; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh17G014110 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh17G014110
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Descriptionsmall acidic protein-like isoform X2
Genome locationCma_Chr17:9333172..9335038
RNA-Seq ExpressionCmaCh17G014110
SyntenyCmaCh17G014110
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036020 - WW domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576106.1 hypothetical protein SDJN03_26745, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-10096.95Show/hide
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XP_022991817.1 uncharacterized protein LOC111488350 [Cucurbita maxima]1.5e-106100Show/hide
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XP_023547639.1 uncharacterized protein LOC111806522 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-9595.31Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF89 Uncharacterized protein2.9e-8484.24Show/hide
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A0A1S4E3A8 uncharacterized protein LOC1034988825.7e-8083.42Show/hide
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A0A5A7TA84 Uncharacterized protein3.2e-8384.24Show/hide
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A0A6J1GM82 uncharacterized protein LOC1114557805.0e-10095.94Show/hide
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A0A6J1JMX9 uncharacterized protein LOC1114883507.2e-107100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28070.1 unknown protein7.8e-2943.62Show/hide
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AT2G33510.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WW/Rsp5/WWP (InterPro:IPR001202)5.0e-3647.26Show/hide
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        PR    A+    D Y    SE+D      E SS +SS  S  +       ++    +EEDVLVVAGCK CFMYFMVPK VEDCPKC +++L+HFDR   +
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Query:  N
        +
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AT2G33510.2 unknown protein5.2e-3343.98Show/hide
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        C +++L+HFDR   ++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAATCTCCCGATATGGCGGCGGTTACTGATTCCCTCGAGCAGTCTTTCCGTACCTTCTCCCTCAACCACCGTCTGGTCTCACCTGCCCCCTCGGCCGGTGTTCGTAG
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TCTGGGAACAATGCCTCGATTTGAAGACTGGGGAAGTCTACTATAGAAATTGCCGGACCGGAATGAGAGTAACGGAAGATCCGAGGACAGCGGAAGCACACGGCCGAGAT
TTATACTCGGAAGATGACGACGACAACGATGCGGATGAGAGCTCGTCGGACGACAGCAGCGAGGAGTCGTGTTCTTCGTCGTCGTACGGTGCTAGTAGGCAGCAATACCC
GCCGGGAAAGGAGGAGGACGTGCTAGTGGTTGCCGGATGCAAGAGATGCTTCATGTACTTCATGGTGCCGAAACAGGTTGAAGATTGCCCCAAATGCAGCAGCAGTCGTC
TTGTTCATTTCGATCGCTCCGAGGACAGTAATGGCTTCCCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GATAATACGCTTTTCCGTATTCTCATTCTTCCTTCCATCTCATCTCTTCTTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCTCCTCCTCCCCTCCTCCTC
CTCCTCCAGATGAAATCTCCCGATATGGCGGCGGTTACTGATTCCCTCGAGCAGTCTTTCCGTACCTTCTCCCTCAACCACCGTCTGGTCTCACCTGCCCCCTCGGCCGG
TGTTCGTAGGTCGTCGTCTTCTTCTTCTTCCGCCGACGAACGTCATCTTCCTCTTCATCATCATCATCATCGCTTCGACACAACCTTGGAGCTCAACTCTCACATCTCCC
TCCCTCCTTTCTGGGAACAATGCCTCGATTTGAAGACTGGGGAAGTCTACTATAGAAATTGCCGGACCGGAATGAGAGTAACGGAAGATCCGAGGACAGCGGAAGCACAC
GGCCGAGATTTATACTCGGAAGATGACGACGACAACGATGCGGATGAGAGCTCGTCGGACGACAGCAGCGAGGAGTCGTGTTCTTCGTCGTCGTACGGTGCTAGTAGGCA
GCAATACCCGCCGGGAAAGGAGGAGGACGTGCTAGTGGTTGCCGGATGCAAGAGATGCTTCATGTACTTCATGGTGCCGAAACAGGTTGAAGATTGCCCCAAATGCAGCA
GCAGTCGTCTTGTTCATTTCGATCGCTCCGAGGACAGTAATGGCTTCCCATAAAAGAACGAACCACAATTTTTTAAAAATCAAACTGTGTTTGGGTTAATTCTGACATAA
TCATTGATTCTTTCTCTTTGGATTAATTTGGTGAGCGAAGGCAAATGGGGTTTGATTTCGTAGCTCGATGTATACGCCTCTCTCCCTCCCTTTGACGTTGTTTTATGAGT
TTTAATTGTATGGATATATATTTTACAAAGCTTGAATTGAGAAGCTAAAGAAAAAGAAAAGGAATCTGGGGGGGCCGCCATGGATGTGTGAGTGGGAGATGCAGAAAATA
TGCAGGCATGAATGGGATGATGGTCAACGACTCAAACGAGGAAGAAGGAATAATATTTTGCTCGTGAAGACAGCAACTCATTGCTTTCATTATTCCACAACCCTCTCTGA
TTGAATCGTACGCAATTAATTTTAATTTTTATGTTGTTTTTTTTATATGAATAATAATGTAAGGAAGTAATTAGAATGGAAATGAAAATGAGACATCCCACACACAACAT
ATGCACAAAGCATGTTAGGGTACGACTCTATTTATACCTGCTCTTCATAATAAAAATGTGAAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLVSPAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLHHHHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDPRTAEAHGRD
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