; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc01g0025711 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc01g0025711
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionTy3/gypsy retrotransposon protein
Genome locationCMiso1.1chr01:26626560..26627291
RNA-Seq ExpressionCmc01g0025711
SyntenyCmc01g0025711
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0015074 - DNA integration (biological process)
GO:0098869 - cellular oxidant detoxification (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0004601 - peroxidase activity (molecular function)
GO:0030246 - carbohydrate binding (molecular function)
GO:0047938 - glucose-6-phosphate 1-epimerase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000477 - Reverse transcriptase domain
IPR041577 - Reverse transcriptase/retrotransposon-derived protein, RNase H-like domain
IPR043128 - Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
IPR043502 - DNA/RNA polymerase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0033837.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-10077.14Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        M DEDIEKT  RTH+GHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMN IFKPF RK VLVFFDDILVYS++  DH+ H+ KVLS+LR+H+LYAN+KKCSFAQHK+EYL
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGD-----AFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEI
        GH+ISGEGVEVD +KIKSI +WP PTNIKEVRGF  LT YYRRFVQNYG IAAPLTQLLK G          AF+QLKKAM SLP+LAL +F QPFEIE 
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGD-----AFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEI

Query:  DASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLA
        DAS YG GA+LIQA RP  YYSHTLALRDRARP YERELM+VVLA
Subjt:  DASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLA

KAA0034862.1 Transposon Tf2-9 polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-130100Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDASCY
        GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDASCY
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDASCY

Query:  GVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIV
        GVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIV
Subjt:  GVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIV

KAA0064684.1 tetratricopeptide repeat protein SKI3 [Cucumis melo var. makuwa]4.5e-10585.34Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        MV++DIEKTA RTH+GHYEFLVM FGLTNAPATFQALMNTIFKPF RKFVLVFFDDIL+YS++TVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQ KVEYL
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDIN-----GDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEI
        GHI+SGEGVEVD +KIKSITKWPKPTNIKEVRGF  LT YYRRFVQNYGAIAAPLTQLLK G         DAFE+LKKAMSSLP+LAL DFNQPFEI+ 
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDIN-----GDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEI

Query:  DASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRAR
        DAS YGVGAVLIQAKRPI YY+HTLALRDRAR
Subjt:  DASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRAR

KAA0067574.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]7.4e-10076.11Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        M D+DIEKTA RTH+GHYEFLVM FGLTNAPATFQAL+NTIFKPF RKFVLVFFDDIL+YS++  DHV HM KVLS+LR+HELYAN+KKC+FAQ K+EYL
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMG----DINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEID
        GH+ISGEGV VD +KIK+IT WP+PTNIKE+RGF  LT YYRRFV NYGAIAAPLTQL K G    +    AF++LK AM SLP+LAL DFNQPFEIE D
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMG----DINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEID

Query:  ASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLAVQR
        AS +GVGAVL+Q KRPI YY HTLA RDR RPVYERELM VVLAVQR
Subjt:  ASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLAVQR

TYJ96674.1 Transposon Tf2-9 polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-130100Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDASCY
        GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDASCY
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDASCY

Query:  GVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIV
        GVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIV
Subjt:  GVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SUI3 Transposon Tf2-9 polyprotein6.7e-131100Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDASCY
        GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDASCY
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDASCY

Query:  GVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIV
        GVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIV
Subjt:  GVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIV

A0A5A7SX47 Ty3/gypsy retrotransposon protein7.3e-10177.14Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        M DEDIEKT  RTH+GHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMN IFKPF RK VLVFFDDILVYS++  DH+ H+ KVLS+LR+H+LYAN+KKCSFAQHK+EYL
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGD-----AFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEI
        GH+ISGEGVEVD +KIKSI +WP PTNIKEVRGF  LT YYRRFVQNYG IAAPLTQLLK G          AF+QLKKAM SLP+LAL +F QPFEIE 
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGD-----AFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEI

Query:  DASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLA
        DAS YG GA+LIQA RP  YYSHTLALRDRARP YERELM+VVLA
Subjt:  DASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLA

A0A5A7VBR1 Tetratricopeptide repeat protein SKI32.2e-10585.34Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        MV++DIEKTA RTH+GHYEFLVM FGLTNAPATFQALMNTIFKPF RKFVLVFFDDIL+YS++TVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQ KVEYL
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDIN-----GDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEI
        GHI+SGEGVEVD +KIKSITKWPKPTNIKEVRGF  LT YYRRFVQNYGAIAAPLTQLLK G         DAFE+LKKAMSSLP+LAL DFNQPFEI+ 
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDIN-----GDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEI

Query:  DASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRAR
        DAS YGVGAVLIQAKRPI YY+HTLALRDRAR
Subjt:  DASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRAR

A0A5D3BBH4 Ty3/gypsy retrotransposon protein3.6e-10076.11Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        M D+DIEKTA RTH+GHYEFLVM FGLTNAPATFQAL+NTIFKPF RKFVLVFFDDIL+YS++  DHV HM KVLS+LR+HELYAN+KKC+FAQ K+EYL
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMG----DINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEID
        GH+ISGEGV VD +KIK+IT WP+PTNIKE+RGF  LT YYRRFV NYGAIAAPLTQL K G    +    AF++LK AM SLP+LAL DFNQPFEIE D
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMG----DINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEID

Query:  ASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLAVQR
        AS +GVGAVL+Q KRPI YY HTLA RDR RPVYERELM VVLAVQR
Subjt:  ASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLAVQR

A0A5D3BCG7 Transposon Tf2-9 polyprotein6.7e-131100Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDASCY
        GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDASCY
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDASCY

Query:  GVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIV
        GVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIV
Subjt:  GVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.61.0e-4338.96Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        M  E + KTA  T  GHYE+L M FGL NAPATFQ  MN I +P   K  LV+ DDI+V+S    +H++ +  V   L +  L     KC F + +  +L
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMG---DING----DAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEI
        GH+++ +G++ + +KI++I K+P PT  KE++ F  LT YYR+F+ N+  IA P+T+ LK     D        AF++LK  +S  P+L + DF + F +
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMG---DING----DAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEI

Query:  EIDASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLAVQ
          DAS   +GAVL Q   P++Y S TL   +      E+EL+ +V A +
Subjt:  EIDASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLAVQ

P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein1.4e-3232.53Show/hide
Query:  DIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYLGHII
        D  K A R  +G +E+LVM +G++ APA FQ  +NTI        V+ + DDIL++S+   +HV+H++ VL  L+   L  N+ KC F Q +V+++G+ I
Subjt:  DIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYLGHII

Query:  SGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMG------DINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDAS
        S +G     + I  + +W +P N KE+R F     Y R+F+     +  PL  LLK             A E +K+ + S P+L   DF++   +E DAS
Subjt:  SGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMG------DINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDAS

Query:  CYGVGAVLIQAK-----RPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLAVQ
           VGAVL Q        P+ YYS  ++       V ++E++ ++ +++
Subjt:  CYGVGAVLIQAK-----RPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLAVQ

P10401 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon gypsy5.8e-3934.36Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        + + D EKT+   + G YEF  + FGL NA + FQ  ++ + +    K   V+ DD++++S +  DHV H+  VL  L +  +  +++K  F +  VEYL
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLK-----------------MGDINGDAFEQLKKAMSSLP-ML
        G I+S +G + D +K+K+I ++P+P  + +VR F  L  YYR F++++ AIA P+T +LK                   +   +AF++L+  ++S   +L
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLK-----------------MGDINGDAFEQLKKAMSSLP-ML

Query:  ALLDFNQPFEIEIDASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLAV
           DF +PF++  DAS  G+GAVL Q  RPIT  S TL   ++     EREL+ +V A+
Subjt:  ALLDFNQPFEIEIDASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLAV

P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 2979.3e-4540.16Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        M +E I KTA  T  GHYE+L M FGL NAPATFQ  MN I +P   K  LV+ DDI+++S    +H+  ++ V + L +  L     KC F + +  +L
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMG---DING----DAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEI
        GHI++ +G++ +  K+K+I  +P PT  KE+R F  LT YYR+F+ NY  IA P+T  LK     D       +AFE+LK  +   P+L L DF + F +
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMG---DING----DAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEI

Query:  EIDASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLAVQ
          DAS   +GAVL Q   PI++ S TL   +      E+EL+ +V A +
Subjt:  EIDASCYGVGAVLIQAKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLAVQ

Q8I7P9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus6.2e-4135.52Show/hide
Query:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL
        M + DI KTA  T  G YEFL + FGL NAPA FQ +++ I +    K   V+ DDI+V+S D   H +++R VL+ L +  L  N +K  F   +VE+L
Subjt:  MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYL

Query:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQL-----------------LKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLA
        G+I++ +G++ D KK+++I++ P PT++KE++ F  +T YYR+F+Q+Y  +A PLT L                 + + +    +F  LK  + S  +LA
Subjt:  GHIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQL-----------------LKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLA

Query:  LLDFNQPFEIEIDASCYGVGAVLIQ----AKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVV
           F +PF +  DAS + +GAVL Q      RPI Y S +L   +      E+E++ ++
Subjt:  LLDFNQPFEIEIDASCYGVGAVLIQ----AKRPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATMG00860.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein1.7e-3048.85Show/hide
Query:  VEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYLG--HIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDIN
        + H+  VL +  +H+ YAN+KKC+F Q ++ YLG  HIISGEGV  D  K++++  WP+P N  E+RGF  LT YYRRFV+NYG I  PLT+LLK   + 
Subjt:  VEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYLG--HIISGEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDIN

Query:  GD-----AFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPF
               AF+ LK A+++LP+LAL D   PF
Subjt:  GD-----AFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGGATGAGGATATTGAAAAAACGGCTTCCAGAACTCACAAGGGTCATTATGAGTTCTTAGTTATGCTTTTTGGGTTGACTAACGCACCAGCCACCTTTCAA
GCGTTGATGAATACAATATTTAAGCCCTTTTTTAGAAAATTTGTACTAGTATTCTTTGATGACATACTCGTCTACAGTAGGGACACAGTTGATCACGTGGAACAT
ATGAGAAAGGTGTTGTCCGTACTAAGAGAACATGAGTTGTACGCAAACAAGAAGAAATGTAGTTTTGCTCAGCATAAAGTGGAATATTTAGGCCATATTATATCC
GGAGAAGGGGTTGAAGTGGACTCGAAGAAGATCAAGTCAATTACTAAGTGGCCAAAACCTACGAACATCAAAGAAGTTAGAGGTTTTTTTAGGCTCACGAGGTAT
TATCGACGTTTTGTACAGAACTATGGAGCTATTGCAGCACCATTGACTCAGTTGTTGAAAATGGGGGATATAAATGGCGATGCATTTGAACAGCTTAAGAAGGCA
ATGTCATCCCTTCCAATGTTGGCACTACTAGACTTTAATCAGCCTTTTGAAATAGAAATTGATGCTTCATGCTATGGTGTTGGGGCAGTGCTAATTCAGGCAAAG
AGACCAATCACATACTACAGTCATACGTTAGCCTTGAGGGATAGAGCCCGGCCAGTGTACGAGAGGGAATTAATGATTGTGGTACTGGCCGTCCAACGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTGGATGAGGATATTGAAAAAACGGCTTCCAGAACTCACAAGGGTCATTATGAGTTCTTAGTTATGCTTTTTGGGTTGACTAACGCACCAGCCACCTTTCAA
GCGTTGATGAATACAATATTTAAGCCCTTTTTTAGAAAATTTGTACTAGTATTCTTTGATGACATACTCGTCTACAGTAGGGACACAGTTGATCACGTGGAACAT
ATGAGAAAGGTGTTGTCCGTACTAAGAGAACATGAGTTGTACGCAAACAAGAAGAAATGTAGTTTTGCTCAGCATAAAGTGGAATATTTAGGCCATATTATATCC
GGAGAAGGGGTTGAAGTGGACTCGAAGAAGATCAAGTCAATTACTAAGTGGCCAAAACCTACGAACATCAAAGAAGTTAGAGGTTTTTTTAGGCTCACGAGGTAT
TATCGACGTTTTGTACAGAACTATGGAGCTATTGCAGCACCATTGACTCAGTTGTTGAAAATGGGGGATATAAATGGCGATGCATTTGAACAGCTTAAGAAGGCA
ATGTCATCCCTTCCAATGTTGGCACTACTAGACTTTAATCAGCCTTTTGAAATAGAAATTGATGCTTCATGCTATGGTGTTGGGGCAGTGCTAATTCAGGCAAAG
AGACCAATCACATACTACAGTCATACGTTAGCCTTGAGGGATAGAGCCCGGCCAGTGTACGAGAGGGAATTAATGATTGTGGTACTGGCCGTCCAACGCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVDEDIEKTASRTHKGHYEFLVMLFGLTNAPATFQALMNTIFKPFFRKFVLVFFDDILVYSRDTVDHVEHMRKVLSVLREHELYANKKKCSFAQHKVEYLGHIIS
GEGVEVDSKKIKSITKWPKPTNIKEVRGFFRLTRYYRRFVQNYGAIAAPLTQLLKMGDINGDAFEQLKKAMSSLPMLALLDFNQPFEIEIDASCYGVGAVLIQAK
RPITYYSHTLALRDRARPVYERELMIVVLAVQR