; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc01g0010011 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc01g0010011
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionIsoleucyl-tRNA synthetase
Genome locationCMiso1.1chr01:4637149..4641235
RNA-Seq ExpressionCmc01g0010011
SyntenyCmc01g0010011
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044582.1 isoleucine--tRNA ligase [Cucumis melo var. makuwa]5.6e-0593.1Show/hide
Query:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
        +IVNRI+KLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
Subjt:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
TYK17001.1 isoleucine--tRNA ligase [Cucumis melo var. makuwa]5.6e-0593.1Show/hide
Query:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
        +IVNRI+KLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
Subjt:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
XP_004152106.1 isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic [Cucumis sativus]5.6e-0593.1Show/hide
Query:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
        +IVNRI+KLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
Subjt:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
XP_008453992.2 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic-like [Cucumis melo]5.6e-0593.1Show/hide
Query:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
        +IVNRI+KLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
Subjt:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
XP_038898074.1 isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic isoform X2 [Benincasa hispida]1.3e-0489.66Show/hide
Query:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
        +IVNRI+KLRKKAALEPTDTVEVYF+SQD
Subjt:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KTX5 Isoleucyl-tRNA synthetase2.7e-0593.1Show/hide
Query:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
        +IVNRI+KLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
Subjt:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
A0A1S3BX29 Isoleucyl-tRNA synthetase2.7e-0593.1Show/hide
Query:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
        +IVNRI+KLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
Subjt:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
A0A5A7TMQ4 Isoleucyl-tRNA synthetase2.7e-0593.1Show/hide
Query:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
        +IVNRI+KLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
Subjt:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
A0A5D3CYE1 Isoleucyl-tRNA synthetase2.7e-0593.1Show/hide
Query:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
        +IVNRI+KLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
Subjt:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
A0A6J1IPC3 Isoleucyl-tRNA synthetase7.9e-0589.66Show/hide
Query:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
        +IVNRI+KLRKKAALEPTD+VEVYFRSQD
Subjt:  QIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JLM5 Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic3.8e-0455.1Show/hide
Query:  LVVIVTLSFPSLLV---YPFQIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
        ++VI+ L     LV   +  +IVNRI+KLRKK+ LEPTD VEVYF+S D
Subjt:  LVVIVTLSFPSLLV---YPFQIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G10320.1 tRNA synthetase class I (I, L, M and V) family protein2.7e-0555.1Show/hide
Query:  LVVIVTLSFPSLLV---YPFQIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD
        ++VI+ L     LV   +  +IVNRI+KLRKK+ LEPTD VEVYF+S D
Subjt:  LVVIVTLSFPSLLV---YPFQIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTAACTTGTTTAAAGTTGGTTGTAATAGTCACATTGTCATTTCCTAGCTTACTAGTTTATCCGTTTCAGATTGTTAATAGAATCAAGAAGTTAAGGAAGAAAGCTGC
CCTTGAACCTACAGATACAGTAGAAGTGTATTTTCGATCACAAGATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCTTTTATTCTCTTCTCAATCTCATCTCACTTTAATCCCTCTCTTCTCTGAACGGCAAGCGCCGCCACCATCTTTAGAAGAAATCTCTCGTGCCCGGTCGTTATCGAA
CCCACCATCATCGTCCCTCGTGTCCAACCCGTACCTTGTCATTGTCGAACAGTCCTTCTTCGACTATCGTTGTGCTCACCACCACCGTCGATTCAAACATTTCTACATTT
CTATTTAAGTACAAAAGAAAAGAAGAAGTCGAAGGGATAAAATTTTGTCGTTGGCGCAAAAATTTTCGAGGCAATGTTCTAACGTTTCAGTAGAAGATATGGGAGAACCC
ATTTGCATGACTTTGGTCGTTGCCGCCGGTAACAAAATACTTCAGAAGAAGGGAACCGTCATTTTCTTTTTCACATTTTTTAGCATGAGAGATTGAATTTTCTTTATGAA
TTGGGTTTGAAAGTTGGAAAAGCTAGCAATTCCGATGGATTTAAAAGCCTTGAAACCCTACTTAGTTCAACTATTGCCGCGACTGCCACTGAACCATCTAGTTCTAAGGT
GAAATAGAAATATAAGGTTTGCCACGGAGTGTAACATTTACGAAATTGTGCTTTCTTTGGTTTTTGACTTTTGGTTTTTGCTTCGTCTTTGTGCAATCTACATGGCAGCT
TGAAAGGTGGAAATGACCATATAGATAGATGGTCAGACGATCGTTGAAGGTTGAAGACTGAAAAGACGTTTGGTCGTGGGTATCTTGCATTTTTCGTGCTTGATCTCTGT
ATATGATATACTATGACCACAAATACTTTGTACCATGTTAACTTGTTTAAAGTTGGTTGTAATAGTCACATTGTCATTTCCTAGCTTACTAGTTTATCCGTTTCAGATTG
TTAATAGAATCAAGAAGTTAAGGAAGAAAGCTGCCCTTGAACCTACAGATACAGTAGAAGTGTATTTTCGATCACAAGATTAGGATACATCACTAGCACACAGAGACATC
AAAGTCCAATTTCTTTTAAATCTTTTGCAGTTTTTTAAACGATGTATATATGGAAAGGTTTCTTCTGCATTTTTCTTTTCTTATGTTTGTGGGAATTTCTTGTTAATGCT
AGGTTCACATCTTCATTTCAACCTAATTTCCAAAGAAACAACCTTTTCTAGTGCTGCAAAGTTCTCATGTAATGTAATTTTGCCTTGAATCTTGAAAACTCTTGTGTATA
TCGGCTTTGGTTTGTAGTTAGATATGACTAATGCCATAAACATGCTTGTACGTTTCTCTCCTTTGGACGTCCAACTCGACTTCATAGTTTAACCTTTTCAGATTAGATTA
ATTCAATGTTGAAATAGTATAAAGTGTCTCAGTTTATAATCTTGCTATCCAAAAAATAAAATACCATAGATAAACATTTTATGCTTCTTCTACATTTACATTTTACATAT
ATTAAGCTCTTTTTTATGTGTGGAATAGAATAACCGTAGATTAACAAATGCTTTGCTTTAATTGAACAGGTGAACTAGGGGCATCTGGTTATTGATGTGTTTGTTAAGAT
GAAGAAGGTCTTTGATCAAACTGTTAGCGACTAAATGATTGAAGACATATCAGGTTGAAAGTGAAGCGATTGTGTAGATAGCCAGGCTATTGTTGAAGGTTGAAGATTGA
GAAGGCGTTTAGAATTTCATATTTAAGTCTTGTATTAAGATCTTGTTTCATGTACTCTTGTAGAATGTATATAAATACACAATATTGAGATTTCATTTTGTGTATACAAA
TGTAAAAGACAAATATTATAGTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLTCLKLVVIVTLSFPSLLVYPFQIVNRIKKLRKKAALEPTDTVEVYFRSQD