CuGenDBv2

Gene ID	CmaCh12G007710
Organism	Cucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
Genome location	Cma_Chr12:5099266..5131888
RNA-Seq Expression	CmaCh12G007710
Synteny	CmaCh12G007710
Gene Ontology terms	GO:0022900 - electron transport chain (biological process) GO:0005739 - mitochondrion (cellular component) GO:0005886 - plasma membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0008137 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
InterPro domains	IPR001694 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1/F420H2 oxidoreductase subunit H IPR018086 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1, conserved site

Homology

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GenBank top hits

e value

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AOF46959.1 NADH dehydrogenase subunit 1, partial [Maundia triglochinoides]

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AOF46960.1 NADH dehydrogenase subunit 1, partial [Triglochin maritima]

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QNJ88947.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Caucalis platycarpos]

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QNJ88958.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Daucus carota subsp. gummifer]

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YP_009402313.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Zostera marina]

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A0A1B3IYT3 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 (Fragment)

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A0A1B3IYT6 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 (Fragment)

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A0A1B3IYT8 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 (Fragment)

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A0A1Z1R066 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 (Fragment)

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A0A1Z1V5Q5 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

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SwissProt top hits

e value

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P26845 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

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73.79

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        K A
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P31839 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

4.9e-41

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P92558 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

2.4e-40

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Q01148 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

2.4e-40

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Q01300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

4.0e-43

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Arabidopsis top hits

e value

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AT2G07785.1 NADH dehydrogenase family protein

5.4e-43

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ATCG01100.1 NADH dehydrogenase family protein

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        A +Q R GP+  G  G+LQ LADG KL+ KE L PS  N  LF + P    +  L++ +V+PF   +VL+D NIG+    AISS+   G++++
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ATMG00516.1 NADH dehydrogenase 1C

4.1e-43

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ATMG01120.1 NADH dehydrogenase 1B

4.1e-43

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ATMG01275.1 NADH dehydrogenase 1A

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTTTTGTGCAATGTCGAAAGGGTCCTGATGTAGTGGGATCGTTCGGATTGTTACAACCTCTAGCAGATGGTTTGAAATTGATGATAAAAGAACCTCTTTCACCAAG
TAGTGCTAATTTCTCCCTTTTTAGAATGGCTCCAGTGGCTACATTTATGTTAAGTCTGGTCGCTCGGGCCGTTGTACCTTTTGATTATGGTATGGTATTGTCAGATCCGA
ACATAGGGCTACTTTATTTGTTTGCCATATCTTCGCTAGGTGTTTATGGAATTATTATCGCGGCTTCATCAGATAAGGCAGCAAGTAAGAAGAAAACCAAGATCAGGCAA
TTTACCCTCCTGAAAAGACGGAGGCAATGCCTTAAATCGAATCATCTCCATTATCAGGCTCTTCAAGCCTATTATATACCTAATCCCATTGAACCACGAAAAAGGGAGGC
AGTTGAATTGAGGAAGTTCAAGTTAGCAGCTCAATCGGATCCTATATTCATATTCTCCACTCCTTGGGAAGCTATTTCCTCCTATTCGATTCCTAGTCCCTCCAGAATCA
ATTATCTAGTCAAGGCTAGATTAAAGATCATTGCTTGCGACTGCCATTACGACTTTTTACAGCAGTCTAATTGTCACTATTGCTCTTTCGAGTCTACACTTAGAGTTTCA
TCCGGCTGCTTTTTGGCTTTTCTGGGCTATTCACTATCAGCAAAGAGAGTCTGCCCAGCTAAACGGATTCGATTATCAGGCATTCAGTCATCAGTAGCTTCTTCGATGAA
AAGCCATCCTAATTCTGGTGAAAAGAGGGAGAAGATCCGTAAGATCAGTTCACTGCTAAAGGAACAGACTAAGAAGGCACTTCTAGCACTTCATTCTCCGAAAACAACTC
TTTCTTCTATTTCTTTACGGACGGGGAAGATCAGCCTGAGAGTATCCGGGACGAGTGAAATCAATACTGTCTGGTATGAATTCCGGGAAGAGACTGAGGTTGCCTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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FTLLKRRRQCLKSNHLHYQALQAYYIPNPIEPRKREAVELRKFKLAAQSDPIFIFSTPWEAISSYSIPSPSRINYLVKARLKIIACDCHYDFLQQSNCHYCSFESTLRVS
SGCFLAFLGYSLSAKRVCPAKRIRLSGIQSSVASSMKSHPNSGEKREKIRKISSLLKEQTKKALLALHSPKTTLSSISLRTGKISLRVSGTSEINTVWYEFREETEVA

CmaCh12G007710 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome