; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc01g0018901 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc01g0018901
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionPolyprenol reductase
Genome locationCMiso1.1chr01:16556654..16557484
RNA-Seq ExpressionCmc01g0018901
SyntenyCmc01g0018901
Gene Ontology termsGO:0006488 - dolichol-linked oligosaccharide biosynthetic process (biological process)
GO:0016095 - polyprenol catabolic process (biological process)
GO:0019408 - dolichol biosynthetic process (biological process)
GO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component)
GO:0003865 - 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase activity (molecular function)
GO:0102389 - polyprenol reductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR039698 - Polyprenol reductase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004148545.1 polyprenol reductase 2 [Cucumis sativus]1.1e-5684.06Show/hide
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XP_008444886.1 PREDICTED: polyprenol reductase 2 [Cucumis melo]1.7e-5784.06Show/hide
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XP_022971054.1 polyprenol reductase 2-like [Cucurbita maxima]2.9e-5277.54Show/hide
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XP_038888380.1 polyprenol reductase 2 isoform X1 [Benincasa hispida]1.3e-5279.71Show/hide
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XP_038888381.1 polyprenol reductase 2 isoform X2 [Benincasa hispida]1.3e-5279.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K5R7 Polyprenol reductase5.4e-5784.06Show/hide
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A0A1S3BBF0 Polyprenol reductase8.4e-5884.06Show/hide
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A0A6J1C196 Polyprenol reductase1.9e-4168.84Show/hide
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        FIV+ KRHM DVE+   D +IPL+NLGW Q IGA LFF
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A0A6J1F6C0 Polyprenol reductase4.9e-5075.36Show/hide
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A0A6J1I5R2 Polyprenol reductase1.4e-5277.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XWN6 Polyprenol reductase 11.3e-2849.62Show/hide
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B8B6G5 Polyprenol reductase 25.3e-2547.37Show/hide
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Q7F0Q2 Polyprenol reductase 25.3e-2547.37Show/hide
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Q7XUH5 Polyprenol reductase 11.3e-2849.62Show/hide
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Q9SI62 Polyprenol reductase 23.0e-2850Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G72590.1 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase family protein2.7e-2444.76Show/hide
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AT2G16530.1 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase family protein2.1e-2950Show/hide
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AT2G16530.2 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase family protein2.1e-2950Show/hide
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        I   K H    E + L ++ PL  LG  QWIG  +F
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCATATGTATCAACCCCAAAAATCTCAGATCCATTTAACTTTCCTGCCATTACCGGAGTTGACTGGAGGTTTGAGTTTGTTTCCATGGCAAAATTCTCATTCATCTCG
GAGGGAACATGGATTCTTGGTCTGGAAAGCGGTTTTTCTGCTTTTATTAATGGAAGTTCAAGTCCTGAGACATCTTTATGAAACAATATACGTTTTCAACTACAGTCCCT
CGGCTCGAATGCACATCTTTGGATATTTAACTGGCTTGTTTTCAATCCTGACGACTAGAGGCTTGTTATCTCCTTTATCACTTTGTAGCAATTGTATTCTAGAAGTGTAT
CACTTTGCCGCAAGTGGGCTAGCCCAATTTATTGTTCAAAGAAAAAGGCATATGCATGATGTTGAAATTAGCCCGTTGGATGCTATGATTCCTCTATCAAATTTAGGGTG
GCGTCAATGGATTGGTGCAACTTTATTCTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCATATGTATCAACCCCAAAAATCTCAGATCCATTTAACTTTCCTGCCATTACCGGAGTTGACTGGAGGTTTGAGTTTGTTTCCATGGCAAAATTCTCATTCATCTCG
GAGGGAACATGGATTCTTGGTCTGGAAAGCGGTTTTTCTGCTTTTATTAATGGAAGTTCAAGTCCTGAGACATCTTTATGAAACAATATACGTTTTCAACTACAGTCCCT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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