; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc02g0053651 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc02g0053651
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptionbasic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
Genome locationCMiso1.1chr02:21029891..21033950
RNA-Seq ExpressionCmc02g0053651
SyntenyCmc02g0053651
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058209.1 transcription factor bHLH35 [Cucumis melo var. makuwa]5.6e-11099.07Show/hide
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XP_008453552.1 PREDICTED: transcription factor bHLH35 [Cucumis melo]1.2e-109100Show/hide
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XP_038878728.1 transcription factor bHLH35-like isoform X1 [Benincasa hispida]2.8e-9386.92Show/hide
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XP_038878730.1 transcription factor bHLH35-like isoform X3 [Benincasa hispida]2.8e-9386.92Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LU95 BHLH domain-containing protein3.0e-10192.45Show/hide
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A0A1S3BWL7 transcription factor bHLH356.0e-110100Show/hide
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A0A5A7UXG0 Transcription factor bHLH352.7e-11099.07Show/hide
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A0A6J1C2W6 transcription factor bHLH35-like4.8e-8380.18Show/hide
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        MD+IG+DY     T+I +  EE+DSW L+E +S YYDSSSP+G    SAASKNI+SERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI+YI DLH+Q
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A0A6J1E262 transcription factor bHLH35-like4.8e-8380.18Show/hide
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        ERR+Q EI ELESG   KITG EFDQ +LPLLLR KRKKTE+Y SY SP SR SPIEV DLSVTYMGDRTI VSMTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIIT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0JEB7 Transcription factor BHLH61.5e-3338.67Show/hide
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        EELDS  L     + Y+SSSPDGS                                           A+KNI+ ER+RRRKLNE+L+ALRSVVPNITKMD
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        KASIIKDAI+YI  L  +E+++  E+  LES               G   D++       P     + KK ++ LS  S         +   P+E+ +L 
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        V+ +GDR +VVS+TC KR D+M ++C   E L+L++ITANIT+V+G L+ T+F+EV
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Q0V7X4 Transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR5.1e-1331.65Show/hide
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        S+ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNITKMDKASI+ DA+ Y+ +L  Q ++++++I  LE+ +L    GY   Q+  P       +KT+ +   + P 
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        S+    +++ + V  + ++   V + C K       L +  ESL   ++  +N+++ S
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Q2HIV9 Transcription factor bHLH351.0e-5060.62Show/hide
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        D+D L  +   K K+ +         S  S IEVL+L VT+MG+RT+VVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T+N+T+ SG +  TVFIE
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Q700E3 Transcription factor bHLH275.0e-4546.78Show/hide
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        M+ +  +Y N   T +F      E DSW +EE  S   +SSSPDG+    A+SKN+VSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+K+DKAS+IKD+IDY+ +L 
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        DQE+ ++AEI ELES  TL +    ++D +     L+        R K  + + Y + V    PIEVL++ VT+MG++T+VV +TC K+ ++MV+LC+V 
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        ESL L I+T N ++ + RL  T+F++VT   SP
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Q9ZVX2 Transcription factor ABORTED MICROSPORES1.3e-1332.37Show/hide
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        Y   S  GS A KN+++ER RR+KLN+RL+ALRS+VP ITK+D+ASI+ DAI+Y+ +L ++ + +Q E+    E E G+ +   G   +   +      L
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           S     +Q +  ++   +   +E   + V  +  R   V + C  +     +L E  +SL L++  AN T
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G29930.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.6e-4646.78Show/hide
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        M+ +  +Y N   T +F      E DSW +EE  S   +SSSPDG+    A+SKN+VSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+K+DKAS+IKD+IDY+ +L 
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Query:  DQERRIQAEIYELES-GTLKKITGYEFDQDQLPLLLR------SKRKKTEQYLSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVF
        DQE+ ++AEI ELES  TL +    ++D +     L+        R K  + + Y + V    PIEVL++ VT+MG++T+VV +TC K+ ++MV+LC+V 
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        ESL L I+T N ++ + RL  T+F++VT   SP
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AT5G57150.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein6.7e-5360.71Show/hide
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        E DSW LEE +S  YDSSSPDG+A   ASKNIVSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI YI  L  +E++++AEI ELES     ++  
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         +FD+D L  +   K K+ +         S  S IEVL+L VT+MG+RT+VVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T+N+T+ SG +  TVFIE
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AT5G57150.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.5e-5259.8Show/hide
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        SW LEE +S  YDSSSPDG+A   ASKNIVSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI YI  L  +E++++AEI ELES     ++   +F
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        D+D L  +   K K+ +         S  S IEVL+L VT+MG+RT+VVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T+N+T+ SG +  TVFIEV+   S
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AT5G57150.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.3e-5260.31Show/hide
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        SW LEE +S  YDSSSPDG+A   ASKNIVSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI YI  L  +E++++AEI ELES     ++   +F
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Query:  DQDQLPLLLRSKRKKTEQYLSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITTVSGRLLKTVFIEV
        D+D L  +   K K+ +         S  S IEVL+L VT+MG+RT+VVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T+N+T+ SG +  TVFIE+
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AT5G57150.4 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein7.4e-5260.31Show/hide
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