAATTGTTATGGACTTG
ATAGTGTTGGACATTTATCTCTCTGAAGAACTTGCTACAGACTTGAATGAGCGATGGTCATTATCTTTTGATGTTAAAGTAAAATGCTGCTTTGGAATATGTCCT
CAAAATTACTTCTGCGGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLTTPSVHLRFDGTEPPNLDTVLGFRFWTLRPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLD
PVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLDPVLGFRFWALGPLTKLNQMKLPAFLRHFRLLQIKIRLPYPLAIASLLGPFVRSV
NLEEIELVHLLFHCGTLSLCFLSFVQSSDEIVMDLIVLDIYLSEELATDLNERWSLSFDVKVKCCFGICPQNYFCG