| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0036923.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.7e-79 | 96.2 | Show/hide |
Query: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMV MFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEEL+KRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Subjt: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Query: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
DRPTFRTRKGEIATNVL VCDTKG+FVYVLA WEGSAADSRILRDAIS+ENGLQVPKG
Subjt: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
|
|
| KAA0051443.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 7.4e-80 | 96.84 | Show/hide |
Query: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMV MFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVP G
Subjt: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Query: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
DRPTFRTRKGEIATNVL VCDTKG+FVYVLA WEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
Subjt: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
|
|
| KAA0053186.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.4e-78 | 96.2 | Show/hide |
Query: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMV MFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPV NCLGALDGTYIKVNVPAG
Subjt: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Query: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
DRPTFRTRKGEIATNVL VC TKG+FVYVLA WEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
Subjt: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
|
|
| KAA0062150.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.7e-79 | 96.2 | Show/hide |
Query: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMV MFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKV+VPAG
Subjt: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Query: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
DRPTFRTRKGEIAT+VL VCDTKG+FVYVLA WEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
Subjt: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
|
|
| KAA0062587.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 7.4e-80 | 96.84 | Show/hide |
Query: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMV MFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Subjt: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Query: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
DRPTFRTRKGEIATNVL VCDTKG+FVYVLA WEGSAADS+ILRDAISRENGLQVPKG
Subjt: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7T1V5 Retrotransposon protein | 8.0e-80 | 96.2 | Show/hide |
Query: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMV MFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEEL+KRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Subjt: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Query: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
DRPTFRTRKGEIATNVL VCDTKG+FVYVLA WEGSAADSRILRDAIS+ENGLQVPKG
Subjt: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
|
|
| A0A5A7U6C1 Retrotransposon protein | 3.6e-80 | 96.84 | Show/hide |
Query: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMV MFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVP G
Subjt: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Query: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
DRPTFRTRKGEIATNVL VCDTKG+FVYVLA WEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
Subjt: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
|
|
| A0A5A7UG16 Retrotransposon protein | 1.2e-78 | 96.2 | Show/hide |
Query: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMV MFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPV NCLGALDGTYIKVNVPAG
Subjt: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Query: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
DRPTFRTRKGEIATNVL VC TKG+FVYVLA WEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
Subjt: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
|
|
| A0A5A7V4C6 Retrotransposon protein | 1.8e-79 | 96.2 | Show/hide |
Query: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMV MFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKV+VPAG
Subjt: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Query: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
DRPTFRTRKGEIAT+VL VCDTKG+FVYVLA WEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
Subjt: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
|
|
| A0A5A7V6J9 Retrotransposon protein | 3.6e-80 | 96.84 | Show/hide |
Query: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMV MFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Subjt: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Query: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
DRPTFRTRKGEIATNVL VCDTKG+FVYVLA WEGSAADS+ILRDAISRENGLQVPKG
Subjt: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G43722.1 unknown protein | 6.4e-13 | 28.49 | Show/hide |
Query: FAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRP-------VPNCL-------------
F LC++L+ L T + +EE V MFL + H+ R + F R+ ETV R F VL A L + I+ P +P L
Subjt: FAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRP-------VPNCL-------------
Query: -GALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVP
GA+DGT++ V V + + R + N++ +CD K F Y+ GS D+ +L+ A ++ +P
Subjt: -GALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVP
|
|
| AT3G55350.1 PIF / Ping-Pong family of plant transposases | 1.9e-04 | 33.82 | Show/hide |
Query: VPNCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGE--IATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDA
+PNC GA+D T+I +N+PA + GE + + V D F+ V+A W GS D +L+++
Subjt: VPNCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGE--IATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDA
|
|
| AT5G28730.1 unknown protein | 4.6e-11 | 30.77 | Show/hide |
Query: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
M F LC +L GL S+ + ++E V +FL + A + R I F + ET+ R F+ VL A+ RL E I+ P + L ++
Subjt: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPNCLGALDGTYIKVNVPAG
Query: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVP
P G + NVL +CD F Y GS D+R+L AIS + VP
Subjt: DRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVP
|
|
| AT5G28950.1 unknown protein | 6.8e-15 | 47.37 | Show/hide |
Query: NCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISR-ENGLQVPK
+C+GA+D T+I V P+FR RKG+I+ N+L C+ F+YVL+ WEGSA DS++L DA++R N L VP+
Subjt: NCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISR-ENGLQVPK
|
|
| AT5G41980.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912) | 2.5e-25 | 36.84 | Show/hide |
Query: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPN-------------CLGA
MD+ F LC LL+ L T + +E + +FL ++ H+++ R +Q F SGET+SRHFN VL AV+ + ++ +P N C+G
Subjt: MDRRTFAILCHLLRNVAGLSSTEIVDVEEMVVMFLHVLAHDVKNRVIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVPN-------------CLGA
Query: LDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
+D +I V V ++ FR G + NVL F YVLA WEGSA+D ++L A++R N LQVP+G
Subjt: LDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLEVCDTKGNFVYVLASWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG
|
|
