CuGenDBv2

Gene ID	Cmc00g0001111
Organism	Cucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Description	Protein Ycf2
Genome location	CMiso1.1chr00:1129677..1130988
RNA-Seq Expression	Cmc00g0001111
Synteny	Cmc00g0001111
Gene Ontology terms	GO:0009570 - chloroplast stroma (cellular component) GO:0016020 - membrane (cellular component) GO:0005524 - ATP binding (molecular function) GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR008543 - Uncharacterised protein family Ycf2

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

QIT04093.1 Ycf2 protein [Luffa aegyptiaca]

3.0e-229

91.45

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDDQIRKDHDWELF R SPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLFFSWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ              R++FDSISNEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQ++NHPLPEEI EFLGNPTRSIRSFFSDRWSEL+MGSNPI+RSTRDQKLLKKE
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE

Query:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT
        QD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEER +EMADLFT
Subjt:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT

Query:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

QJD26513.1 Ycf2 [Trichosanthes kirilowii var. japonica]

3.0e-229

91.45

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDDQIRKDHDWELF R SPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLFFSWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ              R++FDSISNEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQ++NHPLPEEI EFLGNPTRSIRSFFSDRWSEL+MGSNPI+RSTRDQKLLKKE
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE

Query:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT
        QD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEER +EMADLFT
Subjt:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT

Query:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

YP_009317429.1 Ycf2 [Coccinia grandis]

1.3e-229

91.69

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDDQIRKDHDWELF R SPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLFFSWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ              R++FDSISNEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQ++NHPLPEEI EFLGNPTRSIRSFFSDRWSEL+MGSNPIQRSTRDQKLLKKE
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE

Query:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT
        QD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEER +EMADLFT
Subjt:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT

Query:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

YP_009560879.1 Ycf2 [Trichosanthes kirilowii]

3.0e-229

91.45

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDDQIRKDHDWELF R SPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLFFSWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ              R++FDSISNEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQ++NHPLPEEI EFLGNPTRSIRSFFSDRWSEL+MGSNPI+RSTRDQKLLKKE
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE

Query:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT
        QD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEER +EMADLFT
Subjt:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT

Query:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

YP_009752033.1 Ycf2 protein [Cionosicys macranthus]

3.0e-229

91.45

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDDQIRKDHDWELF R SPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLFFSWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ              R++FDSISNEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQ++NHPLPEEI EFLGNPTRSIRSFFSDRWSEL+MGSNPI+RSTRDQKLLKKE
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE

Query:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT
        QD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEER +EMADLFT
Subjt:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT

Query:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A2Z2CLN7 Protein Ycf2

6.4e-230

91.69

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDDQIRKDHDWELF R SPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLFFSWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ              R++FDSISNEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQ++NHPLPEEI EFLGNPTRSIRSFFSDRWSEL+MGSNPIQRSTRDQKLLKKE
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE

Query:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT
        QD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEER +EMADLFT
Subjt:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT

Query:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

A0A410HFC5 Protein Ycf2

1.4e-229

91.45

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDDQIRKDHDWELF R SPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLFFSWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ              R++FDSISNEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQ++NHPLPEEI EFLGNPTRSIRSFFSDRWSEL+MGSNPI+RSTRDQKLLKKE
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE

Query:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT
        QD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEER +EMADLFT
Subjt:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT

Query:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

A0A6H0EY63 Protein Ycf2

1.4e-229

91.45

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDDQIRKDHDWELF R SPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLFFSWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ              R++FDSISNEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQ++NHPLPEEI EFLGNPTRSIRSFFSDRWSEL+MGSNPI+RSTRDQKLLKKE
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE

Query:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT
        QD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEER +EMADLFT
Subjt:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT

Query:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

A0A6M3RUH1 Protein Ycf2

1.4e-229

91.45

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDDQIRKDHDWELF R SPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLFFSWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ              R++FDSISNEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQ++NHPLPEEI EFLGNPTRSIRSFFSDRWSEL+MGSNPI+RSTRDQKLLKKE
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE

Query:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT
        QD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEER +EMADLFT
Subjt:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT

Query:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

A0A7G9IT80 Protein Ycf2

1.4e-229

91.45

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDDQIRKDHDWELF R SPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLFFSWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ              R++FDSISNEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQ++NHPLPEEI EFLGNPTRSIRSFFSDRWSEL+MGSNPI+RSTRDQKLLKKE
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE

Query:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT
        QD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEER +EMADLFT
Subjt:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT

Query:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A0ZZ78 Protein Ycf2

7.1e-218

87.07

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDD IRKDHDWELF R SP KRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSR KWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLF SWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWLVN+DRFFSKVRNV SNIQYDSTRSSFVQ              R+ FDSISNEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDRFPKC SGYSSMSRLFTEREK+++NH LPEEI EFLGNPTRSIRSFFSDRWSEL+ GSNP +RSTRDQKLLKKE
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE

Query:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT
        QD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVS HPISSDPGCDMVPKDEL   SSNKISFLNKNPF  LFHLFHD+NRRGYTLHHDFESEER +EMADLFT
Subjt:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT

Query:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        LSITEPDLVY+KGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

B1A978 Protein Ycf2

6.4e-219

87.3

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDD IRK HDWELF R SP KRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLF SWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNV SNIQYDSTRSSFVQ              R++FDSISNEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESD+FPKC SGYSSM RLFTEREK+++NH LPEEI EFLGNPTR IRSFFSDRWSEL++GSNP +RSTRDQKLLKKE
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE

Query:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT
        QD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSD GCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPF  LFHLFHDRNR G TLHHDFESEER +EMADLFT
Subjt:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT

Query:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

Q09WV7 Protein Ycf2

4.2e-218

87.13

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDD IRKDHDWELF R SPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIE EGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLFFSWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWL NKDRFFSKVRNV SNIQYDSTRSSFVQ              R++FDSI NEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEF--LGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLK
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDR PKC SGYSSMSRLFTEREKQ++NH LPEEI EF  LGN TRSIRSFFSDRWSEL++GSNP +RSTRD KLLK
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEF--LGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLK

Query:  KEQDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADL
        KEQD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPF  LFHLFHDRNR GYTLHHDFESEER +EMADL
Subjt:  KEQDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADL

Query:  FTLSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        FTLSITEPDLVYHKGFA SIDSY LDQKQF +EVF
Subjt:  FTLSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

Q0ZIV6 Protein Ycf2

3.5e-217

86.67

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDD I KDHDWELF R SPRKRRNIINLNSGQLFEILVK WICYL+ AFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLF SWGKNPHESDFLR +SRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNV SNIQYDSTRSSFVQ              R++FDSISNEDS+YHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYS--SMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLK
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDRFPKC SGYS  SMSRLFTEREKQ+  H LPEEI EFLGNPTRSIRSFFSDRWSEL++GSNPI+RSTRDQKLLK
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYS--SMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLK

Query:  KEQDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADL
        K+QD+SFVPSRRSE KE+VNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE DMDSSNKISFLNKNPF  LFHLFHDRNR GYTLHHDFESEER +EMAD 
Subjt:  KEQDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADL

Query:  FTLSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        FTLSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  FTLSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

Q2L949 Protein Ycf2

1.4e-218

87.3

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDD IRKDHDWELF R SP KRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGFFK+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSR KWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE
        QFRQDLF SWGKNPHESDFLR ISRENWIWLDNVWLVN+DRFFSKVRNV SNIQYDSTRSSFVQ              R+ FDSISNEDSEYHTLINQRE
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSEYHTLINQRE

Query:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE
        IQQLKERSILWDPSFLQ E  EIESDRFPKC SGYSSMSRLFTEREK+++NH LPEEI EFLGNPTRSIRSFFSDRWSEL++GSNP +RSTRDQKLLKKE
Subjt:  IQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKE

Query:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT
        QD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDEL   SSNKISFLNKNPF  LFHLFHD+NRRGYTLHHDFESEER +EMADLFT
Subjt:  QDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFT

Query:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        LSITEPDLVY+KGFAFSIDSYGLDQKQF +EVF
Subjt:  LSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG00860.1 Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core

5.6e-210

84.83

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDD IRK HDWELF R SP KRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGF K+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSE--YHTLINQ
        QF QDLF SWGKNPHESDF RKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNV SNIQYDSTRSSFVQ               + FDSISNEDSE  YHTLINQ
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSE--YHTLINQ

Query:  REIQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLK
        REIQQLKERSIL DPSF+Q EGREIESDRFPK  SGYSSM RLFTEREK+++NH LPEE  EFLGNPTR+IRSFFSDRWSEL++GSNP +RSTRDQKLLK
Subjt:  REIQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLK

Query:  KEQDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADL
        KEQD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSD GCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPF  LFHLFH+R R GYTL H  ESEER +EMADL
Subjt:  KEQDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADL

Query:  FTLSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        FTLSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQ+QF  EVF
Subjt:  FTLSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

ATCG01280.1 Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core

5.6e-210

84.83

Show/hide

Query:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW
        MDD IRK HDWELF R SP KRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYL+FAFREKIPIEVEGF K+QGAGSTIQSNDIEH+SHLFSRNKWAISLQNCAQF+MW
Subjt:  MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMW

Query:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSE--YHTLINQ
        QF QDLF SWGKNPHESDF RKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNV SNIQYDSTRSSFVQ               + FDSISNEDSE  YHTLINQ
Subjt:  QFRQDLFFSWGKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQ--------------RENFDSISNEDSE--YHTLINQ

Query:  REIQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLK
        REIQQLKERSIL DPSF+Q EGREIESDRFPK  SGYSSM RLFTEREK+++NH LPEE  EFLGNPTR+IRSFFSDRWSEL++GSNP +RSTRDQKLLK
Subjt:  REIQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSGYSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLK

Query:  KEQDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADL
        KEQD+SFVPSRRSE KEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSD GCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPF  LFHLFH+R R GYTL H  ESEER +EMADL
Subjt:  KEQDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADL

Query:  FTLSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF
        FTLSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQ+QF  EVF
Subjt:  FTLSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGATGATCAGATCCGCAAGGACCATGATTGGGAATTGTTTTCTCGTCCTTCTCCGAGGAAGAGGCGAAACATAATCAACTTGAATTCGGGACAGCTATTCGAAATCTT
AGTGAAAGACTGGATTTGTTATCTCATCTTTGCTTTTCGTGAAAAAATACCAATTGAAGTGGAGGGCTTCTTCAAAGAACAAGGAGCTGGGTCAACTATTCAATCAAATG
ATATTGAGCATCTTTCCCATCTCTTCTCGAGAAACAAGTGGGCTATTTCTTTGCAAAATTGTGCTCAATTTAATATGTGGCAATTCCGCCAAGATCTCTTCTTTAGTTGG
GGGAAGAATCCGCACGAATCGGATTTTTTGAGGAAGATATCGAGAGAGAATTGGATTTGGTTAGACAATGTGTGGTTGGTAAACAAGGATCGGTTTTTTAGCAAGGTACG
GAATGTCTTGTCAAATATTCAATATGATTCCACAAGATCTAGTTTCGTTCAAAGAGAGAATTTCGATTCCATTAGTAATGAGGATTCGGAATATCACACATTGATCAATC
AAAGAGAGATTCAACAACTAAAAGAAAGATCGATTCTTTGGGATCCTTCCTTTCTTCAAAGGGAAGGAAGAGAGATAGAATCAGACCGATTCCCTAAATGCTTTTCTGGA
TATTCCTCAATGTCCCGGCTATTCACGGAACGTGAGAAGCAGATTCATAATCATCCGCTTCCGGAAGAAATCTCAGAATTTCTCGGGAATCCTACAAGATCCATTCGTTC
TTTTTTCTCTGACAGATGGTCAGAACTGAATATGGGTTCGAATCCTATTCAGAGGTCCACTAGAGATCAGAAATTGTTGAAGAAAGAACAAGATCTTTCTTTTGTCCCTT
CCAGGCGATCGGAAAAGAAAGAAATAGTTAATATATTCAAGATAATTACGTATTTACAAAATACCGTCTCAATTCATCCTATTTCATCAGATCCGGGATGTGATATGGTT
CCGAAGGATGAACTGGATATGGACAGTTCCAATAAGATTTCATTCTTGAACAAAAATCCATTTATTTATTTATTTCATCTATTCCATGACCGGAACAGGAGGGGATACAC
CTTACACCACGATTTTGAATCAGAAGAGAGATTGAAAGAAATGGCAGATCTATTCACTCTATCAATAACCGAGCCGGATCTGGTGTATCATAAGGGATTTGCCTTTTCTA
TTGATTCCTACGGATTGGATCAAAAACAATTCTTTCATGAGGTATTCAAGGGATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MDDQIRKDHDWELFSRPSPRKRRNIINLNSGQLFEILVKDWICYLIFAFREKIPIEVEGFFKEQGAGSTIQSNDIEHLSHLFSRNKWAISLQNCAQFNMWQFRQDLFFSW
GKNPHESDFLRKISRENWIWLDNVWLVNKDRFFSKVRNVLSNIQYDSTRSSFVQRENFDSISNEDSEYHTLINQREIQQLKERSILWDPSFLQREGREIESDRFPKCFSG
YSSMSRLFTEREKQIHNHPLPEEISEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELNMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDLSFVPSRRSEKKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMV
PKDELDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERLKEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAFSIDSYGLDQKQFFHEVFKG

Cmc00g0001111 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome