; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc02g0056331 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc02g0056331
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptionsuppressor protein SRP40 isoform X1
Genome locationCMiso1.1chr02:22755585..22758741
RNA-Seq ExpressionCmc02g0056331
SyntenyCmc02g0056331
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057996.1 putative serine-rich protein C215.13-like protein [Cucumis melo var. makuwa]3.0e-24699.79Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3BVA3 uncharacterized protein LOC1034940464.5e-24899.79Show/hide
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A0A5A7UV09 Putative serine-rich protein C215.13-like protein1.4e-24699.79Show/hide
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A0A6J1C0E0 suppressor protein SRP40 isoform X13.8e-13867.01Show/hide
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A0A6J1C0F1 uncharacterized protein LOC111007326 isoform X22.1e-12863.22Show/hide
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        NPSSPS++KDNRLV DFSDDDVP+    SNGQS A PT+R+D S+GSE  TQYP TQ+M+RVDDP SP+YRIPS VFSRTKS + MEWSVASNESLFSI 
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Query:  MGNMSFTREQLCWLGKSGELCRPGEST----IDMSQH---LAMKTSDCGLKSKSPNGDLAATEARAAETMREVIRENSENQRKESSTLTESSSQSASISH
        MGNMSFTREQLCWLGKSGEL RPGE+     ID+  H   L +K SD GLK   PNGDLAA EA+AAETMREVIRENSEN RKES+TLTESSSQSAS+SH
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Query:  QSEGSTKSFQFPILTGEGGKSISLKGGDPEKAKQEGKPESPE-APSNPQTPKETTKSDESPKATTNNTGQKRWFSCFSCCPFCS
        QSEGSTKSFQFPILTG+GGKSIS KGGDPEKAKQE K ESP+ A S+ +TPKE++ S ESPKA  N    KRWFSCFSCCPFCS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G74220.1 unknown protein5.0e-1834.47Show/hide
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        S+  S+     R D +       Q PPTQ+M+R            P +P YRIPS VF+RT STAP EWS  SNESLFSI MGN SFT        KSGE
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Query:  L---------CRPGESTIDMSQH-----------LAMKTS-DCGLKSKSPNGDLAAT---EARAAETMREVIRENSENQRKESSTLTESSSQSASISHQS
        L           P  S +  + H             +KT  D G K+   +    A+   E +AA ++REVI  N     + ++   +++    S+S +S
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Query:  EG-STKSFQFPILTGEGGKSISLKGGDPEKAKQEGKPESPEAPSNPQTPKETT--------KSDESPKATTNNTGQKR-------WFSCFSCC
        E  S KSF FP++ G   K   L+G  PEK ++         PS P+TPK +T        K +E+PK     T   R       W SCF CC
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AT2G03630.1 unknown protein1.5e-0626.13Show/hide
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        H  ++ K    +D NG   D++     L+  ET  + S    +  SS+SSSSSS S   P      D+ + +L ++ + P +                  
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Query:  NGQSAATPTHRVDSSSGSETPTQYPPTQMMDRVDDPTSPAYRIPSRVFSRTKSTAPMEWSVASNESLFSIQMGNMSFTREQLCWLGKSGELCRPGESTID
                                PP Q+MDR ++      RIPS VF R+KS  P EWS  SNESLFSI +GN SFT      L KSGEL + GE  + 
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Query:  MSQHLAMK----------TSDCGLKSKSPNGDLAATEARAAETMREVIRENSENQRKESSTLTESSSQSASISHQSEGSTKSFQFPI
         S  L M             +  +        +   E     +  E   +   +++++   ++  +  ++  S++S  S  SF FP+
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AT2G03630.2 unknown protein1.9e-0932.14Show/hide
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                                PP Q+MDR ++      RIPS VF R+KS  P EWS  SNESLFSI +GN SFT      L KSGEL + GE
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTCAGCATCTGATTCATCCTCTGAAAGCTCCTTTGAATTGATTGTAACCGGGCTCGACGGTTCCATTGGTGTTACAAGCGATTCTTTAGAAAAGGACGAGTTGCACGCTG
TAGGCTCGGACTCTGAATTTGTGTTTATTAGCAGTGATGATGTTGGAACTCATTCTCCAATGGCTGATCCTCCTTGTACAGCCAAGATACCAAGTCAGTCATTGTCACGG
TCGTCGTCGTCCGCATCTGAATCTTCCCTGCACGGTCATGTGATTGAACTCCCGAAGCCTGAAAAGTACGAAGATACCAATGGTATGGAGCCGGATTTGAAAAAAACACC
ATCAGGTCTTGAACATGGTGAAACCAATAATGTTGAAAGTAGGAAAAGTATACAAACTTGTTCTTCCACCTCGTCTTCCTCATCGTCCGAATCTGAATCTAAACCTGAAC
TTCAAAAGGGTGGAGATGTTGCTGATAATTTATTGTCGAAAAATCCTAGCTCTCCAAGCGTGGAAAAGGACAACAGGTTGGTTACAGATTTCAGTGACGACGATGTTCCC
GTCAGCAATGGACAATCAGCAGCAACTCCTACCCATAGGGTAGACTCAAGCTCGGGCAGCGAGACACCTACTCAATATCCTCCAACTCAAATGATGGATAGAGTTGATGA
TCCTACTTCTCCTGCATATAGAATTCCATCTCGCGTCTTTTCAAGAACTAAATCTACGGCGCCCATGGAATGGAGTGTTGCTTCAAATGAATCATTGTTCAGCATTCAGA
TGGGGAACATGAGTTTTACTAGAGAACAGTTGTGTTGGCTAGGAAAATCAGGCGAGCTATGTAGGCCTGGTGAATCCACAATCGACATGTCCCAACATTTGGCTATGAAA
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ACGAAAGGAGAGTTCAACACTAACAGAGTCGTCGTCTCAATCGGCCAGCATTTCTCATCAGTCAGAGGGAAGCACAAAATCTTTCCAATTTCCAATATTGACAGGAGAAG
GAGGAAAAAGCATTTCATTGAAGGGAGGCGACCCGGAGAAGGCGAAACAAGAGGGGAAACCAGAATCACCAGAAGCACCTTCAAATCCACAAACCCCAAAAGAAACAACA
AAATCAGACGAATCGCCAAAAGCAACTACAAATAACACGGGGCAAAAGAGATGGTTTTCTTGCTTTTCTTGCTGCCCGTTCTGTAGTTAA
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AAAGTTTATCTGAATTATAATAAAAGGATTGTTCAAAAAACGAATAATAATAAACGGTTAGAAAAAAGGCGCCAAGGTGAGGCGAAGTTAGTTAATAAGAAGAGAAAGAA
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ATCCTTTCGTTTCTCATCTCCAATTTGATTCACTCAGATTCTTTCCTATCAATCATTAATGCTTTTTCCCCATTCCCAATTCGGGACTGCTGTTTTTCTGGCCGTCGGAG
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TACGTAGACTATGTTCTTATGGAGTGACCGGAAGCGGTAATCTTTAGACTACGTCTGACTAAAAAACTAAATAGTGGTGCCTGAAAAAGCAATTCAGATATCTTATCTAT
GGAATCTAGGCAAAAGATCGAGGACATTGAATCAATAACACATTCTATCAGCAGTACAGGCGGAGTTGATCTTTCTATTTCGAGCAATAAATTAGCCTCTTCTTCATCCT
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GGCTCGGACTCTGAATTTGTGTTTATTAGCAGTGATGATGTTGGAACTCATTCTCCAATGGCTGATCCTCCTTGTACAGCCAAGATACCAAGTCAGTCATTGTCACGGTC
GTCGTCGTCCGCATCTGAATCTTCCCTGCACGGTCATGTGATTGAACTCCCGAAGCCTGAAAAGTACGAAGATACCAATGGTATGGAGCCGGATTTGAAAAAAACACCAT
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CAGCAATGGACAATCAGCAGCAACTCCTACCCATAGGGTAGACTCAAGCTCGGGCAGCGAGACACCTACTCAATATCCTCCAACTCAAATGATGGATAGAGTTGATGATC
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GGGAACATGAGTTTTACTAGAGAACAGTTGTGTTGGCTAGGAAAATCAGGCGAGCTATGTAGGCCTGGTGAATCCACAATCGACATGTCCCAACATTTGGCTATGAAAAC
TTCTGATTGTGGATTGAAGAGCAAAAGTCCAAATGGTGATCTAGCAGCAACTGAAGCACGAGCTGCAGAAACAATGAGGGAGGTTATTCGAGAAAACTCCGAGAACCAAC
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GGAAAAAGCATTTCATTGAAGGGAGGCGACCCGGAGAAGGCGAAACAAGAGGGGAAACCAGAATCACCAGAAGCACCTTCAAATCCACAAACCCCAAAAGAAACAACAAA
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TTCTCAGTTCATGGTAACTGGCTAAACGACCTTTGGACTCTGAATCGATCTTATACACATTATTTTGTGTGATATTGACAATTTTTTGGTGAAGAAATTACTGATCTGAT
GAGATTAAAAAGACAGAAAAGATAAATAAAATGGTTCAAAGGAAGTTTGGAACTTTTCTCATTTTCTTTGATGTGATGAAACATGAGAATCAGTACCCCCATTTGTATTG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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