; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh12G005170 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh12G005170
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Descriptiontranscription factor MYB44-like
Genome locationCma_Chr12:2664127..2664819
RNA-Seq ExpressionCmaCh12G005170
SyntenyCmaCh12G005170
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AXF54213.1 MYB8 [Cucurbita pepo]5.2e-11193.12Show/hide
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KAG7020554.1 Transcription factor MYB44, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.9e-11495.52Show/hide
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XP_022951647.1 transcription factor MYB44-like [Cucurbita moschata]1.7e-11495.52Show/hide
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XP_023002015.1 transcription factor MYB44-like [Cucurbita maxima]1.7e-122100Show/hide
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XP_023537871.1 transcription factor MYB44-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.0e-11192.79Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKY3 Uncharacterized protein1.8e-9682.35Show/hide
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A0A345BTF6 MYB82.5e-11193.12Show/hide
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A0A6J1CRX2 transcription factor MYB1-like2.7e-9782.89Show/hide
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        FWDAMRDV+AREVREYMTTTF+EN E H
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A0A6J1GI94 transcription factor MYB44-like8.4e-11595.52Show/hide
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A0A6J1KMR9 transcription factor MYB44-like8.3e-123100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04192 Transcription factor MYB251.3e-3561.68Show/hide
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O23160 Transcription factor MYB732.1e-4656.32Show/hide
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Q42575 Transcription factor MYB13.6e-3865.14Show/hide
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        S L+RR  D
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Q9FDW1 Transcription factor MYB441.0e-4557.4Show/hide
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        LKR+     H    DG   ++H        +K SV     P +T L ++P   +G  V++   I   P+
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Q9SN12 Transcription factor MYB771.7e-4375.96Show/hide
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Query:  LKRR
        LKR+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G23290.1 myb domain protein 705.3e-4560.96Show/hide
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        +KNHWNSTLKR+          +G + D  GN   D +L    PL+
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AT3G50060.1 myb domain protein 771.2e-4475.96Show/hide
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Query:  LKRR
        LKR+
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AT3G55730.1 myb domain protein 1091.5e-3966.98Show/hide
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        K+KGPWS EED +L  LV + GPRNWSLI+R I GRSGKSCRLRWCNQL P ++ +PFS  ED  I++AHA  GN+WA IA+LL GRTDNA+KNHWNSTL
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Query:  KRRARD
        +R+  D
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AT4G37260.1 myb domain protein 731.5e-4756.32Show/hide
Query:  AKPSRR-PEKIKGPWSAEEDRILIHLVDRYGPRNWSLISRYIKGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSATEDETILAAHARFGNRWATIARLLPGRTDNA
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Query:  VKNHWNSTLKRRARDQQHHLAMDGITPDNHGNAVTDSDLKLSVPLE------DDPLTALTLAPPGISGGVVAEE
        +KNHWNSTLKR+        +++G + D  GN   D +L    PL+          T L ++P   SG  V+E+
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AT5G67300.1 myb domain protein r17.4e-4757.4Show/hide
Query:  EKIKGPWSAEEDRILIHLVDRYGPRNWSLISRYIKGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSATEDETILAAHARFGNRWATIARLLPGRTDNAVKNHWNST
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Query:  LKRRARDQQHHLAMDGITPDNHGNAVTDSDLKLSVPLEDDP-LTALTLAPPGISGGVVAEERRIESFPA
        LKR+     H    DG   ++H        +K SV     P +T L ++P   +G  V++   I   P+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAACCGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACGTCATCCGGTACCTCCTTCTCCGCCAAGCCCTCCCGCCGCCCTGAGAAGATCAA
AGGCCCCTGGAGTGCGGAGGAGGATCGGATTCTGATCCATCTCGTCGACCGCTATGGACCCCGAAACTGGTCCTTGATTAGCCGTTACATTAAAGGCCGGTCCGGGAAGT
CCTGCCGCCTCCGGTGGTGTAATCAGTTGAGTCCAAACGTCGAGCACCGGCCGTTTTCCGCCACCGAGGATGAGACGATTTTAGCGGCTCATGCCCGATTCGGGAACCGG
TGGGCTACCATTGCCCGGTTACTTCCAGGCCGAACCGATAATGCCGTTAAGAATCACTGGAACTCCACGCTTAAGCGAAGAGCAAGAGACCAACAACATCATTTAGCAAT
GGACGGAATTACCCCTGACAATCACGGCAATGCCGTGACTGATTCTGATTTGAAACTCTCCGTACCATTAGAGGATGACCCATTGACCGCGTTGACTCTAGCACCGCCGG
GAATCAGCGGCGGAGTGGTAGCAGAGGAGCGGCGGATTGAGAGTTTTCCGGCGGGGTTTTGGGATGCAATGAGGGATGTGGTAGCAAGGGAGGTGAGAGAGTACATGACG
ACGACGTTTTTGGAAAATCAAGAGTTTCATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACAACCGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACGTCATCCGGTACCTCCTTCTCCGCCAAGCCCTCCCGCCGCCCTGAGAAGATCAA
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ACGACGTTTTTGGAAAATCAAGAGTTTCATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTTASSSSSSSSSSSSSSTSSGTSFSAKPSRRPEKIKGPWSAEEDRILIHLVDRYGPRNWSLISRYIKGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSATEDETILAAHARFGNR
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