| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0036574.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 8.3e-188 | 85.75 | Show/hide |
Query: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
MTSDISLLSSHI VQSLPPIHSADGN MSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQ+IGTGRKVGRLFELT
Subjt: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
Query: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNE---
SLQHSPVFPAISAPV DNTLFQWHLRLGHASSNKL SLTST LL+NVSQF+ FDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVN
Subjt: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNE---
Query: ---IVPPYIK----------------YVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLS
+ Y + YVDFANM+QTQFSS IKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHT QQNGRAERKHRHILDSV QLLS
Subjt: ---IVPPYIK----------------YVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLS
Query: RSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
SC E FWGEAALTSVYVINRLPSQVIHN+SPFERLY TPP+YS LKVFGCACFVLLH HEHTK +PRA LCCFLGYGTEHKGF C
Subjt: RSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
|
|
| KAA0043149.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 8.3e-188 | 85.75 | Show/hide |
Query: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
MTSDISLLSSHI VQSLPPIHSADGN MSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQ+IGTGRKVGRLFELT
Subjt: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
Query: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNE---
SLQHSPVFPAISAPV DNTLFQWHLRLGHASSNKL SLTST LL+NVSQF+ FDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVN
Subjt: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNE---
Query: ---IVPPYIK----------------YVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLS
+ Y + YVDFANM+QTQFSS IKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHT QQNGRAERKHRHILDSV QLLS
Subjt: ---IVPPYIK----------------YVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLS
Query: RSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
SC E FWGEAALTSVYVINRLPSQVIHN+SPFERLY TPP+YS LKVFGCACFVLLH HEHTK +PRA LCCFLGYGTEHKGF C
Subjt: RSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
|
|
| KAA0058220.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.4e-158 | 80.83 | Show/hide |
Query: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
Subjt: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
Query: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNEIVP
SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRL EIVP
Subjt: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNEIVP
Query: PYIKYVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRL
PYIKYVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRL
Subjt: PYIKYVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRL
Query: PSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHK
PSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHK
Subjt: PSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHK
|
|
| KAA0058316.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 5.4e-155 | 77.75 | Show/hide |
Query: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
MTSDISLLSSH VQSLPPIHSADGN MSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQ+IGTGRKVGRLFELT
Subjt: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
Query: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNEIVP
SLQHSPVFPAISAPV DNTLFQWHLRLGHASSNKL SLTST LL+NVSQF+ FDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVN
Subjt: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNEIVP
Query: PYIKYVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRL
DNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHT QQNGRAERKHRHILDS
Subjt: PYIKYVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRL
Query: PSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
VIHN+SPFERLY TPP+YS LKVFGCACFVLLH HEHTK +PRA LCCFLGYGTEHKGF C
Subjt: PSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
|
|
| KAA0065380.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 8.3e-188 | 85.75 | Show/hide |
Query: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
MTSDISLLSSHI VQSLPPIHSADGN MSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQ+IGTGRKVGRLFELT
Subjt: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
Query: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNE---
SLQHSPVFPAISAPV DNTLFQWHLRLGHASSNKL SLTST LL+NVSQF+ FDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVN
Subjt: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNE---
Query: ---IVPPYIK----------------YVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLS
+ Y + YVDFANM+QTQFSS IKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHT QQNGRAERKHRHILDSV QLLS
Subjt: ---IVPPYIK----------------YVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLS
Query: RSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
SC E FWGEAALTSVYVINRLPSQVIHN+SPFERLY TPP+YS LKVFGCACFVLLH HEHTK +PRA LCCFLGYGTEHKGF C
Subjt: RSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SZ66 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 4.0e-188 | 85.75 | Show/hide |
Query: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
MTSDISLLSSHI VQSLPPIHSADGN MSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQ+IGTGRKVGRLFELT
Subjt: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
Query: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNE---
SLQHSPVFPAISAPV DNTLFQWHLRLGHASSNKL SLTST LL+NVSQF+ FDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVN
Subjt: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNE---
Query: ---IVPPYIK----------------YVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLS
+ Y + YVDFANM+QTQFSS IKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHT QQNGRAERKHRHILDSV QLLS
Subjt: ---IVPPYIK----------------YVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLS
Query: RSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
SC E FWGEAALTSVYVINRLPSQVIHN+SPFERLY TPP+YS LKVFGCACFVLLH HEHTK +PRA LCCFLGYGTEHKGF C
Subjt: RSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
|
|
| A0A5A7UST7 Putative mitochondrial protein | 6.7e-159 | 80.83 | Show/hide |
Query: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
Subjt: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
Query: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNEIVP
SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRL EIVP
Subjt: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNEIVP
Query: PYIKYVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRL
PYIKYVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRL
Subjt: PYIKYVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRL
Query: PSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHK
PSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHK
Subjt: PSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHK
|
|
| A0A5A7UVX4 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 2.6e-155 | 77.75 | Show/hide |
Query: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
MTSDISLLSSH VQSLPPIHSADGN MSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQ+IGTGRKVGRLFELT
Subjt: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
Query: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNEIVP
SLQHSPVFPAISAPV DNTLFQWHLRLGHASSNKL SLTST LL+NVSQF+ FDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVN
Subjt: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNEIVP
Query: PYIKYVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRL
DNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHT QQNGRAERKHRHILDS
Subjt: PYIKYVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRL
Query: PSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
VIHN+SPFERLY TPP+YS LKVFGCACFVLLH HEHTK +PRA LCCFLGYGTEHKGF C
Subjt: PSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
|
|
| A0A5A7VDW0 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 4.0e-188 | 85.75 | Show/hide |
Query: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
MTSDISLLSSHI VQSLPPIHSADGN MSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQ+IGTGRKVGRLFELT
Subjt: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
Query: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNE---
SLQHSPVFPAISAPV DNTLFQWHLRLGHASSNKL SLTST LL+NVSQF+ FDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVN
Subjt: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNE---
Query: ---IVPPYIK----------------YVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLS
+ Y + YVDFANM+QTQFSS IKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHT QQNGRAERKHRHILDSV QLLS
Subjt: ---IVPPYIK----------------YVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLS
Query: RSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
SC E FWGEAALTSVYVINRLPSQVIHN+SPFERLY TPP+YS LKVFGCACFVLLH HEHTK +PRA LCCFLGYGTEHKGF C
Subjt: RSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
|
|
| A0A5D3DG18 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 4.0e-188 | 85.75 | Show/hide |
Query: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
MTSDISLLSSHI VQSLPPIHSADGN MSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQ+IGTGRKVGRLFELT
Subjt: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELT
Query: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNE---
SLQHSPVFPAISAPV DNTLFQWHLRLGHASSNKL SLTST LL+NVSQF+ FDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVN
Subjt: SLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTVNE---
Query: ---IVPPYIK----------------YVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLS
+ Y + YVDFANM+QTQFSS IKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHT QQNGRAERKHRHILDSV QLLS
Subjt: ---IVPPYIK----------------YVDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVHVQLLS
Query: RSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
SC E FWGEAALTSVYVINRLPSQVIHN+SPFERLY TPP+YS LKVFGCACFVLLH HEHTK +PRA LCCFLGYGTEHKGF C
Subjt: RSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04146 Copia protein | 5.5e-25 | 28.13 | Show/hide |
Query: SVQSLPPIHSA---DGNPMSISHIGTV---NTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELTSLQHSP
SV+ +PP+ A G + + G V N I L + NL SV +L + G++I F G + S+ G M+ + L + P
Subjt: SVQSLPPIHSA---DGNPMSISHIGTV---NTPTIKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGRLFELTSLQHSP
Query: V--FPAISAPVIDNTLFQ-WHLRLGHASSNKLCSL------TSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFP--KSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTV
V F A S F+ WH R GH S KL + + SLL+N+ + S C C KQ L F K + +P ++HSD+ GP T+
Subjt: V--FPAISAPVIDNTLFQ-WHLRLGHASSNKLCSL------TSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFP--KSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPTV
Query: NE--------------IVPPYIKY--------VDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVH
++ V IKY DF + F+ + L DN EY + F ++G + PHT Q NG +ER R I +
Subjt: NE--------------IVPPYIKY--------VDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSVH
Query: VQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLS--PFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGF
+ ++FWGEA LT+ Y+INR+PS+ + + S P+E ++ P L+VFG +V + ++ K ++ F+GY E GF
Subjt: VQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLS--PFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGF
|
|
| P92512 Uncharacterized mitochondrial protein AtMg00710 | 2.2e-05 | 33.73 | Show/hide |
Query: HRHILDSVHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRA
+R I++ V L + F +AA T+V++IN+ PS I+ P E + + P+YS L+ FGC ++ + K KPRA
Subjt: HRHILDSVHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRA
|
|
| Q94HW2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 | 1.5e-43 | 30.53 | Show/hide |
Query: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPT----IKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDL-GLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGR
+TSD + LS H + ADG+ + ISH G+ + T + L N +VPN+ NL SV +LC+ G+++ F QV+D TG + G+
Subjt: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPT----IKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDL-GLTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGR
Query: LFELTSLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASS---NKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPC
L+E PV ++P T WH RLGH + N + S S S+L+ +F C C + K + F +S +P I+SD+W
Subjt: LFELTSLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASS---NKLCSLTSTSLLHNVSQFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPC
Query: PTVNE-----IVPPYIKY----------------VDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDS
N V + +Y + F N+++ +F + I +DN E+ + +Q G S PHT + NG +ERKHRHI+++
Subjt: PTVNE-----IVPPYIKY----------------VDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDS
Query: VHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
L S + +W A +VY+INRLP+ ++ SPF++L+ T P+Y L+VFGCAC+ L P+ K ++ C FLGY + C
Subjt: VHVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
|
|
| Q9ZT94 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 | 1.8e-44 | 30.61 | Show/hide |
Query: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPT----IKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLG-LTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGR
+TSD + LS H + ADG+ + I+H G+ + PT + L+ +VPN+ NL SV +LC+ +++ F QV+D TG + G+
Subjt: MTSDISLLSSHISVQSLPPIHSADGNPMSISHIGTVNTPT----IKLSNTYHVPNLTFNLASVGQLCDLG-LTIIFSSHGCQVQDSQTGQMIGTGRKVGR
Query: LFELTSLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVS-QFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPT
L+E + S ++P T WH RLGH S L S+ S L ++ + C C + K + F S KP I+SD+W +P +
Subjt: LFELTSLQHSPVFPAISAPVIDNTLFQWHLRLGHASSNKLCSLTSTSLLHNVS-QFSIFDCLHCKMAKQPALSFPKSASLCDKPFGLIHSDIWGPAPCPT
Query: VNE------IVPPYIKY----------------VDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSV
++ V + +Y + F ++V+ +F + I L +DN E+ R +L+Q G S PHT + NG +ERKHRHI++
Subjt: VNE------IVPPYIKY----------------VDFANMVQTQFSSTIKILRTDNAMEYKDSRFLSFLAQQGTLIQRSCPHTFQQNGRAERKHRHILDSV
Query: HVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
L S + +W A +VY+INRLP+ ++ SPF++L+ PP+Y LKVFGCAC+ L P+ K + ++ C F+GY + C
Subjt: HVQLLSRSCSENFWGEAALTSVYVINRLPSQVIHNLSPFERLYDTPPSYSDLKVFGCACFVLLHPHEHTKPKPRAHLCCFLGYGTEHKGFHC
|
|
