| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0032849.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 3.4e-103 | 98.96 | Show/hide |
Query: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Subjt: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Query: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
GFIRPAKAPY APVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAF+
Subjt: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| KAA0037220.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 3.4e-103 | 98.96 | Show/hide |
Query: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Subjt: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Query: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
GFIRPAKAPY APVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAF+
Subjt: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| KAA0063412.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 3.4e-103 | 98.96 | Show/hide |
Query: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Subjt: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Query: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
GFIRPAKAPY APVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAF+
Subjt: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| KAA0067557.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 3.4e-103 | 98.96 | Show/hide |
Query: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Subjt: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Query: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
GFIRPAKAPY APVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAF+
Subjt: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| TYK28713.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 3.4e-103 | 98.96 | Show/hide |
Query: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Subjt: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Query: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
GFIRPAKAPY APVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAF+
Subjt: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7T0E2 Reverse transcriptase | 1.6e-103 | 98.96 | Show/hide |
Query: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Subjt: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Query: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
GFIRPAKAPY APVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAF+
Subjt: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| A0A5A7UXR6 Reverse transcriptase | 1.6e-103 | 98.96 | Show/hide |
Query: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Subjt: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Query: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
GFIRPAKAPY APVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAF+
Subjt: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| A0A5D3B7E7 Reverse transcriptase | 1.6e-103 | 98.96 | Show/hide |
Query: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Subjt: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Query: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
GFIRPAKAPY APVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAF+
Subjt: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| A0A5D3BRZ6 Reverse transcriptase | 1.6e-103 | 98.96 | Show/hide |
Query: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Subjt: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Query: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
GFIRPAKAPY APVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAF+
Subjt: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| A0A5D3C4R1 Reverse transcriptase | 1.6e-103 | 98.96 | Show/hide |
Query: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Subjt: MISAMQLKKGLSRDEPTFMAIPLKSSENSGETVPKEIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNA
Query: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
GFIRPAKAPY APVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAF+
Subjt: GFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 8.8e-22 | 33.33 | Show/hide |
Query: EIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLP-PRRMIDHEIELV-PGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNAGFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRAL
E+ + ++++D+ ++ + LP P + ++ E+EL + P +N Y + P ++ + ++++ L +G IR +KA PV+F KK+G+LR+ +DY+ L
Subjt: EIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLP-PRRMIDHEIELV-PGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNAGFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRAL
Query: NKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
NK N YPLP+I L ++ G+ F+KLDL+S Y+ +R+ +GDE K G F+
Subjt: NKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| P31843 RNA-directed DNA polymerase homolog | 3.5e-26 | 74.29 | Show/hide |
Query: SLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
SLR+CIDYRAL K+T++NKYP+P + DLFDRL A +F+KLDLRSGY+QVRIA+GDEPKTTCVTRYG+F+
Subjt: SLRLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 2.6e-26 | 38.22 | Show/hide |
Query: EKYRDVMPDSLP------KSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNAGFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNK
+KYR+++ + LP ++P + H+IE+ PGA+ P Y + E+ K + +LL+ FI P+K+P +PV+ KKDG+ RLC+DYR LNK
Subjt: EKYRDVMPDSLP------KSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNAGFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNK
Query: LTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
T+ + +PLP I +L R+ A+ F+ LDL SGY+Q+ + D KT VT G ++
Subjt: LTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 2.6e-26 | 38.22 | Show/hide |
Query: EKYRDVMPDSLP------KSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNAGFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNK
+KYR+++ + LP ++P + H+IE+ PGA+ P Y + E+ K + +LL+ FI P+K+P +PV+ KKDG+ RLC+DYR LNK
Subjt: EKYRDVMPDSLP------KSLPPRRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNAGFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRALNK
Query: LTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
T+ + +PLP I +L R+ A+ F+ LDL SGY+Q+ + D KT VT G ++
Subjt: LTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
| Q9UR07 Transposon Tf2-11 polyprotein | 8.8e-22 | 33.33 | Show/hide |
Query: EIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLP-PRRMIDHEIELV-PGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNAGFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRAL
E+ + ++++D+ ++ + LP P + ++ E+EL + P +N Y + P ++ + ++++ L +G IR +KA PV+F KK+G+LR+ +DY+ L
Subjt: EIMRVLEKYRDVMPDSLPKSLP-PRRMIDHEIELV-PGAKPPAKNAYRMAPPELAELRKQLDELLNAGFIRPAKAPYEAPVLFQRKKDGSLRLCIDYRAL
Query: NKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
NK N YPLP+I L ++ G+ F+KLDL+S Y+ +R+ +GDE K G F+
Subjt: NKLTVRNKYPLPIITDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTCVTRYGAFD
|
|
