; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc01g0033791 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc01g0033791
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionTransmembrane protein, putative
Genome locationCMiso1.1chr01:33689762..33692583
RNA-Seq ExpressionCmc01g0033791
SyntenyCmc01g0033791
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593392.1 hypothetical protein SDJN03_12868, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.5e-4071.54Show/hide
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XP_008461116.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499798 [Cucumis melo]4.9e-63100Show/hide
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XP_038899182.1 uncharacterized protein LOC120086544 [Benincasa hispida]1.1e-4983.2Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K8T0 Uncharacterized protein2.5e-5794.31Show/hide
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A0A1S3CE06 uncharacterized protein LOC1034997982.4e-63100Show/hide
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A0A6J1CXJ1 uncharacterized protein LOC1110151782.2e-4070.59Show/hide
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A0A6J1H516 uncharacterized protein LOC111460643 isoform X12.2e-4071.54Show/hide
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A0A6J1KZ93 uncharacterized protein LOC111497700 isoform X11.7e-4071.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G52550.1 unknown protein7.1e-1237.3Show/hide
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AT3G15780.1 unknown protein1.5e-1438.79Show/hide
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        A +++ P  ST  +H+     FSPP    R + +  +S    + +  +     PP  DPPP ED  +L GL    ++ +DRV+IFLAV FWM LFFW + 
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCATCGACCTCTCTCCACCGTTCTTCACACTCCGTTGCCGCCTCTTCAATCGCCCTTCCTCTCTGTTCAACCTTTCATTTCCGGTCGAAAATTTGCTTCTCTCCACC
TCGTCGCCGCCTTTCACCTCTTTTCTTCTCCTCCAATTCTTATGCTAAATCCGTCGTTTGCAGTGCAGCAGTACGGCCACCGCCGGACTCCGATCCGCCACCCGAGGAGG
ATCCGGTTCGTTTAACAGGTTTACCGGCAATTTTTTCAAAATTTCGGGACAGAGTACAAATTTTCCTTGCTGTGTTATTCTGGATGTCCCTCTTCTTCTGGACTTCTGCA
TTAGATGGGAAAAACAGGCCGAATAAAGGCTCTCGATTTAGACGATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTGCTCTCTTTCTCCTCTCTCAATGGCATCGACCTCTCTCCACCGTTCTTCACACTCCGTTGCCGCCTCTTCAATCGCCCTTCCTCTCTGTTCAACCTTTCATTTCCGG
TCGAAAATTTGCTTCTCTCCACCTCGTCGCCGCCTTTCACCTCTTTTCTTCTCCTCCAATTCTTATGCTAAATCCGTCGTTTGCAGTGCAGCAGTACGGCCACCGCCGGA
CTCCGATCCGCCACCCGAGGAGGATCCGGTTCGTTTAACAGGTTTACCGGCAATTTTTTCAAAATTTCGGGACAGAGTACAAATTTTCCTTGCTGTGTTATTCTGGATGT
CCCTCTTCTTCTGGACTTCTGCATTAGATGGGAAAAACAGGCCGAATAAAGGCTCTCGATTTAGACGATAGTTTCAAAAACAAGCATTCTTTTGTAAAGGATTGTAGGTT
TAGTATAAATAGTGCTAGGCTACTTGATTATACTTGAGATATAATTCAGCCTTTGACGAGGTAGATAAAGCTTGCTCCATAATGTTGATACCCTCCGCTGTATATTGGTG
TAGCCGCAAAGGAGATAAGGAAAGGCTATGAAACAAATTAAAGCAAAACTGTCATGGAAAGTCGTATTTAGTATTGTATTATATTGTTATCAAGTGTGTTGTATATTTCT
TGAACCCCCCCTCCCACCTCCCATACTCTGTTGTAAGGGACTAATCTTGTTATTGTCCTTGGACCTGCAGGGATCAGGCTAATCTTCTCTGTGTGGTTGCAGTTTTAATG
GATGTCTCTTGAGGGACAACTGACGAGTCTTTTCTCTTTTCTATAGATTGGTATTGGGTTTCATTGACAGGAATTTGGTTGATGGATGTATTAGAATTGTGTACAGGGAA
GTTGGAGCATGAGAATTGATGGGAGGAAGGAATGATCGGTTGGTTCGATATTAGAAATGATTGCCACTATGTGTTTGACACGTTGCTAATAGTTCAACGTTTTAATTGGT
CACGTTGTAATGTGATGGTGTTATGAAAAGATGAAAAAGATGGTTGGAGGATAAAGAGAAGTGATTTCTTATTATTGGATCATTACAATTCATCCCCATATGTTTTTCTA
AAATCCTTTTGTTTTATTTTATTTTATTATAGTGGGACAGGGAAGCTCATCATCACTCTAAAAGCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGGGTCTATTGTTCATGTTATAGTTTA
AACGTTTTATAAAGTTACCCAAATTGGTTTGTATTGTAATATTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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