; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh12G005690 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh12G005690
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionDomain of unknown function (DUF303)
Genome locationCma_Chr12:2975951..2976709
RNA-Seq ExpressionCmaCh12G005690
SyntenyCmaCh12G005690
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022951887.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]5.1e-13692.86Show/hide
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XP_023002892.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita maxima]3.8e-147100Show/hide
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XP_023537877.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.7e-13692.86Show/hide
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XP_023537881.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.1e-13692.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GIR0 probable carbohydrate esterase At4g342153.6e-13592.06Show/hide
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A0A6J1GIW6 probable carbohydrate esterase At4g342152.5e-13692.86Show/hide
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A0A6J1IKT8 probable carbohydrate esterase At4g342155.7e-13390.55Show/hide
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A0A6J1KIR8 probable carbohydrate esterase At4g342151.8e-147100Show/hide
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A0A6J1KKV2 probable carbohydrate esterase At4g342151.8e-147100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342151.5e-3734.14Show/hide
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            +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y +N+ + I ++R+D+    LP+I V I+    ++          +  E  +  +
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        L +++ +D+  LP+          D+ H  T  ++ LG  LA  YL+++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)8.7e-4139.36Show/hide
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        MAGRGGV N+       WDG +P EC+S+PSILRL    +W+ A+EPLH+ IDI KT G+GPG+PFA++   + GQ    VGLVPC+ GGT + QW K  
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               Y+  ++R K +     GG  RA+ WYQGESD      A  YK  L KF +D+RND++   LP+I V ++            L AVR A+  ++
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Query:  KELPDIITIDSWELPINFTTFEGFCLDHGHFNTATEIALGKWLADTYLA
         +L ++  +D+  LP+          D  H  T++++ LG  +A+++LA
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AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)1.1e-3834.14Show/hide
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        MAGRGGV +++   +  WD  +P EC  + SILRL+   +WE A EPLH+ ID GK  G+GPG+ FA+  K +    + ++GLVPCA GGT I++W +  
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Query:  SNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTAHRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISMYDFFMKHDTHDLPAVRAAEDAVQKE
            +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y +N+ + I ++R+D+    LP+I V I+    ++          +  E  +  +
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        L +++ +D+  LP+          D+ H  T  ++ LG  LA  YL+++
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AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)1.1e-3834.14Show/hide
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            +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y +N+ + I ++R+D+    LP+I V I+    ++          +  E  +  +
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Query:  LPDIITIDSWELPINFTTFEGFCLDHGHFNTATEIALGKWLADTYLAHY
        L +++ +D+  LP+          D+ H  T  ++ LG  LA  YL+++
Subjt:  LPDIITIDSWELPINFTTFEGFCLDHGHFNTATEIALGKWLADTYLAHY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGTCGAGGTGGGGTAGAGAACAATCAAAAGGGGAAACTTGAGTGGGATGGGAAGGTCCCATTAGAGTGTCAATCCGACCCATCCATCCTACGGTTGAACCCTGC
ACGCCAATGGGAAATTGCACAGGAACCACTCCATTTGGGGATTGACATCGGCAAAACTCCAGGGATTGGTCCGGGAATACCATTTGCTCACCAGTTCAAAGCAAAAGCTG
GACAAAAGGCAGGCATCGTGGGTTTAGTTCCTTGTGCTAGAGGGGGCACTTTAATTGAACAATGGATTAAAAACCCTAGCAATCCTAGTGCAACTTTTTACCAAAATTTC
ATTGAACGAATTAAAACATCAGAAAAAGAAGGTGGGGTTGTGCGTGCTTTGTTTTGGTATCAAGGAGAGAGCGATGCGGCTATGAGTGACACTGCTCACAGATACAAAGA
CAACTTAAAGAAGTTCATCACCGACATCCGCAATGATATAAAACCTAGATTTTTACCTGTCATTATTGTTAAGATATCCATGTATGACTTTTTTATGAAGCACGATACTC
ATGATTTGCCCGCAGTGAGAGCAGCTGAAGATGCGGTCCAGAAAGAGCTTCCAGACATCATTACTATCGACTCTTGGGAGTTGCCTATAAACTTTACCACATTTGAAGGC
TTTTGCTTGGATCACGGTCATTTTAATACAGCAACTGAGATTGCTTTGGGTAAATGGTTGGCTGACACATATCTGGCCCACTATAGCCATTTACTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGGTCGAGGTGGGGTAGAGAACAATCAAAAGGGGAAACTTGAGTGGGATGGGAAGGTCCCATTAGAGTGTCAATCCGACCCATCCATCCTACGGTTGAACCCTGC
ACGCCAATGGGAAATTGCACAGGAACCACTCCATTTGGGGATTGACATCGGCAAAACTCCAGGGATTGGTCCGGGAATACCATTTGCTCACCAGTTCAAAGCAAAAGCTG
GACAAAAGGCAGGCATCGTGGGTTTAGTTCCTTGTGCTAGAGGGGGCACTTTAATTGAACAATGGATTAAAAACCCTAGCAATCCTAGTGCAACTTTTTACCAAAATTTC
ATTGAACGAATTAAAACATCAGAAAAAGAAGGTGGGGTTGTGCGTGCTTTGTTTTGGTATCAAGGAGAGAGCGATGCGGCTATGAGTGACACTGCTCACAGATACAAAGA
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ATGATTTGCCCGCAGTGAGAGCAGCTGAAGATGCGGTCCAGAAAGAGCTTCCAGACATCATTACTATCGACTCTTGGGAGTTGCCTATAAACTTTACCACATTTGAAGGC
TTTTGCTTGGATCACGGTCATTTTAATACAGCAACTGAGATTGCTTTGGGTAAATGGTTGGCTGACACATATCTGGCCCACTATAGCCATTTACTCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGRGGVENNQKGKLEWDGKVPLECQSDPSILRLNPARQWEIAQEPLHLGIDIGKTPGIGPGIPFAHQFKAKAGQKAGIVGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPSATFYQNF
IERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTAHRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISMYDFFMKHDTHDLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSWELPINFTTFEG
FCLDHGHFNTATEIALGKWLADTYLAHYSHLL