; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh13G005690 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh13G005690
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionAWPM-19-like family protein
Genome locationCma_Chr13:5754858..5755755
RNA-Seq ExpressionCmaCh13G005690
SyntenyCmaCh13G005690
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008390 - AWPM-19-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008443837.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487332 [Cucumis melo]1.1e-6788.31Show/hide
Query:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK +A+LLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA V GAASAISGLNHIRSWS ESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR
        FAW+LTILAMGFACKEIALD+RN RL+TMEAFFIILSATQL+YI AIHG +STR
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR

XP_022927469.1 uncharacterized protein LOC111434286 [Cucurbita moschata]1.9e-7296.75Show/hide
Query:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MKPLA+LLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIR WSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR
        FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQL+YIFAIHGAV  R
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR

XP_023001482.1 uncharacterized protein LOC111495604 [Cucurbita maxima]4.0e-75100Show/hide
Query:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR
        FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR

XP_023519488.1 membrane protein PM19L-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.9e-7396.75Show/hide
Query:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MKP+A+LLLLLNFCM+AVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAAS+ISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR
         AWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR

XP_038895378.1 membrane protein PM19L-like [Benincasa hispida]2.1e-6890.26Show/hide
Query:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK +A+LLLLLNFCMYA+ILGIGGWAMN AIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLAAV GAASAISGLNHIRSWSAESLGAAS+AAV
Subjt:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR
        FAW+LTILAMGFACKEIALD+RN RL+TMEAFFIILSATQL+YI AIHGAVSTR
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV01 AWPM19-like protein6.9e-6586.36Show/hide
Query:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK  A+LLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA V GAASAISGLNHIRSWS ESL AASSAAV
Subjt:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR
        FAW+LTILAMGFA KEIALD+RN RL+TMEAFFIILSATQL+YI AIHG +STR
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR

A0A6J1CEV9 uncharacterized protein LOC1110108602.2e-6688.96Show/hide
Query:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK +A+LLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIRSWS +SLGAASSAAV
Subjt:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR
        FAW+LTILAMGFACKEI LD+R+TRLITMEAFFIILS TQL+YI AIHGA S R
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR

A0A6J1EI31 uncharacterized protein LOC1114342869.0e-7396.75Show/hide
Query:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MKPLA+LLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIR WSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR
        FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQL+YIFAIHGAV  R
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR

A0A6J1KGN7 uncharacterized protein LOC1114956041.9e-75100Show/hide
Query:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR
        FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR

A5Y734 AWPM19-like protein5.1e-6888.31Show/hide
Query:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK +A+LLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA V GAASAISGLNHIRSWS ESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR
        FAW+LTILAMGFACKEIALD+RN RL+TMEAFFIILSATQL+YI AIHG +STR
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6L4D2 Membrane protein PM19L8.3e-2344.14Show/hide
Query:  LLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAWSLTI
        LL+LN  MY +++G   W +N  I +G    PG+             GN AT +F+ FA+LA V GAAS ++G++H+RSW A SL A +++A+ AW++T 
Subjt:  LLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAWSLTI

Query:  LAMGFACKEIAL-DYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAV
        LA G ACKEI +  YR  RL  +EAF IIL+ TQL+Y+  +HG +
Subjt:  LAMGFACKEIAL-DYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04560.1 AWPM-19-like family protein2.2e-2343.79Show/hide
Query:  LASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAW
        +A+ LL LN  MY ++LG   W +N  I +G    P               GN AT FF+TF++LAAV G AS ++G NHIR W  +SL AA ++++ AW
Subjt:  LASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAW

Query:  SLTILAMGFACKEIAL-DYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIH-GAVSTR
        ++T LAMG ACK+I +  +R  RL  +EAF IIL+ TQL+Y+  IH G++S++
Subjt:  SLTILAMGFACKEIAL-DYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIH-GAVSTR

AT1G29520.1 AWPM-19-like family protein9.9e-5674.5Show/hide
Query:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        +KP+AS LL+LNFCMY ++LGIGGWAMN AIDHGF +GP L LPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA V GAAS ISGL+HIRSW+  SL AA++AA 
Subjt:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHG
         AW+LT+LAMGFA KEI L  RN +L TMEAF IILS TQLIYI A+HG
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHG

AT5G18970.1 AWPM-19-like family protein1.1e-2745.33Show/hide
Query:  KPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVF
        K  A +LL+LN  +Y VI  I  WA+N  I+        L LPA   PIYFP+GN ATGFFV F L+A V G A++++G+ ++  W + +L +A+++++ 
Subjt:  KPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVF

Query:  AWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAV
        +WSLT+LAMG ACKEI + +    L T+E   II+SATQL+   AIH  V
Subjt:  AWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAV

AT5G46530.1 AWPM-19-like family protein4.2e-5471.81Show/hide
Query:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MKP+AS LL+LNFCMYA++LGIG W+MN AI+HGF+IG    LPAHFSPI+FPMGNAATGFF+ FAL+A VAGAAS ISG++H++SW+  SL AA SAA 
Subjt:  MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHG
         AWSLT+LAMGF CKEI L  RN RL TMEAF IILSATQL+YI AI+G
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAACCCCTTGCCTCTCTGCTTCTGCTGCTTAACTTCTGCATGTATGCAGTCATTTTGGGCATCGGTGGCTGGGCCATGAACACAGCCATCGATCATGGCTTCGTCAT
TGGTCCTGGCTTACGACTACCGGCCCATTTCTCACCAATTTACTTCCCCATGGGGAACGCAGCCACTGGTTTCTTTGTGACATTCGCTTTGTTGGCTGCGGTGGCTGGAG
CTGCCTCAGCAATCTCAGGACTAAACCATATTCGGTCATGGAGTGCTGAAAGCTTAGGCGCAGCATCCTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGTCTCTCACTATCCTTGCCATG
GGCTTTGCTTGCAAAGAGATTGCTCTGGATTACAGAAACACAAGACTGATAACAATGGAGGCATTCTTCATAATTCTCTCTGCTACACAGCTAATATACATCTTTGCCAT
CCATGGTGCTGTTTCCACGAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTATATAACCATCTCACCTCCATTAATCCCCCAACTTTTGTGTCTTGATTCTTAGCAAACTCCTCATCCTGTTTTGTCCTTCCCCCTTCCAATAATCAGCCGCACAAATG
AAACCCCTTGCCTCTCTGCTTCTGCTGCTTAACTTCTGCATGTATGCAGTCATTTTGGGCATCGGTGGCTGGGCCATGAACACAGCCATCGATCATGGCTTCGTCATTGG
TCCTGGCTTACGACTACCGGCCCATTTCTCACCAATTTACTTCCCCATGGGGAACGCAGCCACTGGTTTCTTTGTGACATTCGCTTTGTTGGCTGCGGTGGCTGGAGCTG
CCTCAGCAATCTCAGGACTAAACCATATTCGGTCATGGAGTGCTGAAAGCTTAGGCGCAGCATCCTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGTCTCTCACTATCCTTGCCATGGGC
TTTGCTTGCAAAGAGATTGCTCTGGATTACAGAAACACAAGACTGATAACAATGGAGGCATTCTTCATAATTCTCTCTGCTACACAGCTAATATACATCTTTGCCATCCA
TGGTGCTGTTTCCACGAGATGACAACTGAATCATGGAAACATTCCTCTATATTCATTGCCCATTTTCATCTGCGTTTTGGTGTCATTTTCCTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKPLASLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAWSLTILAM
GFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLIYIFAIHGAVSTR