; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc02g0052231 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc02g0052231
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptionzinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Genome locationCMiso1.1chr02:19493578..19494603
RNA-Seq ExpressionCmc02g0052231
SyntenyCmc02g0052231
Gene Ontology termsGO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008906 - HAT, C-terminal dimerisation domain
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ACX85638.1 putative transposase [Cucumis melo]2.5e-11465.99Show/hide
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ADN33674.1 transposase [Cucumis melo subsp. melo]2.5e-11465.99Show/hide
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KAA0058067.1 putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]4.0e-10481.63Show/hide
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XP_016899473.1 PREDICTED: zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X2 [Cucumis melo]4.2e-9860.73Show/hide
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XP_016903394.1 PREDICTED: zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like [Cucumis melo]1.7e-11588.07Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4DU07 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X12.1e-9860.73Show/hide
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A0A1S4E592 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like8.3e-11688.07Show/hide
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A0A5A7UTL3 Putative transposase1.9e-10481.63Show/hide
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D0UIX2 Putative transposase1.2e-11465.99Show/hide
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E5GB32 Transposase1.2e-11465.99Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B9FJG3 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 13.0e-1424.05Show/hide
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        +DV T+WN+T+ ML  A+  ++ F  LE  D +Y   ++ P+ EDW   +    +LK   +                  +  K+       T + +  F 
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Query:  RLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPFISFSGS---------YKACV--AIHDRFKQ---------------------------------
         +  D + R   +KY +  +           + ++  + FS S         Y   V  A+H+ + +                                 
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                     S        K+E+ +YL E     I  +  D+L WWK+N+ ++  +S++ARDI +I +S V+S  S FS  TG R+LD +RSS  P+
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          EAL+CA++W+Q  P
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P03010 Putative AC9 transposase5.2e-1442.35Show/hide
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        E+ +Y+ E  +   G    D+L+WW+   +++ I++Q+ARD+ +I VSTV SES FS GGRV+D +R+ L  +  EALIC ++W+
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P08770 Putative AC transposase5.2e-1442.35Show/hide
Query:  EVARYLVEDRIDSIGDEYLDLLTWWKVNSSQFKIISQVARDIYSISVSTVTSESTFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWI
        E+ +Y+ E  +   G    D+L+WW+   +++ I++Q+ARD+ +I VSTV SES FS GGRV+D +R+ L  +  EALIC ++W+
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Q6AVI0 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 22.1e-1526.27Show/hide
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        +DV T+WN+T+ ML  A+  ++ F  LE  D +Y   ++ P+ EDW   +    +LK   +                                 ED V  
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Query:  -----------KIWTN----------------------------KVEEA-FRRLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPFISFSGSYKACV
                   K W +                             VE A + ++ DD    + KE  +Q    TP   +  Q        S +G+     
Subjt:  -----------KIWTN----------------------------KVEEA-FRRLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPFISFSGSYKACV

Query:  AIHDRFKQ-----SNKTCLDDAKTEVARYLVEDRIDSIGDEYLDLLTWWKVNSSQFKIISQVARDIYSISVSTVTS-ESTFS--TGGRVLDSFRSSLTPQ
        +  D         S        K+E+ +YL E     I  +  D+L WWK+N+ +F  +S++ARDI +I +S V+S  S FS  TG R+LD +RSSL P+
Subjt:  AIHDRFKQ-----SNKTCLDDAKTEVARYLVEDRIDSIGDEYLDLLTWWKVNSSQFKIISQVARDIYSISVSTVTS-ESTFS--TGGRVLDSFRSSLTPQ

Query:  TAEALICAQNWIQSKP
          EAL+CA++W+Q  P
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Q75HY5 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 39.4e-1625.89Show/hide
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        +DV T+WN+T+ ML  A+  Q+ F  LE  D  Y   ++ P+TEDW   +    +L + L +    I       A      + +   + +  S+  +   
Subjt:  MDVPTRWNSTFTMLDGAIKCQKTFEILEEHDSSYLPKDDIPTTEDWDNAKVFEKFLKTFLEEDCVKIWTNKVEEAFRRLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTP

Query:  IEGFGFQSQSEIPFISFSGSYKAC-------VAIHDRFKQS--NKTCLDDAKTEVARY--LVEDRIDSI---------------------------GDEY
         E   F+S ++I    F   +K C       V +  RFK      +       E A+Y  +V+D I  +                           GDE 
Subjt:  IEGFGFQSQSEIPFISFSGSYKAC-------VAIHDRFKQS--NKTCLDDAKTEVARY--LVEDRIDSI---------------------------GDEY

Query:  LD----------------------------------LLTWWKVNSSQFKIISQVARDIYSISVSTVTSESTF----STGGRVLDSFRSSLTPQTAEALIC
        LD                                  +L WWK+N+ +F  +S++ARD+ +I +S V+S S+     +TG ++LD +RSSL P+T EAL C
Subjt:  LD----------------------------------LLTWWKVNSSQFKIISQVARDIYSISVSTVTSESTF----STGGRVLDSFRSSLTPQTAEALIC

Query:  AQNWIQSKP
        A++W+Q  P
Subjt:  AQNWIQSKP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18560.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain2.2e-0729.89Show/hide
Query:  EVARYLVEDRIDSIGDEYLDLLTWWKVNSSQFKIISQVARDIYSISVSTVTSESTFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQS
        E+ +YL E    SI     D+L WWKVNS ++  +S +ARD  ++  ++   E  F   G  +D  +  +   + +++IC ++WI++
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AT3G42170.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain8.2e-1523.34Show/hide
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        +D  T+WN+T+ ML  A + ++ F  L+  D  Y      P+ EDW + +    FLK   E                  ++W  + + +     +D +  
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Query:  -----MRMSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPFISFSGS------------------------YKACVAIHDRFKQSNK-------------TCLDDA
             M+   +KY +  S           + ++  + FS S                        Y A  +  +   +  K             T   + 
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Query:  KTEVARYLVEDRIDSIGDEYLDLLTWWKVNSSQFKIISQVARDIYSISVSTVTSESTFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWI
        K+E+ +YL E  +  +  +  D+L WWK N  ++  +S++ARDI SI VS    +  F    R +D +++SL P+T EALICA+ W+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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