; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc02g0053861 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc02g0053861
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein HOX18-like
Genome locationCMiso1.1chr02:21199462..21201036
RNA-Seq ExpressionCmc02g0053861
SyntenyCmc02g0053861
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587716.1 Homeobox-leucine zipper protein HAT4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-6158.09Show/hide
Query:  EDEICNIS-WLSLGLGFGDQYVPKKIQK------NQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSS
        +D++CNI   LSLG GFG +YVPKK+QK      N      +SFTL+PK+EL I ++                                         +S
Subjt:  EDEICNIS-WLSLGLGFGDQYVPKKIQK------NQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSS

Query:  FGSIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
         GS R                               RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
Subjt:  FGSIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD

Query:  CEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPP
        CEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+ELRS+KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITRTPAA   AA D NSPP
Subjt:  CEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPP

XP_004150745.1 homeobox-leucine zipper protein HOX18 [Cucumis sativus]1.3e-13294.46Show/hide
Query:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFG
        MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQ QQQQ+SFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDE NSSEEDDDHHLMKRIRS+NNIVNYD HHRQDSSFG
Subjt:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFG

Query:  SIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
        SIRRLSSD YINN+DIVN+TNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
Subjt:  SIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE

Query:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ
        FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITRTP      AVDANSPPQ
Subjt:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ

XP_008453538.1 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein HOX18-like [Cucumis melo]2.1e-143100Show/hide
Query:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFG
        MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFG
Subjt:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFG

Query:  SIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
        SIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
Subjt:  SIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE

Query:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ
        FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ
Subjt:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ

XP_022134791.1 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like [Momordica charantia]5.1e-6563.71Show/hide
Query:  EDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQ--QQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFGSIR
        +DEICNI  L LGLGFG++YVPKK   N + +    +SFTLIPKEE       N+EI+     +S  D DH  +KRIRSNNN                  
Subjt:  EDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQ--QQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFGSIR

Query:  RLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK
            DQ  +++ IV            +GS   ERKKLRLSKEQS LLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK
Subjt:  RLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK

Query:  KCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAA
        KCCERLNEENRRLKKE+ ELRSLK+GASQLYIQLPKAATLTICPSC+++TR  AA  AA
Subjt:  KCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAA

XP_038879995.1 homeobox-leucine zipper protein HOX17-like [Benincasa hispida]6.6e-10581.88Show/hide
Query:  HEDEICNISWLSLGLGFG-DQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNN----NMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSF
        H+DE+CNISWLSLGLGFG DQYVPKK+QK  +   Q+SFTLIPKEEL I NNN    NMEIDD+E NSSEED  HHLMKR RSNNNIVNYDH   QDSSF
Subjt:  HEDEICNISWLSLGLGFG-DQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNN----NMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSF

Query:  GSIRRLSSDQY---INNNDIVNSTNHNYKGISSSG-SELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQT
        G   R SSD +    +NN+I+ +TNHN+KGISSSG SELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKL+TTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQT
Subjt:  GSIRRLSSDQY---INNNDIVNSTNHNYKGISSSG-SELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQT

Query:  EVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ
        EVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+EL+SLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITRT AA  AAA+DANSPPQ
Subjt:  EVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M012 Homeobox domain-containing protein6.1e-13394.46Show/hide
Query:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFG
        MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQ QQQQ+SFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDE NSSEEDDDHHLMKRIRS+NNIVNYD HHRQDSSFG
Subjt:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFG

Query:  SIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
        SIRRLSSD YINN+DIVN+TNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
Subjt:  SIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE

Query:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ
        FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITRTP      AVDANSPPQ
Subjt:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ

A0A1S3BWH2 homeobox-leucine zipper protein HOX18-like1.0e-143100Show/hide
Query:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFG
        MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFG
Subjt:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFG

Query:  SIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
        SIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
Subjt:  SIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE

Query:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ
        FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ
Subjt:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ

A0A5A7USQ4 Homeobox-leucine zipper protein HOX18-like1.0e-143100Show/hide
Query:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFG
        MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFG
Subjt:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFG

Query:  SIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
        SIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
Subjt:  SIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE

Query:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ
        FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ
Subjt:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ

A0A6J1BYS3 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like2.5e-6563.71Show/hide
Query:  EDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQ--QQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFGSIR
        +DEICNI  L LGLGFG++YVPKK   N + +    +SFTLIPKEE       N+EI+     +S  D DH  +KRIRSNNN                  
Subjt:  EDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQ--QQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFGSIR

Query:  RLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK
            DQ  +++ IV            +GS   ERKKLRLSKEQS LLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK
Subjt:  RLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK

Query:  KCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAA
        KCCERLNEENRRLKKE+ ELRSLK+GASQLYIQLPKAATLTICPSC+++TR  AA  AA
Subjt:  KCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAA

A0A6J1EUD1 homeobox-leucine zipper protein HAT3-like2.2e-6157.72Show/hide
Query:  EDEICNIS-WLSLGLGFGDQYVPKKIQK------NQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSS
        +D++CNI   LSLG GFG +YVPKK+QK      N      +SFTL+PK+EL I ++                                         +S
Subjt:  EDEICNIS-WLSLGLGFGDQYVPKKIQK------NQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSS

Query:  FGSIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
         GS R                               RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
Subjt:  FGSIRRLSSDQYINNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD

Query:  CEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPP
        CEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+ELRS+KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITRTPAA   AA + NSPP
Subjt:  CEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2YW03 Homeobox-leucine zipper protein HOX275.0e-3970.15Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSKEQS  LEESFK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L EENRRL KEL ELR+LK  A   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDQITRTPA-AVTAAAVDANSP
        LP A TL++CPSC+++   PA A T+A   A SP
Subjt:  LPKAATLTICPSCDQITRTPA-AVTAAAVDANSP

P46604 Homeobox-leucine zipper protein HAT221.1e-3868.22Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRL+K+QS LLE++FKLH+TLNP QKQALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCE L +ENRRL+KEL +L++LKL +   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVD
        +P AATLT+CPSC+++          AVD
Subjt:  LPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVD

P92953 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-42.9e-3964.66Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+Q+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CC+ L EENRRL+KE++ELR+LKL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSP
        +    TLT+CPSC++++ + A VTAA     +P
Subjt:  LPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSP

Q05466 Homeobox-leucine zipper protein HAT46.5e-3963.77Show/hide
Query:  KGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELR
        +GIS        RKKLRLSK+QS +LEE+FK H+TLNP QKQALA+QL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL++CCE L EENRRL+KE+ ELR
Subjt:  KGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELR

Query:  SLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAA
        +LKL + Q Y+ +    TLT+CPSC+ ++  P    AA
Subjt:  SLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAA

Q6YPD0 Homeobox-leucine zipper protein HOX275.0e-3970.15Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSKEQS  LEESFK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L EENRRL KEL ELR+LK  A   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDQITRTPA-AVTAAAVDANSP
        LP A TL++CPSC+++   PA A T+A   A SP
Subjt:  LPKAATLTICPSCDQITRTPA-AVTAAAVDANSP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44910.1 homeobox-leucine zipper protein 42.1e-4064.66Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+Q+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CC+ L EENRRL+KE++ELR+LKL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSP
        +    TLT+CPSC++++ + A VTAA     +P
Subjt:  LPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSP

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 31.0e-3960.84Show/hide
Query:  SSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKL
        S   +   RKKLRLSKEQ+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+TRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L +ENRRL+KE++ELR+LKL
Subjt:  SSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKL

Query:  GASQLYIQLPKAATLTICPSCDQ--ITRTPAAVTAAAVDANSP
         +  LY+ +    TLT+CPSC++  +T + ++V    ++++SP
Subjt:  GASQLYIQLPKAATLTICPSCDQ--ITRTPAAVTAAAVDANSP

AT4G16780.1 homeobox protein 24.6e-4063.77Show/hide
Query:  KGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELR
        +GIS        RKKLRLSK+QS +LEE+FK H+TLNP QKQALA+QL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL++CCE L EENRRL+KE+ ELR
Subjt:  KGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELR

Query:  SLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAA
        +LKL + Q Y+ +    TLT+CPSC+ ++  P    AA
Subjt:  SLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAA

AT4G37790.1 Homeobox-leucine zipper protein family7.9e-4068.22Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRL+K+QS LLE++FKLH+TLNP QKQALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCE L +ENRRL+KEL +L++LKL +   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVD
        +P AATLT+CPSC+++          AVD
Subjt:  LPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVD

AT5G06710.1 homeobox from Arabidopsis thaliana8.7e-3967.72Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+QS  LE+SFK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L EENRRL+KE+ ELR+LK  ++  Y+Q
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAA
        LP A TLT+CPSC+++  + A  + +A
Subjt:  LPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGATCATCATGAAGATGAAATTTGCAATATCAGTTGGCTTAGCCTTGGTTTGGGATTTGGTGATCAATATGTCCCAAAAAAGATTCAAAAAAACCAACATCAACA
ACAACAAGTCTCTTTCACTCTCATTCCTAAAGAAGAATTGGAAATTACCAACAACAACAATATGGAAATTGATGATGATGAAGTTAATTCAAGTGAAGAAGATGATGATC
ATCATTTGATGAAGAGGATTAGAAGCAATAATAATATTGTTAATTATGATCATCATCATCGTCAAGATTCTTCCTTCGGATCAATTAGAAGATTATCATCAGATCAATAC
ATCAACAACAACGATATCGTTAATTCTACTAATCATAATTATAAAGGGATTAGTAGCAGTGGATCAGAATTAAGGGAGAGGAAAAAACTTAGGCTTTCTAAAGAACAATC
CACTTTATTGGAAGAAAGCTTCAAACTTCACACCACATTGAATCCGGCTCAGAAACAGGCACTTGCCCAACAATTAAACCTCAAAACTCGACAAGTGGAAGTTTGGTTTC
AAAACAGACGTGCAAGGACGAAACTGAAACAAACAGAAGTGGATTGTGAGTTCTTGAAGAAATGTTGTGAAAGATTAAACGAAGAAAATCGAAGGTTGAAGAAAGAATTA
AATGAATTAAGATCGCTTAAACTTGGAGCTTCACAATTGTATATTCAGCTGCCTAAGGCCGCGACGCTCACTATTTGCCCTTCATGCGACCAAATTACGAGGACGCCTGC
CGCCGTCACCGCGGCCGCCGTCGACGCCAATTCTCCGCCACAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTGAAACCTCTCTCTCATTCTCTCCCTCTTTACCAATTCTTTTTTTTTTTTTTTCTGTCTTAAAATCCCCCACTTACCCCTTTCTCTTCTGCTCCTCAAGATCGCTGCC
ATGGAAGATCATCATGAAGATGAAATTTGCAATATCAGTTGGCTTAGCCTTGGTTTGGGATTTGGTGATCAATATGTCCCAAAAAAGATTCAAAAAAACCAACATCAACA
ACAACAAGTCTCTTTCACTCTCATTCCTAAAGAAGAATTGGAAATTACCAACAACAACAATATGGAAATTGATGATGATGAAGTTAATTCAAGTGAAGAAGATGATGATC
ATCATTTGATGAAGAGGATTAGAAGCAATAATAATATTGTTAATTATGATCATCATCATCGTCAAGATTCTTCCTTCGGATCAATTAGAAGATTATCATCAGATCAATAC
ATCAACAACAACGATATCGTTAATTCTACTAATCATAATTATAAAGGGATTAGTAGCAGTGGATCAGAATTAAGGGAGAGGAAAAAACTTAGGCTTTCTAAAGAACAATC
CACTTTATTGGAAGAAAGCTTCAAACTTCACACCACATTGAATCCGGCTCAGAAACAGGCACTTGCCCAACAATTAAACCTCAAAACTCGACAAGTGGAAGTTTGGTTTC
AAAACAGACGTGCAAGGACGAAACTGAAACAAACAGAAGTGGATTGTGAGTTCTTGAAGAAATGTTGTGAAAGATTAAACGAAGAAAATCGAAGGTTGAAGAAAGAATTA
AATGAATTAAGATCGCTTAAACTTGGAGCTTCACAATTGTATATTCAGCTGCCTAAGGCCGCGACGCTCACTATTTGCCCTTCATGCGACCAAATTACGAGGACGCCTGC
CGCCGTCACCGCGGCCGCCGTCGACGCCAATTCTCCGCCACAATAATTTAATACAATGCTCTATCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTTCCGGCTGTGTGTTCTTAGT
ACAGCAAAGAAAGAATAATTCAATTCAAATAATAACATACGGCCTTTTTTAGATTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQHQQQQVSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEVNSSEEDDDHHLMKRIRSNNNIVNYDHHHRQDSSFGSIRRLSSDQY
INNNDIVNSTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKEL
NELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDQITRTPAAVTAAAVDANSPPQ