; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh20G007730 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh20G007730
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Descriptionaquaporin TIP1-2-like
Genome locationCma_Chr20:3659244..3661371
RNA-Seq ExpressionCmaCh20G007730
SyntenyCmaCh20G007730
Gene Ontology termsGO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0015267 - channel activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000425 - Major intrinsic protein
IPR023271 - Aquaporin-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571043.1 ER lumen protein-retaining receptor, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-17198.14Show/hide
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KAG7010873.1 Aquaporin TIP1-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-16997.81Show/hide
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XP_022944060.1 aquaporin TIP1-2-like [Cucurbita moschata]1.3e-17198.14Show/hide
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XP_022986191.1 aquaporin TIP1-2-like [Cucurbita maxima]1.4e-175100Show/hide
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XP_023512243.1 aquaporin TIP1-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-16997.2Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJ07 Uncharacterized protein4.7e-13279.55Show/hide
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        RR++ + KL +NV
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A0A1S3C6M4 aquaporin TIP1-2-like3.3e-13381.61Show/hide
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A0A6J1CY31 aquaporin TIP1-2-like4.7e-13279.81Show/hide
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A0A6J1FYG0 aquaporin TIP1-2-like6.1e-17298.14Show/hide
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A0A6J1JAF0 aquaporin TIP1-2-like6.9e-176100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P26587 Aquaporin TIP3-18.3e-1730.65Show/hide
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        Y +AQ LG+I+A LL+          + +  G    G     G+G    LVLE   TF ++YV  + ++D K    LG+  P+  G+I G++        
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         I     + G  +NPAR  GPA++  G  W  HW++WVGPF   A     Y + V +PT P
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Q94CS9 Probable aquaporin TIP1-26.3e-1732.05Show/hide
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        EL  P   KAA+ E ++  + VF  + S ++  K  +   + P  LI   +A  + LF+ + V   +SGG ++P   F A + G I+  +A VY +AQ L
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        GS++A LL+K A           GG  +     + G+G   A+V E   TF ++Y      +D K  + LG+  P+  G I G++ +A            
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        + G  +NPA   GPAV+ G  +W+ HWV+W+GPF
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Q9ATL7 Aquaporin TIP3-17.0e-1630.4Show/hide
Query:  PQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSCLK----SNESDPKLLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFMSPIFAFIAALRGVITFTRAAVYILAQCLGSIIA
        P   +AA++E +ATA+ VF    S++S  K     + +   + + +A  + L + + V   +SGG ++P   F A + G ++  RA +Y +AQ LG++ A
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         LL+          + + GG    G     G+G   A++LE   TF ++Y     V+D K           G IA   AV   +   +     + G G+N
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Query:  PARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPF
        PAR  GPA++  G  W  HWV+W+GPF
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Q9ATM0 Aquaporin TIP1-22.6e-1833.62Show/hide
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        EL  P   KAA+ E ++T + VF  + S ++  K  +   + P  LI  ++   L LF+ V+    +SGG ++P   F A + G I+  +A VY +AQ L
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Query:  GSIIAFLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLGL--PMVCGMIAGSSAVAVFVSTTITGRAG
        GS++A LL+K A           GG  +     + G+G   A+VLE   TF ++Y      +D K  + LG+  P+  G I G++ +A            
Subjt:  GSIIAFLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLGL--PMVCGMIAGSSAVAVFVSTTITGRAG

Query:  YGGVGLNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPFA
        + G  +NPA   GPAV+ G  +WE HWV+WVGP A
Subjt:  YGGVGLNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPFA

Q9FWV6 Probable aquaporin TIP3-11.1e-1632.31Show/hide
Query:  PQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSC--LKSNESDPKLLIPIAV--FIILFLFLLVTFPLSGGFMSPIFAFIAALRGVITFTRAAVYILAQCLGSIIA
        P   +AA++E +ATA+ VF    SI+S   L  + S P  L+ +++   + L + + V   +SGG ++P   F A L G ++  RA  Y LAQ LG+++A
Subjt:  PQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSC--LKSNESDPKLLIPIAV--FIILFLFLLVTFPLSGGFMSPIFAFIAALRGVITFTRAAVYILAQCLGSIIA

Query:  FLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLG--LPMVCGMIAGSSAVAVFVSTTITGRAGYGGVG
         LL+          + + GG    G     G+G   A++LE   TF ++Y     V+D K    +G   P+  G + G++ +A            + G G
Subjt:  FLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLG--LPMVCGMIAGSSAVAVFVSTTITGRAGYGGVG

Query:  LNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPF
        +NPAR  GPA++  G  W  HWV+W+GPF
Subjt:  LNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G73190.1 Aquaporin-like superfamily protein5.9e-1830.65Show/hide
Query:  AHELFSPQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSCLK----------SNESDPKLLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFMSPIFAFIAALRGVITFTRAAV
        A E   P   +A + E ++T + VF    SI+S  K          +N     +L+ +A    LF  +     +SGG ++P   F A + G +T  RA  
Subjt:  AHELFSPQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSCLK----------SNESDPKLLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFMSPIFAFIAALRGVITFTRAAV

Query:  YILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLGL--PMVCGMIAGSSAVAVFVST
        Y +AQ LG+I+A LL+          + +  G    G     G+G    LVLE   TF ++YV  + ++D K    LG+  P+  G+I G++        
Subjt:  YILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLGL--PMVCGMIAGSSAVAVFVST

Query:  TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPF---AACVAYYGFSVNLPTAP
         I     + G  +NPAR  GPA++  G  W  HW++WVGPF   A     Y + V +PT P
Subjt:  TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPF---AACVAYYGFSVNLPTAP

AT2G36830.1 gamma tonoplast intrinsic protein6.5e-1730.4Show/hide
Query:  ELFSPQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSCLKSNE---SDPKLLIPIAVFIILFLFLLVTF--PLSGGFMSPIFAFIAALRGVITFTRAAVYILAQCL
        E   P   KAA+ E ++T + V   + S ++  K  E   + P  L+  AV     LF+ V+    +SGG ++P   F A + G IT  R  +Y +AQ L
Subjt:  ELFSPQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSCLKSNE---SDPKLLIPIAVFIILFLFLLVTF--PLSGGFMSPIFAFIAALRGVITFTRAAVYILAQCL

Query:  GSIIAFLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLG--LPMVCGMIAGSSAVAVFVSTTITGRAG
        GS++A L++          K++ GG  +   G + G+G+  A V E   TF ++Y      +D K +  LG   P+  G I G++ +A            
Subjt:  GSIIAFLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLG--LPMVCGMIAGSSAVAVFVSTTITGRAG

Query:  YGGVGLNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPFA----ACVAYYGFSVN
        + G  +NPA   GPAV+     W  HWV+W GP      A + Y  F +N
Subjt:  YGGVGLNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPFA----ACVAYYGFSVN

AT2G37170.1 plasma membrane intrinsic protein 24.2e-1629.53Show/hide
Query:  YIGAHELFSPQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPK-----------LLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFMSPIFAFIAALRGVITFT
        +  A EL    +++A + E VAT L ++    +++      +SD K           L I  A   ++F+ +  T  +SGG ++P   F   L   ++  
Subjt:  YIGAHELFSPQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPK-----------LLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFMSPIFAFIAALRGVITFT

Query:  RAAVYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLGLPMVCGMIAGSSAVAVFV
        RA +Y++AQCLG+I     +K A      D+Y  GG      G   G G+A     E   TFV++Y   +    ++ +    +P++  +  G +   V +
Subjt:  RAAVYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLGLPMVCGMIAGSSAVAVFV

Query:  ST-TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY
        +T  IT      G G+NPAR  G AV+    + W+ HW+FWVGPF  AA  A+Y
Subjt:  ST-TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY

AT3G53420.1 plasma membrane intrinsic protein 2A1.2e-1528.97Show/hide
Query:  YIGAHELFSPQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPK---------LLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFMSPIFAFIAALRGVITFTRA
        +I   EL     ++A + E VAT L ++    +++     +++D           L I  A   ++F+ +  T  +SGG ++P   F   L   ++  RA
Subjt:  YIGAHELFSPQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPK---------LLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFMSPIFAFIAALRGVITFTRA

Query:  AVYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLGLPMVCGMIAGSSAVAVFVST
         +YI+AQCLG+I     +K A       +Y  GG      G + G G+A     E   TFV++Y   +    ++ +    +P++  +  G +   V ++T
Subjt:  AVYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLGLPMVCGMIAGSSAVAVFVST

Query:  -TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY
          IT      G G+NPAR  G AV+    + W+ HW+FWVGPF  AA  A+Y
Subjt:  -TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY

AT3G54820.1 plasma membrane intrinsic protein 2;51.1e-1629.08Show/hide
Query:  AHELFSPQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPKLL-----------IPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFMSPIFAFIAALRGVITFTRAA
        A EL     ++A + E +AT L ++    +++     +++DP L            I  A   ++F+ +  T  +SGG ++P   F   L   +T  RA 
Subjt:  AHELFSPQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPKLL-----------IPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFMSPIFAFIAALRGVITFTRAA

Query:  VYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLGLPMVCGMIAGSSAVAVFVST-
        +Y++AQCLG+I    L+K A       +Y  G       G + G  I T +  E   TFV++Y   +    ++ +    +P++  +  G +   V ++T 
Subjt:  VYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLGLPMVCGMIAGSSAVAVFVST-

Query:  TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY
         IT      G G+NPAR LG A++    + W+ HW+FWVGPF  AA  A+Y
Subjt:  TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCATCAATGGCGGCCACTGGACCTGCCGAGGAGGAGGGGCTTGCTTTGCCGGCTGGCGACGGAGGAAGCTCTGGTGGAGATCACGCCTCCTTTCTCTCCACCTTTCT
TCTTTACATTGGTGCCCACGAGCTTTTCTCGCCACAGATGTGGAAAGCGGCCATGACAGAGTTGGTAGCAACAGCCTTGCTGGTATTTTGCTTAACAACTTCCATCGTCT
CGTGCTTGAAATCCAACGAATCAGATCCAAAGCTCTTAATCCCAATCGCCGTTTTCATCATCCTCTTCCTCTTCCTCCTCGTCACTTTCCCTCTCTCCGGCGGTTTCATG
AGCCCCATTTTCGCCTTCATCGCCGCCCTAAGAGGCGTCATAACCTTCACTCGCGCCGCCGTCTACATTCTCGCTCAATGTCTCGGCTCCATCATTGCCTTTCTCCTAAT
CAAGGACGCAATGAGCCCCGATGTTGCCGACAAGTACTCTCTCGGCGGCTGCACCATCCATGGCACCGGCGACACCCCTGGCATCGGTATCGCCACGGCTCTAGTTCTCG
AATTCGCCTGCACCTTCGTGGTTCTCTATGTCGGAGTGACGGTGGTGCTCGACCAGAAGATGAGCGAGCGGCTCGGTCTGCCGATGGTGTGCGGAATGATCGCGGGGAGT
TCGGCGGTGGCGGTTTTCGTGTCGACGACGATTACAGGGCGGGCTGGGTACGGTGGGGTGGGGCTGAATCCGGCGAGGTGTTTAGGGCCGGCGGTGTTGAGAGGAGGACG
GTTGTGGGAGGGGCATTGGGTGTTTTGGGTGGGGCCGTTTGCGGCGTGTGTGGCTTATTATGGATTTTCGGTCAATTTGCCGACGGCGCCGTTGGTTGGAGCGAAGGGGG
ATATCGGGATTTTGAAAATGGCCGGCAGTTGTTGGCGGTGGCGCCGCCGCCGGAGGTTGGAAGAAAAGTTAGGGCAAAATGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTTCCTTGTTAGCAAGAGAACAATGAATATTCTATGCTAAAGGACAAACAAACAAAGCTTGTCTGTTTATCAATTTGAGTGCCTAATTTTAGGAGCCGACAGGTCTT
GGTTGGATGCCATCAATGGCGGCCACTGGACCTGCCGAGGAGGAGGGGCTTGCTTTGCCGGCTGGCGACGGAGGAAGCTCTGGTGGAGATCACGCCTCCTTTCTCTCCAC
CTTTCTTCTTTACATTGGTGCCCACGAGCTTTTCTCGCCACAGATGTGGAAAGCGGCCATGACAGAGTTGGTAGCAACAGCCTTGCTGGTATTTTGCTTAACAACTTCCA
TCGTCTCGTGCTTGAAATCCAACGAATCAGATCCAAAGCTCTTAATCCCAATCGCCGTTTTCATCATCCTCTTCCTCTTCCTCCTCGTCACTTTCCCTCTCTCCGGCGGT
TTCATGAGCCCCATTTTCGCCTTCATCGCCGCCCTAAGAGGCGTCATAACCTTCACTCGCGCCGCCGTCTACATTCTCGCTCAATGTCTCGGCTCCATCATTGCCTTTCT
CCTAATCAAGGACGCAATGAGCCCCGATGTTGCCGACAAGTACTCTCTCGGCGGCTGCACCATCCATGGCACCGGCGACACCCCTGGCATCGGTATCGCCACGGCTCTAG
TTCTCGAATTCGCCTGCACCTTCGTGGTTCTCTATGTCGGAGTGACGGTGGTGCTCGACCAGAAGATGAGCGAGCGGCTCGGTCTGCCGATGGTGTGCGGAATGATCGCG
GGGAGTTCGGCGGTGGCGGTTTTCGTGTCGACGACGATTACAGGGCGGGCTGGGTACGGTGGGGTGGGGCTGAATCCGGCGAGGTGTTTAGGGCCGGCGGTGTTGAGAGG
AGGACGGTTGTGGGAGGGGCATTGGGTGTTTTGGGTGGGGCCGTTTGCGGCGTGTGTGGCTTATTATGGATTTTCGGTCAATTTGCCGACGGCGCCGTTGGTTGGAGCGA
AGGGGGATATCGGGATTTTGAAAATGGCCGGCAGTTGTTGGCGGTGGCGCCGCCGCCGGAGGTTGGAAGAAAAGTTAGGGCAAAATGTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPSMAATGPAEEEGLALPAGDGGSSGGDHASFLSTFLLYIGAHELFSPQMWKAAMTELVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPKLLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFM
SPIFAFIAALRGVITFTRAAVYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVADKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSERLGLPMVCGMIAGS
SAVAVFVSTTITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPFAACVAYYGFSVNLPTAPLVGAKGDIGILKMAGSCWRWRRRRRLEEKLGQNV