; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc00g0001441 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc00g0001441
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionRibosomal protein L5
Genome locationCMiso1.1chr00:1467305..1467766
RNA-Seq ExpressionCmc00g0001441
SyntenyCmc00g0001441
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0015986 - ATP synthesis coupled proton transport (biological process)
GO:1902600 - proton transmembrane transport (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0045263 - proton-transporting ATP synthase complex, coupling factor F(o) (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0008289 - lipid binding (molecular function)
GO:0015078 - proton transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002132 - Ribosomal protein L5
IPR022803 - Ribosomal protein L5 domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AAP33159.1 ribosomal protein L5 [Cucumis sativus]1.3e-4488.89Show/hide
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AEN56134.1 ribosomal protein L5 [Cucumis melo subsp. melo]1.6e-52100Show/hide
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KAA0034876.1 ribosomal protein L5 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-52100Show/hide
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YP_009913650.1 ribosomal protein L5 [Luffa acutangula]2.1e-3986.27Show/hide
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A0A3S9JIG3 Ribosomal protein L57.9e-53100Show/hide
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A0A5A7SYB1 Ribosomal protein L5 (Mitochondrion)7.9e-53100Show/hide
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G3EIZ3 Ribosomal protein L51.0e-4791.67Show/hide
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G3EU44 Ribosomal protein L57.9e-53100Show/hide
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Q7Y6H0 Ribosomal protein L56.1e-4588.89Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
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P42793 60S ribosomal protein L5, mitochondrial7.7e-3777.88Show/hide
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P49388 60S ribosomal protein L5, mitochondrial1.0e-3374.51Show/hide
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Q05492 60S ribosomal protein L5, mitochondrial2.9e-3677.36Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07725.1 Ribosomal L5P family protein3.6e-4284.31Show/hide
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ATMG00210.1 ribosomal protein L53.6e-4284.31Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTCCGAGCCAACAACTCCAGTTTCATTACGAAGATATATCACGTCAGGATCCGTTGCTCAAACAGAATCACACCAACGTTATGGAAGTTCCTGGATCGTCT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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