; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh11G017570 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh11G017570
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionB3 domain-containing protein At3g19184-like
Genome locationCma_Chr11:11718981..11720320
RNA-Seq ExpressionCmaCh11G017570
SyntenyCmaCh11G017570
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003340 - B3 DNA binding domain
IPR015300 - DNA-binding pseudobarrel domain superfamily
IPR044837 - B3 domain-containing protein REM16-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588654.1 B3 domain-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.2e-11899.54Show/hide
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KAG7013280.1 B3 domain-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.4e-118100Show/hide
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XP_022927676.1 B3 domain-containing protein At3g19184-like [Cucurbita moschata]3.2e-11899.54Show/hide
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XP_022988869.1 B3 domain-containing protein At3g19184-like isoform X1 [Cucurbita maxima]1.4e-118100Show/hide
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XP_023530120.1 B3 domain-containing protein At3g19184 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-11698.61Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3C624 B3 domain-containing protein2.6e-10287.96Show/hide
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A0A6J1EIB3 B3 domain-containing protein At3g19184-like1.5e-11899.54Show/hide
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A0A6J1GMN4 B3 domain-containing protein At3g19184-like isoform X11.2e-10290.28Show/hide
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A0A6J1JKT3 B3 domain-containing protein At3g19184-like isoform X21.2e-11598.61Show/hide
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A0A6J1JMT2 B3 domain-containing protein At3g19184-like isoform X16.9e-119100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10QS9 B3 domain-containing protein Os03g01845003.5e-4347.71Show/hide
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Q1G3M3 B3 domain-containing protein At3g191842.0e-6765.16Show/hide
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Q5KQI4 B3 domain-containing protein Os05g04814001.2e-4045.12Show/hide
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        D+LVF L +P  FK+
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Q69V36 B3 domain-containing protein Os06g01944002.7e-5152.09Show/hide
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        +YEE RR+++E NK+++EEL L+ L+ A++ S+ K SP KQ KR  +  P       +RRS R A+ P  P Y++   E     +  RR+Y  +RRDL N
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        D LVF L + T+FKV
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Q9FMZ4 B3 domain-containing protein At5g427002.5e-4952.31Show/hide
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        +VE    YEE R +R+EENKKRME LNL KL+  L S+S K SP K+   PR P               +K   + K V I+        R   ++RDLL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26680.1 transcriptional factor B3 family protein9.6e-0431.18Show/hide
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        P F +P+L    T    L +PV F  +H+     +++ VTL  +  ++    +L +  G  L+ GW  FA  H L  GD +VF L     F V
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AT3G19184.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.4e-6865.16Show/hide
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AT5G42700.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.8e-5052.31Show/hide
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        GD LVF L + T FKV
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AT5G58280.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein6.6e-2937.05Show/hide
Query:  LTYEECRRQRLEENKKRMEELNLNKLADALKSSSPKSSPTKQL--KRPRQPHD---ISSFSVRRSSRFADKPPPNYKEVPIEPLPGNRSYRR--------
        + YEE R+ RL+EN KR +             S+  + P  QL  +R  +P D   +++   RRSSR       +Y++  +       + RR        
Subjt:  LTYEECRRQRLEENKKRMEELNLNKLADALKSSSPKSSPTKQL--KRPRQPHD---ISSFSVRRSSRFADKPPPNYKEVPIEPLPGNRSYRR--------

Query:  TYQRRDLLNRVYASHEERQYAIDRARDLQSSLDSRYPSFVKPMLQSHVTGGFWLGLPVQFCKQHLPREDEMVTLLDEDGNEFQTKYLAEKTGLSGGWRGF
        TY  R L    +AS+EE+  A   A   Q SL S +P FVK M++SHV   FWLGLP +FC  + P E   + L DE+G  ++  Y+  + GLSGGW+ F
Subjt:  TYQRRDLLNRVYASHEERQYAIDRARDLQSSLDSRYPSFVKPMLQSHVTGGFWLGLPVQFCKQHLPREDEMVTLLDEDGNEFQTKYLAEKTGLSGGWRGF

Query:  AIDHQLVDGDALVFHLTKPTEFKV
        A+DH+L DGDAL+F L +P +FK+
Subjt:  AIDHQLVDGDALVFHLTKPTEFKV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGGAATCGAACCTGACTTACGAGGAATGCCGACGCCAGAGGTTGGAGGAGAATAAGAAGAGGATGGAAGAGCTTAATCTCAACAAGCTTGCCGATGCTCTGAAATC
TTCCAGCCCTAAATCCTCTCCGACGAAACAGCTAAAGCGTCCTCGCCAGCCACACGATATCTCGTCCTTCAGTGTTAGAAGGTCCAGCCGATTTGCGGATAAACCCCCTC
CGAACTATAAGGAGGTGCCCATTGAACCACTTCCAGGCAACAGAAGTTATAGAAGGACATATCAACGGAGAGATTTGTTGAATCGGGTTTATGCTTCACATGAAGAAAGG
CAATATGCTATTGACAGAGCACGAGACCTTCAATCTAGCCTGGATTCTAGATACCCAAGTTTTGTGAAGCCAATGCTTCAGTCACATGTCACCGGGGGATTTTGGCTGGG
TCTTCCAGTTCAATTTTGCAAGCAACACCTTCCCCGTGAGGATGAAATGGTTACTCTGCTGGACGAGGATGGAAATGAGTTCCAAACAAAATACCTTGCCGAGAAAACAG
GTCTTAGTGGTGGTTGGAGAGGGTTTGCCATTGATCACCAGTTAGTAGATGGGGATGCTTTGGTGTTTCACTTAACTAAGCCAACTGAATTCAAGGTGATTACCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCTGAACAAGCTTGGTTTGAATTCGAATTCGCTCCAGAGATTTTTATGTTGGCGCTCACCGGAGAATCGAAGGGAACAAACTTCAGTTCACTGAGGCAGCTCTAGAACGG
TCAGATTCTTGTTCTCTTTGCATTAAGGGATTGAAGGATTGTGCTGTTTGGATTCCAGGAAAATGGTGGAATCGAACCTGACTTACGAGGAATGCCGACGCCAGAGGTTG
GAGGAGAATAAGAAGAGGATGGAAGAGCTTAATCTCAACAAGCTTGCCGATGCTCTGAAATCTTCCAGCCCTAAATCCTCTCCGACGAAACAGCTAAAGCGTCCTCGCCA
GCCACACGATATCTCGTCCTTCAGTGTTAGAAGGTCCAGCCGATTTGCGGATAAACCCCCTCCGAACTATAAGGAGGTGCCCATTGAACCACTTCCAGGCAACAGAAGTT
ATAGAAGGACATATCAACGGAGAGATTTGTTGAATCGGGTTTATGCTTCACATGAAGAAAGGCAATATGCTATTGACAGAGCACGAGACCTTCAATCTAGCCTGGATTCT
AGATACCCAAGTTTTGTGAAGCCAATGCTTCAGTCACATGTCACCGGGGGATTTTGGCTGGGTCTTCCAGTTCAATTTTGCAAGCAACACCTTCCCCGTGAGGATGAAAT
GGTTACTCTGCTGGACGAGGATGGAAATGAGTTCCAAACAAAATACCTTGCCGAGAAAACAGGTCTTAGTGGTGGTTGGAGAGGGTTTGCCATTGATCACCAGTTAGTAG
ATGGGGATGCTTTGGTGTTTCACTTAACTAAGCCAACTGAATTCAAGGTGATTACCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVESNLTYEECRRQRLEENKKRMEELNLNKLADALKSSSPKSSPTKQLKRPRQPHDISSFSVRRSSRFADKPPPNYKEVPIEPLPGNRSYRRTYQRRDLLNRVYASHEER
QYAIDRARDLQSSLDSRYPSFVKPMLQSHVTGGFWLGLPVQFCKQHLPREDEMVTLLDEDGNEFQTKYLAEKTGLSGGWRGFAIDHQLVDGDALVFHLTKPTEFKVIT