; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc02g0040101 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc02g0040101
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionGATA transcription factor 21
Genome locationCMiso1.1chr02:1969944..1972269
RNA-Seq ExpressionCmc02g0040101
SyntenyCmc02g0040101
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000679 - Zinc finger, GATA-type
IPR013088 - Zinc finger, NHR/GATA-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK10096.1 GATA transcription factor 21 [Cucumis melo var. makuwa]1.8e-115100Show/hide
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XP_008450852.1 PREDICTED: GATA transcription factor 21 [Cucumis melo]6.6e-187100Show/hide
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XP_022967871.1 GATA transcription factor 21-like isoform X1 [Cucurbita maxima]4.2e-8561.38Show/hide
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        K           E ++ND+ HNDSVKW SSSSSSSSKI+ +IN N QTET   +TID+ RN QDLNP  PSPSPS  +QTNKR +      GGAIIRTCS
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        DCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAA    NGG   AVVLKTNKA+      KPA TM      KRK+K+ V   +       GGG 
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        + KLC E++KMG RL+EI+S+YQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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XP_038878562.1 GATA transcription factor 21 [Benincasa hispida]1.8e-13181.98Show/hide
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        TTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAA NG    AVVLK+NKAVQHKI TK A   TTTT LKRK KD VV   G GGGD GGGRK  
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        LCFEEIK+G RLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZE4 GATA-type domain-containing protein6.0e-15489.44Show/hide
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        TTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAA NGGAVV+KTNK VQHKITTKPATT      LKRKYKDEVVVV    GGDK GG + KLCF
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        EEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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A0A1S3BPL1 GATA transcription factor 213.2e-187100Show/hide
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        IKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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A0A5D3CI65 GATA transcription factor 218.5e-116100Show/hide
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        KTPLWRSGPRGPK
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A0A6J1ELP1 GATA transcription factor 21-like3.6e-8261.03Show/hide
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        K           E ++ND+ HNDSVKW SSSSSSSSKI+ +IN N QTE TPT+TID+ RN QDLNP  PSPSPS  +QTNKR    TL++ GGAIIRTC
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Query:  SDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAATNGGAVVLKTNKAVQHKITTKPATTMTTTTALKRKYKDEV----VVVSGHGGGDKGG
        SDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAA    N  AVVLKTNKA+      KPA TM      KRK+K+ V       +       GG
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        G + KLC E++KMG RLSEISS+YQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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A0A6J1HT96 GATA transcription factor 21-like isoform X12.1e-8561.38Show/hide
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        MAPPYRDSFPS+HD+L     SSS  HLFFP  TP  +S SS  S       H    D P S+   H E GG MGC NDQ    HE + E ETGL FTIW
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Query:  KQIDKRETSSCCENNNNDNTHNDSVKW-SSSSSSSSKIKFMINSNLQTETTPTRTIDSGRNVQDLNP--PSPSPSSIEQTNKRTSATTLHEGGAIIRTCS
        K           E ++ND+ HNDSVKW SSSSSSSSKI+ +IN N QTET   +TID+ RN QDLNP  PSPSPS  +QTNKR +      GGAIIRTCS
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Query:  DCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAATNGG---AVVLKTNKAVQHKITTKPATTMTTTTALKRKYKDEVVVVSGHGGGDKGGGR
        DCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAA    NGG   AVVLKTNKA+      KPA TM      KRK+K+ V   +       GGG 
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Query:  KAKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
        + KLC E++KMG RL+EI+S+YQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5HZ36 GATA transcription factor 214.6e-2633.16Show/hide
Query:  LHYSSSHHHLFFPIVTPAQASSSSSSSLSFTA-------------------LDHSMISDDPRSVELKHEGGGIMGCNNDQSIGNHEDHIEETGLRFTIWK
        LH+   HHH   P  + + +SSSS SSLS                       DH  +S  P   ++    GG   C       +H    +ET L+ TI K
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Query:  QIDKRETSSCCENNNNDNTHNDSVKWSSSSSSSSKIKFMINSNLQTETTPTRTIDSGRNVQDLNPPSPSPSSIEQ-----------TNKRTSAT------
        +  + +     +N    +  +DS KW   S     IK  I +N Q      +T ++     D  P +   +  E            T K T+AT      
Subjt:  QIDKRETSSCCENNNNDNTHNDSVKWSSSSSSSSKIKFMINSNLQTETTPTRTIDSGRNVQDLNPPSPSPSSIEQ-----------TNKRTSAT------

Query:  TLHEGG-----AIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAATNGGAVV------LKTNKAVQHKIT----------TKPAT
        T++E G      +IR CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRA   AAAAA +    V      L   K +Q+K            + P  
Subjt:  TLHEGG-----AIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAATNGGAVV------LKTNKAVQHKIT----------TKPAT

Query:  TMTTTTALKRKYKDEVVVVSGHGGGDKGGGRKA--------KLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
               +K + + E+   +  G  +      +        K CF+++ +   +   SS+YQ+VFPQDE+EAA+LLM LSYG++HG
Subjt:  TMTTTTALKRKYKDEVVVVSGHGGGDKGGGRKA--------KLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

Q6YW48 Protein CYTOKININ-RESPONSIVE GATA TRANSCRIPTION FACTOR 13.2e-1932.58Show/hide
Query:  ENNNNDNTHNDSVKWSSSSSSSSKIKFMINSNLQTETTPTRTIDSGRNVQDLNPPSPSPSSIEQTNKRTSATTLHEGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPR
        E+NN  + +  + KW S                 T     R I  G            P    Q ++  S   L +   ++R CSDCNTTKTPLWRSGP 
Subjt:  ENNNNDNTHNDSVKWSSSSSSSSKIKFMINSNLQTETTPTRTIDSGRNVQDLNPPSPSPSSIEQTNKRTSATTLHEGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPR

Query:  GPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAATNGGAVVLKTNKAVQHKITTKPA-----------------------------------TTMTTTTALKRKYKD
        GPKSLCNACGIRQRKARRAM    AAA NGGA V          +  KPA                                   T      A   K +D
Subjt:  GPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAATNGGAVVLKTNKAVQHKITTKPA-----------------------------------TTMTTTTALKRKYKD

Query:  EVVVVSGHGGGDKGGGRKAKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDE-REAAILLMTLSYGLLH
         V+VV G           A+    +       +  S ++    P+DE  +AA+LLMTLS GL+H
Subjt:  EVVVVSGHGGGDKGGGRKAKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDE-REAAILLMTLSYGLLH

Q8LC59 GATA transcription factor 231.4e-1167.39Show/hide
Query:  LHEGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRA
        + E    IR CS+C TTKTP+WR GP GPKSLCNACGIR RK RR+
Subjt:  LHEGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRA

Q9FJ10 GATA transcription factor 167.2e-1173.17Show/hide
Query:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAE
        +TC+DC T+KTPLWR GP GPKSLCNACGIR RK RR   E
Subjt:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAE

Q9SZI6 Putative GATA transcription factor 224.6e-2637.69Show/hide
Query:  EETGLRFTIWKQIDKRETSSCCENNNNDNTHNDSVKWSSSSSSSSKIKFMINSNLQTETTPTRTIDSGRNVQDLNPPSPSPSSIEQTNKRTSATTLHEGG
        +ET L+ TI K+ + ++ +   ++   D T  +S+KW      SSK++ M     + +     T DS +   + N  S + S+ E+ N        +   
Subjt:  EETGLRFTIWKQIDKRETSSCCENNNNDNTHNDSVKWSSSSSSSSKIKFMINSNLQTETTPTRTIDSGRNVQDLNPPSPSPSSIEQTNKRTSATTLHEGG

Query:  AIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAAAAATNG-GAVVLKTNKAVQHKITTKPATTMT----TTTALKRKYKDEVVVVSG
         +IR CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR AMA A A A +G    V+K     ++KI+      ++         KR    E   ++ 
Subjt:  AIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAAAAATNG-GAVVLKTNKAVQHKITTKPATTMT----TTTALKRKYKDEVVVVSG

Query:  HGGGDKGG---GRKAKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
                        + F+++ +   L   SS+YQ+VFPQDE+EAAILLM LS+G++HG
Subjt:  HGGGDKGG---GRKAKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G26150.1 cytokinin-responsive gata factor 13.3e-2737.69Show/hide
Query:  EETGLRFTIWKQIDKRETSSCCENNNNDNTHNDSVKWSSSSSSSSKIKFMINSNLQTETTPTRTIDSGRNVQDLNPPSPSPSSIEQTNKRTSATTLHEGG
        +ET L+ TI K+ + ++ +   ++   D T  +S+KW      SSK++ M     + +     T DS +   + N  S + S+ E+ N        +   
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Query:  AIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAAAAATNG-GAVVLKTNKAVQHKITTKPATTMT----TTTALKRKYKDEVVVVSG
         +IR CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR AMA A A A +G    V+K     ++KI+      ++         KR    E   ++ 
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Query:  HGGGDKGG---GRKAKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
                        + F+++ +   L   SS+YQ+VFPQDE+EAAILLM LS+G++HG
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AT4G36620.1 GATA transcription factor 198.7e-1256.6Show/hide
Query:  IIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAATNGGA
        + R C++C+TT TPLWR+GPRGPKSLCNACGIR +K  R  + A  + + GG+
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AT5G26930.1 GATA transcription factor 231.0e-1267.39Show/hide
Query:  LHEGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRA
        + E    IR CS+C TTKTP+WR GP GPKSLCNACGIR RK RR+
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AT5G49300.1 GATA transcription factor 165.1e-1273.17Show/hide
Query:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAE
        +TC+DC T+KTPLWR GP GPKSLCNACGIR RK RR   E
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AT5G56860.1 GATA type zinc finger transcription factor family protein3.3e-2733.16Show/hide
Query:  LHYSSSHHHLFFPIVTPAQASSSSSSSLSFTA-------------------LDHSMISDDPRSVELKHEGGGIMGCNNDQSIGNHEDHIEETGLRFTIWK
        LH+   HHH   P  + + +SSSS SSLS                       DH  +S  P   ++    GG   C       +H    +ET L+ TI K
Subjt:  LHYSSSHHHLFFPIVTPAQASSSSSSSLSFTA-------------------LDHSMISDDPRSVELKHEGGGIMGCNNDQSIGNHEDHIEETGLRFTIWK

Query:  QIDKRETSSCCENNNNDNTHNDSVKWSSSSSSSSKIKFMINSNLQTETTPTRTIDSGRNVQDLNPPSPSPSSIEQ-----------TNKRTSAT------
        +  + +     +N    +  +DS KW   S     IK  I +N Q      +T ++     D  P +   +  E            T K T+AT      
Subjt:  QIDKRETSSCCENNNNDNTHNDSVKWSSSSSSSSKIKFMINSNLQTETTPTRTIDSGRNVQDLNPPSPSPSSIEQ-----------TNKRTSAT------

Query:  TLHEGG-----AIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAATNGGAVV------LKTNKAVQHKIT----------TKPAT
        T++E G      +IR CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRA   AAAAA +    V      L   K +Q+K            + P  
Subjt:  TLHEGG-----AIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAATNGGAVV------LKTNKAVQHKIT----------TKPAT

Query:  TMTTTTALKRKYKDEVVVVSGHGGGDKGGGRKA--------KLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
               +K + + E+   +  G  +      +        K CF+++ +   +   SS+YQ+VFPQDE+EAA+LLM LSYG++HG
Subjt:  TMTTTTALKRKYKDEVVVVSGHGGGDKGGGRKA--------KLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCCTCCTTATCGGGACTCGTTTCCCTCCGATCACGACGATCTTGATCATCTTCACTACTCGTCTTCTCATCATCACCTCTTCTTCCCTATCGTCACCCCAGCTCA
GGCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCTCTCTCTTTCACTGCCCTCGATCATTCCATGATCTCCGACGATCCTCGCTCGGTAGAGCTCAAACACGAGGGTGGTGGGATTATGG
GTTGTAACAATGATCAAAGTATTGGAAATCATGAAGATCATATAGAAGAAACTGGACTAAGGTTTACAATTTGGAAGCAGATTGATAAGAGAGAAACTTCAAGCTGTTGT
GAGAATAATAATAACGATAATACTCACAATGATTCGGTGAAGTGGTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCAAGATCAAATTCATGATAAATTCTAACCTGCAAACTGAGAC
GACTCCCACCAGAACAATTGACAGCGGTCGAAATGTCCAAGATCTCAACCCACCGTCACCGTCACCATCTTCGATTGAACAAACGAACAAACGAACAAGCGCAACGACAC
TACACGAGGGCGGTGCCATAATCAGAACCTGTTCCGATTGTAACACCACAAAAACTCCCCTTTGGAGAAGCGGCCCTAGAGGTCCTAAGTCACTTTGCAACGCATGTGGA
ATCCGACAGAGAAAAGCAAGACGAGCAATGGCAGAAGCAGCAGCGGCCGCCACGAACGGTGGGGCCGTAGTTTTGAAGACCAACAAGGCGGTACAACACAAGATAACGAC
GAAGCCAGCGACGACGATGACGACAACAACAGCATTGAAGAGAAAATACAAAGACGAGGTCGTGGTAGTCAGTGGCCACGGTGGCGGAGACAAGGGCGGAGGAAGAAAGG
CGAAACTTTGTTTTGAAGAGATAAAAATGGGGGGAAGATTGAGTGAGATTTCTTCATCCTATCAACGAGTTTTCCCACAAGATGAAAGAGAAGCTGCCATTTTGCTCATG
ACTCTATCTTACGGCCTTCTTCATGGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTTCCTCTGCCCTTCCTGCCCTCTCCCTTTTTTCTATTTAGTATTTTCACCATTATTACATCTCTTGATCATTCTTCCACCTCTTTCTTTCTTTTTAACTCATTCTTC
TTTGATCTTCTCTTCTTCATTATCATGGCTCCTCCTTATCGGGACTCGTTTCCCTCCGATCACGACGATCTTGATCATCTTCACTACTCGTCTTCTCATCATCACCTCTT
CTTCCCTATCGTCACCCCAGCTCAGGCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCTCTCTCTTTCACTGCCCTCGATCATTCCATGATCTCCGACGATCCTCGCTCGGTAGAGCTCA
AACACGAGGGTGGTGGGATTATGGGTTGTAACAATGATCAAAGTATTGGAAATCATGAAGATCATATAGAAGAAACTGGACTAAGGTTTACAATTTGGAAGCAGATTGAT
AAGAGAGAAACTTCAAGCTGTTGTGAGAATAATAATAACGATAATACTCACAATGATTCGGTGAAGTGGTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCAAGATCAAATTCATGAT
AAATTCTAACCTGCAAACTGAGACGACTCCCACCAGAACAATTGACAGCGGTCGAAATGTCCAAGATCTCAACCCACCGTCACCGTCACCATCTTCGATTGAACAAACGA
ACAAACGAACAAGCGCAACGACACTACACGAGGGCGGTGCCATAATCAGAACCTGTTCCGATTGTAACACCACAAAAACTCCCCTTTGGAGAAGCGGCCCTAGAGGTCCT
AAGTCACTTTGCAACGCATGTGGAATCCGACAGAGAAAAGCAAGACGAGCAATGGCAGAAGCAGCAGCGGCCGCCACGAACGGTGGGGCCGTAGTTTTGAAGACCAACAA
GGCGGTACAACACAAGATAACGACGAAGCCAGCGACGACGATGACGACAACAACAGCATTGAAGAGAAAATACAAAGACGAGGTCGTGGTAGTCAGTGGCCACGGTGGCG
GAGACAAGGGCGGAGGAAGAAAGGCGAAACTTTGTTTTGAAGAGATAAAAATGGGGGGAAGATTGAGTGAGATTTCTTCATCCTATCAACGAGTTTTCCCACAAGATGAA
AGAGAAGCTGCCATTTTGCTCATGACTCTATCTTACGGCCTTCTTCATGGTTAATTAATTAATTAACTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATT
ATTATTATATATTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPPYRDSFPSDHDDLDHLHYSSSHHHLFFPIVTPAQASSSSSSSLSFTALDHSMISDDPRSVELKHEGGGIMGCNNDQSIGNHEDHIEETGLRFTIWKQIDKRETSSCC
ENNNNDNTHNDSVKWSSSSSSSSKIKFMINSNLQTETTPTRTIDSGRNVQDLNPPSPSPSSIEQTNKRTSATTLHEGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACG
IRQRKARRAMAEAAAAATNGGAVVLKTNKAVQHKITTKPATTMTTTTALKRKYKDEVVVVSGHGGGDKGGGRKAKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLM
TLSYGLLHG