; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc01g0030281 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc01g0030281
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionExopolygalacturonase-like
Genome locationCMiso1.1chr01:31299912..31300691
RNA-Seq ExpressionCmc01g0030281
SyntenyCmc01g0030281
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0004650 - polygalacturonase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0043575.1 exopolygalacturonase-like [Cucumis melo var. makuwa]2.8e-113100Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
        LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

KAA0048658.1 exopolygalacturonase-like [Cucumis melo var. makuwa]2.8e-113100Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
        LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

KAA0048661.1 exopolygalacturonase-like [Cucumis melo var. makuwa]2.8e-113100Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
        LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

XP_031745094.1 exopolygalacturonase-like [Cucumis sativus]1.2e-10895.48Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGT+LVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDIS YSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQG++VWPYNDCKKN  CQL
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
        LPISIKF+RLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTI NSVIGTGDDCVSIGHSTENI VTNVTCGPGHGL
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

XP_031745095.1 exopolygalacturonase-like [Cucumis sativus]1.2e-10895.48Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGT+LVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDIS YSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQG++VWPYNDCKKN  CQL
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
        LPISIKF+RLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTI NSVIGTGDDCVSIGHSTENI VTNVTCGPGHGL
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KMA6 Uncharacterized protein3.9e-10893.47Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGT+LVGPVTFAGPCKS+PITLENQGTVKATTDIS YSSPEWFS+EDITGFILTGSGVFDGQG++VWPYNDCKKN  CQL
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
        LPISIKF+RLNHTIVDGLTS+NSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTI NS+IGTGDDCVSIGHSTENI VTNVTCGPGHGL
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

A0A5A7TQ89 Exopolygalacturonase-like1.4e-113100Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
        LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

A0A5A7U0D6 Exopolygalacturonase-like1.4e-113100Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
        LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

A0A5A7U4W1 Exopolygalacturonase-like1.4e-113100Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
        LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

A0A5D3C9J8 Exopolygalacturonase-like6.2e-9886.43Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        +TTWI ACRNTVGPAK LIP+GTYLVGPVT AGPCKSFPITLENQGTVKATTDIS+YSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGV  WPYNDCK N  CQL
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
        LPISIKFSRLN TIVD LTS+NS GFH S+F CYNFTATN+ IIAPH+SPNTDG+HLSTSKLV I NS+IGTGDDCVSIGHSTE I VTNVTCGPGHGL
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P26216 Exopolygalacturonase1.0e-4443.65Show/hide
Query:  WIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSS-PEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQLLP
        W +AC  T G    LIP+G +LVG + F GPCK   +T++  G + ATTD+S+Y     W  I  +   ++TG G  DGQG  VW  N C K   C++LP
Subjt:  WIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSS-PEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQLLP

Query:  ISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
         S+    +N+  V G+T +NS  FH +++ C +    ++ + AP +SPNTDG+H+  S  +TITN+VIG GDDC+SIG  T  + +T VTCGPGHG+
Subjt:  ISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

P35338 Exopolygalacturonase2.0e-4544.16Show/hide
Query:  WIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSS-PEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQLLP
        W +AC  T G    LIP+G +LVG + F GPCK   +T++  G + ATTD+S+Y     W  I  +   ++TG G  DGQG  VW  N C K   C++LP
Subjt:  WIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSS-PEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQLLP

Query:  ISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
         S+    +N+  V G+T +NS  FH +++ C N    ++ + AP +SPNTDG+H+  S  +TITN+VIG GDDC+SIG  T  + +T VTCGPGHG+
Subjt:  ISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

P35339 Exopolygalacturonase5.3e-4644.67Show/hide
Query:  WIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSS-PEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQLLP
        W +AC  T G    LIP+G +LVGP+ F GPCK   +T++  G + ATTD+S+Y     W  I  +   ++TG G  DGQG  VW  N C K   C++LP
Subjt:  WIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSS-PEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQLLP

Query:  ISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
         S+    +N+  V G+T +NS  FH +++ C +    ++ + AP +SPNTDG+H+  S  VTITN+VIG GDDC+SIG  T  + +T VTCGPGHG+
Subjt:  ISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

P49062 Exopolygalacturonase clone GBGE1842.5e-4847.24Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        + TWI  C + V PA  L+P+GT+L GPV FAGPCKS  +T+   GT+ ATT  S Y++PEWF  E +   +LTG+G F G+G  VW  + C K   C L
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
         P S+KF  + +  ++G++SVN+  FH  +    N    N+K+ AP  SPNTDG+HLS +  V+I +S I TGDDCVS+G  + N+ V  V CGPGHGL
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

Q6H9K0 Exopolygalacturonase (Fragment)5.3e-4644.72Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        M  W AAC +  GP+  LIP+G Y +G V   GPCK   I  +  G VKA  D S++ S  W S   I G  ++G+G  DGQG T W  N+C KN  C+ 
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
          ++++F  L H +V  +TS+NS  FH +V  C + T  ++ + AP  S NTDG+H+  SK VTITN+ I TGDDC+SIG  ++N+ +T V CGPGHG+
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02790.1 polygalacturonase 41.8e-4947.24Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        + TWI  C + V PA  L+P+GT+L GPV FAGPCKS  +T+   GT+ ATT  S Y++PEWF  E +   +LTG+G F G+G  VW  + C K   C L
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
         P S+KF  + +  ++G++SVN+  FH  +    N    N+K+ AP  SPNTDG+HLS +  V+I +S I TGDDCVS+G  + N+ V  V CGPGHGL
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

AT2G26620.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.4e-4139.29Show/hide
Query:  WIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQLLPI
        W  AC+   G +K  +P+GT+ +G V F GPCK+ PI     GT+ A  + ++     W +   I    ++GSG  DGQG   WP NDC KN  C  L I
Subjt:  WIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQLLPI

Query:  SIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
        S+ F+ +N++ +  +TS+NS   H + F+ ++F  T + I AP +SPNTDG+ + +   + I+N+ IGTGDDC++I   T  + ++N+ CGPGHG+
Subjt:  SIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

AT3G07820.1 Pectin lyase-like superfamily protein9.6e-4342.21Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL
        +  + +AC+++  P+K +IP+G + +G +   GPCK+ PI +  QGTVKA  +  +    +W    +I GF L G G FDG+G   W  N+C K   C+ 
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQL

Query:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
        LPISI+F  + ++ +  ++S+++  FH +V    N T  N+KI+AP +SPNTDG+HL  S  V I NS I TGDDC+S+G   +N+ V  VTCGPGHG+
Subjt:  LPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL

AT4G18180.1 Pectin lyase-like superfamily protein5.4e-4643.28Show/hide
Query:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFP-ITLENQGTVKATTDISEY-SSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFC
        +  W  AC+++      +IP+G + VG + F+GPC +   +T+     VKA+TD+S+Y S   W     I G  LTG G FDGQG   WP+N+C  +  C
Subjt:  MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFP-ITLENQGTVKATTDISEY-SSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFC

Query:  QLLPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHG
        +LLP S+KF  +N T+V  ++SVNS  FH ++  C +F  T + I AP +SPNTDG+H+  S  V  + S I TGDDCVSIG     I +T++ CGPGHG
Subjt:  QLLPISIKFSRLNHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHG

Query:  L
        +
Subjt:  L

AT5G48140.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.1e-4145.6Show/hide
Query:  LIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQLLPISIKFSRLNHTIVDG
        +IP+G Y +G +   GPCK+ PI +   GTVKA  D +     +W +  +I GF L G GVFDG+G   W  N+C K   C+ LPISI+F  +    + G
Subjt:  LIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQLLPISIKFSRLNHTIVDG

Query:  LTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL
        +TS+++  FH +V    N T  ++KIIAP  SPNTDG+H+  S  + I NS I TGDDCVS+G   +N++V  VTCGPGHG+
Subjt:  LTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAACATGGATTGCAGCTTGCCGGAATACAGTCGGTCCGGCGAAGTTCTTGATCCCACAAGGCACATATCTGGTGGGTCCGGTGACTTTTGCCGGTCCGTGCAAAAG
CTTTCCGATCACCCTCGAAAATCAAGGAACTGTGAAGGCCACAACCGATATTAGTGAATATTCATCTCCTGAATGGTTCTCCATTGAAGATATTACTGGCTTCATCCTCA
CCGGCTCCGGCGTCTTTGACGGTCAAGGCGTCACCGTTTGGCCCTATAATGACTGCAAGAAAAACAGATTTTGCCAACTTCTTCCAATCTCGATTAAATTCTCGAGATTA
AATCACACGATCGTTGATGGGCTCACTTCAGTAAACAGCATGGGGTTCCACACTTCCGTATTCTACTGTTACAATTTCACTGCTACTAACATGAAAATTATAGCTCCACA
TAATAGTCCGAACACCGATGGAATGCACCTTAGCACCTCAAAATTGGTCACCATTACCAACAGTGTCATTGGCACCGGTGATGATTGTGTCTCCATCGGCCACAGTACTG
AGAATATCGTTGTCACCAATGTCACTTGCGGCCCAGGACATGGCCTCAGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACAACATGGATTGCAGCTTGCCGGAATACAGTCGGTCCGGCGAAGTTCTTGATCCCACAAGGCACATATCTGGTGGGTCCGGTGACTTTTGCCGGTCCGTGCAAAAG
CTTTCCGATCACCCTCGAAAATCAAGGAACTGTGAAGGCCACAACCGATATTAGTGAATATTCATCTCCTGAATGGTTCTCCATTGAAGATATTACTGGCTTCATCCTCA
CCGGCTCCGGCGTCTTTGACGGTCAAGGCGTCACCGTTTGGCCCTATAATGACTGCAAGAAAAACAGATTTTGCCAACTTCTTCCAATCTCGATTAAATTCTCGAGATTA
AATCACACGATCGTTGATGGGCTCACTTCAGTAAACAGCATGGGGTTCCACACTTCCGTATTCTACTGTTACAATTTCACTGCTACTAACATGAAAATTATAGCTCCACA
TAATAGTCCGAACACCGATGGAATGCACCTTAGCACCTCAAAATTGGTCACCATTACCAACAGTGTCATTGGCACCGGTGATGATTGTGTCTCCATCGGCCACAGTACTG
AGAATATCGTTGTCACCAATGTCACTTGCGGCCCAGGACATGGCCTCAGGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTTWIAACRNTVGPAKFLIPQGTYLVGPVTFAGPCKSFPITLENQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEDITGFILTGSGVFDGQGVTVWPYNDCKKNRFCQLLPISIKFSRL
NHTIVDGLTSVNSMGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTITNSVIGTGDDCVSIGHSTENIVVTNVTCGPGHGLR