| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0035157.1 gag-pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.0e-81 | 88.59 | Show/hide |
Query: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
MNDE+DETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSD GKSLKKS EEI+NKKS+LIPSAHVKKNHPASSII DPS GMQTRRKDKIDYLKMVA+LCYISTIE T
Subjt: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Query: VD-SALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
VD SALKDEYWLNAMQEELLQ+R+NNVW LV KP GVNVIGTK+IFKNK+DE GCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETF+PVA
Subjt: VD-SALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
|
|
| KAA0048227.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.0e-93 | 99.45 | Show/hide |
Query: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Subjt: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Query: VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFS VA
Subjt: VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
|
|
| TYK08028.1 gag-pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.5e-92 | 100 | Show/hide |
Query: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Subjt: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Query: VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFS
VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFS
Subjt: VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFS
|
|
| TYK13607.1 gag-pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.2e-80 | 85.25 | Show/hide |
Query: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
MND++DETPNMSE RTTSTVE SKADN SD PGKSLKKSSEEI+ KKSELIPSAHVKKNHPASSII DPS GMQTRRK+KIDY+KMV +LCY STIE T
Subjt: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Query: VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
VDSALKDEYWLNAMQEELLQ+RQNNVWTLVSKPE VNVIGTK +FKNK+ E GCVTKNKARLVAQGYTQV+G+DFDETF+PVA
Subjt: VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
|
|
| TYK29237.1 gag-pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.5e-78 | 86.96 | Show/hide |
Query: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
MNDE+DETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSD P KSLKKSSEEI+NKKS+LI SAHVKKNHPASSII DPS GMQTRRKDKIDYLKMVA+LCYIS+IE T
Subjt: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Query: VD-SALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
VD SA KDEYWLNAMQEELL+ R NNVW LV KP GVNVIGTK+IFKNK+DE GCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETF+PVA
Subjt: VD-SALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7T0Q0 Gag-pol polyprotein | 9.7e-82 | 88.59 | Show/hide |
Query: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
MNDE+DETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSD GKSLKKS EEI+NKKS+LIPSAHVKKNHPASSII DPS GMQTRRKDKIDYLKMVA+LCYISTIE T
Subjt: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Query: VD-SALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
VD SALKDEYWLNAMQEELLQ+R+NNVW LV KP GVNVIGTK+IFKNK+DE GCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETF+PVA
Subjt: VD-SALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
|
|
| A0A5A7U1W3 Putative mitochondrial protein | 1.4e-93 | 99.45 | Show/hide |
Query: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Subjt: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Query: VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFS VA
Subjt: VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
|
|
| A0A5D3CA21 Gag-pol polyprotein | 7.2e-93 | 100 | Show/hide |
Query: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Subjt: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Query: VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFS
VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFS
Subjt: VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFS
|
|
| A0A5D3CNZ6 Gag-pol polyprotein | 1.1e-80 | 85.25 | Show/hide |
Query: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
MND++DETPNMSE RTTSTVE SKADN SD PGKSLKKSSEEI+ KKSELIPSAHVKKNHPASSII DPS GMQTRRK+KIDY+KMV +LCY STIE T
Subjt: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Query: VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
VDSALKDEYWLNAMQEELLQ+RQNNVWTLVSKPE VNVIGTK +FKNK+ E GCVTKNKARLVAQGYTQV+G+DFDETF+PVA
Subjt: VDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
|
|
| A0A5D3DZD2 Gag-pol polyprotein | 1.7e-78 | 86.96 | Show/hide |
Query: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
MNDE+DETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSD P KSLKKSSEEI+NKKS+LI SAHVKKNHPASSII DPS GMQTRRKDKIDYLKMVA+LCYIS+IE T
Subjt: MNDEKDETPNMSEVRTTSTVEESKADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLT
Query: VD-SALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
VD SA KDEYWLNAMQEELL+ R NNVW LV KP GVNVIGTK+IFKNK+DE GCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETF+PVA
Subjt: VD-SALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04146 Copia protein | 6.0e-12 | 41.89 | Show/hide |
Query: WLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
W A+ EL ++ NN WT+ +PE N++ ++++F K +E G + KARLVA+G+TQ +D++ETF+PVA
Subjt: WLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPVA
|
|
| P10978 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 1.5e-07 | 30 | Show/hide |
Query: PNMSEVRTTS---TVEESKADNSS---DGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLTVD
PN + +TS T ES D S + PG+ +++ E++ E+ ++ H P V ++RR +Y+ + + S E L
Subjt: PNMSEVRTTS---TVEESKADNSS---DGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSVGMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIESLTVD
Query: SALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPV
S + + AMQEE+ ++N + LV P+G + K++FK K D + + KARLV +G+ Q +G+DFDE FSPV
Subjt: SALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPV
|
|
| P92520 Uncharacterized mitochondrial protein AtMg00820 | 1.2e-15 | 44.64 | Show/hide |
Query: MQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTI--ESLTVDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQV
M TR K I+ L +L +TI E +V ALKD W AMQEEL +N W LV P N++G K++FK K G + + KARLVA+G+ Q
Subjt: MQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTI--ESLTVDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLVSKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQV
Query: EGVDFDETFSPV
EG+ F ET+SPV
Subjt: EGVDFDETFSPV
|
|
| Q94HW2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 | 4.6e-12 | 34.73 | Show/hide |
Query: ADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSV------GMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIES--LTVDSALKDEYWLNAMQE
A +SS P + SS + S PS + P + I+++ + M TR K I +L ES T ALKDE W NAM
Subjt: ADNSSDGPGKSLKKSSEEIVNKKSELIPSAHVKKNHPASSIISDPSV------GMQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTIES--LTVDSALKDEYWLNAMQE
Query: ELLQYRQNNVWTLVSKPEG-VNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPV
E+ N+ W LV P V ++G ++IF K + G + + KARLVA+GY Q G+D+ ETFSPV
Subjt: ELLQYRQNNVWTLVSKPEG-VNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGYTQVEGVDFDETFSPV
|
|
| Q9ZT94 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 | 4.6e-12 | 39.13 | Show/hide |
Query: MQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTI----ESLTVDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLV-SKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGY
M TR KD I K Y +++ E T A+KD+ W AM E+ N+ W LV P V ++G ++IF K + G + + KARLVA+GY
Subjt: MQTRRKDKIDYLKMVANLCYISTI----ESLTVDSALKDEYWLNAMQEELLQYRQNNVWTLV-SKPEGVNVIGTKYIFKNKSDETGCVTKNKARLVAQGY
Query: TQVEGVDFDETFSPV
Q G+D+ ETFSPV
Subjt: TQVEGVDFDETFSPV
|
|
