; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc03g0060101 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc03g0060101
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionUPF0301 protein
Genome locationCMiso1.1chr03:397520..402356
RNA-Seq ExpressionCmc03g0060101
SyntenyCmc03g0060101
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR003774 - Protein of unknown function UPF0301


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578309.1 hypothetical protein SDJN03_22757, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.1e-18287.26Show/hide
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XP_022993090.1 uncharacterized protein LOC111489210 isoform X2 [Cucurbita maxima]1.1e-18287.53Show/hide
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XP_023550640.1 uncharacterized protein LOC111808722 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-18287.53Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMD9 Uncharacterized protein6.6e-19996.7Show/hide
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A0A1S3B2S1 uncharacterized protein LOC1034853835.6e-20699.73Show/hide
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A0A5A7T638 UPF0301 protein5.6e-20699.73Show/hide
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A0A6J1FL02 uncharacterized protein LOC111445188 isoform X22.5e-18287.26Show/hide
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A0A6J1JXJ8 uncharacterized protein LOC111489210 isoform X25.1e-18387.53Show/hide
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A1BEV6 UPF0301 protein Cpha266_08852.9e-1828.12Show/hide
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        GL +G     ++ + L+  G+++P + RFF+GY+GW   QL EE E   WY+A  S ++I       + E +W   ++  GG Y  ++  P+
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B3QMC9 UPF0301 protein Cpar_06623.8e-1828.35Show/hide
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        M + G +L+A+  L     F+RTV+L+      H  EG  G ++N+P+  K+        +  + F E    LH GGP++             +   +EV
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        +PGL +G     ++ + L+  G+++P + RFF+GYAGW   QL++E E   WY A  S+  +         E +W   ++  GG Y  ++  P+
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Q3AQ69 UPF0301 protein Cag_16011.5e-1930.06Show/hide
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        F+RTV+L+      H +EG  G ++NRPL  K++       D+     +  LH GGP++ +           +H  +EV+PG+ +G     DE + L+  
Subjt:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVMPGLCFGARNSLDEAAVLVKK

Query:  GILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGSSSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK
        G++ P + RF++GYAGW   QL  E E   WY A  + ++I       + E +W   ++  GG Y  ++  P+
Subjt:  GILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGSSSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK

Q3B561 UPF0301 protein Plut_06372.2e-1828.57Show/hide
Query:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECS--LHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVMPGLCFGARNSLDEAAVLV
        F+RTV+++      H  +G  G ++NRP+  +++       +    F E    LH GGP++++           + G E+++PGL +G     +E   L+
Subjt:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECS--LHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVMPGLCFGARNSLDEAAVLV

Query:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGSSSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK
          G+LKP + RFF+GYAGW   QL  E E   WY A  +  ++         E +W   ++  GG Y  ++  P+
Subjt:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGSSSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK

Q8KEM4 UPF0301 protein CT06631.1e-1729.71Show/hide
Query:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECS--LHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVMPGLCFGARNSLDEAAVLV
        F+RTV+L+      H +EG  G ++N+P+  K+        +  + F E    LH GGP++     +       + G  EV+PGL +G     ++ + L+
Subjt:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECS--LHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVMPGLCFGARNSLDEAAVLV

Query:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGSSSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK
          G++K  + RFF+GYAGW   QL  E E   WY A  SS  +         E +W   ++  GG Y  ++  P+
Subjt:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGSSSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G33780.1 Protein of unknown function (DUF179)1.1e-11667.38Show/hide
Query:  FSSSYP-----FGAELLRLLEIRVFKPKLSSPAF---LVRATAKKNHDNSPSPENGDHSVPGDDAKSKNISDGNESNETSSKKPHHVNLDWREFRANLFA
        FSSS P     F  +L   LE R    K+S+  +   +VRAT+KK++D+S S        PGD ++    S+GN+S ++++ K   +N DWREFRANLF 
Subjt:  FSSSYP-----FGAELLRLLEIRVFKPKLSSPAF---LVRATAKKNHDNSPSPENGDHSVPGDDAKSKNISDGNESNETSSKKPHHVNLDWREFRANLFA

Query:  REQAEKVEADVETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFS
        +EQ EK EA+        HES+ + LKWAHPIP PETGCVLVATEKLDG RTF RTVVLLLR+G+RHPQEGPFGVVINRPLHK IKHMK T  +LATTFS
Subjt:  REQAEKVEADVETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFS

Query:  ECSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVMPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGSSSDS
        ECSL+FGGPLEASMFLLKTG+K+K+ GFEEVMPGL FG RNSLDEAAVLVKKG+LKPQ+FRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYW+VAACSS+LI G    +
Subjt:  ECSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVMPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGSSSDS

Query:  SSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPKQDM
        SSE LWEEILQLMGG YSELSRKPK D+
Subjt:  SSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPKQDM

AT3G19780.1 LOCATED IN: endomembrane system1.4e-1531.85Show/hide
Query:  PMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECSLHFGGPLE----ASMFLLKTGEKSKLHGF
        P  +TG VLVATEKL    TF ++ +L++++G   P+ G  G++ N+ +  K     P   + A    E  L FGGP+       + L +  + S  H  
Subjt:  PMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECSLHFGGPLE----ASMFLLKTGEKSKLHGF

Query:  EEVMPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV
         E+ PG+ F    S+      +K   L P ++ FF+GY+ W  +QL +EI    W V
Subjt:  EEVMPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV

AT3G19780.2 LOCATED IN: endomembrane system1.4e-1531.85Show/hide
Query:  PMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECSLHFGGPLE----ASMFLLKTGEKSKLHGF
        P  +TG VLVATEKL    TF ++ +L++++G   P+ G  G++ N+ +  K     P   + A    E  L FGGP+       + L +  + S  H  
Subjt:  PMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECSLHFGGPLE----ASMFLLKTGEKSKLHGF

Query:  EEVMPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV
         E+ PG+ F    S+      +K   L P ++ FF+GY+ W  +QL +EI    W V
Subjt:  EEVMPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV

AT3G29240.1 Protein of unknown function (DUF179)2.8e-4840.12Show/hide
Query:  MTSRRFSSSYPFGAELLRLLEIRVFK-PKLSSPAFLVRATAKKNHDNSPSPEN---GDHSVPGDDAKSKNISDGNESNETSSKKPHHVNLDWREFRANLF
        +TSR  S       EL+  ++ R+F  PK +S  F+ R  A      SP   N    D   P +D    ++     +N TS       + DWREFRA L 
Subjt:  MTSRRFSSSYPFGAELLRLLEIRVFK-PKLSSPAFLVRATAKKNHDNSPSPEN---GDHSVPGDDAKSKNISDGNESNETSSKKPHHVNLDWREFRANLF

Query:  AREQAEKVEAD---------VETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKP
        A EQA   E D         V     ++     +  KWAH I  PETGC+L+ATEKLDGV  FE+TV+LLL  G      GP GV++NRP    IK  K 
Subjt:  AREQAEKVEAD---------VETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKP

Query:  TNIDLATTFSECSLHFGGPLEASMFLLK-----TGEKSKLHGFEEVMPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV
        T +D+A TFS+  L FGGPLE  +FL+        E  K   F +VM GL +G R S+  AA +VK+ ++   + RFF GY GW+ +QL+ EI   YW V
Subjt:  TNIDLATTFSECSLHFGGPLEASMFLLK-----TGEKSKLHGFEEVMPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV

Query:  AACSSNLIGGSSSDSSSEGLWEEILQLMG
        AACSS ++   S+   S GLW+E+L L+G
Subjt:  AACSSNLIGGSSSDSSSEGLWEEILQLMG

AT3G29240.2 Protein of unknown function (DUF179)2.8e-4840.12Show/hide
Query:  MTSRRFSSSYPFGAELLRLLEIRVFK-PKLSSPAFLVRATAKKNHDNSPSPEN---GDHSVPGDDAKSKNISDGNESNETSSKKPHHVNLDWREFRANLF
        +TSR  S       EL+  ++ R+F  PK +S  F+ R  A      SP   N    D   P +D    ++     +N TS       + DWREFRA L 
Subjt:  MTSRRFSSSYPFGAELLRLLEIRVFK-PKLSSPAFLVRATAKKNHDNSPSPEN---GDHSVPGDDAKSKNISDGNESNETSSKKPHHVNLDWREFRANLF

Query:  AREQAEKVEAD---------VETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKP
        A EQA   E D         V     ++     +  KWAH I  PETGC+L+ATEKLDGV  FE+TV+LLL  G      GP GV++NRP    IK  K 
Subjt:  AREQAEKVEAD---------VETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKP

Query:  TNIDLATTFSECSLHFGGPLEASMFLLK-----TGEKSKLHGFEEVMPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV
        T +D+A TFS+  L FGGPLE  +FL+        E  K   F +VM GL +G R S+  AA +VK+ ++   + RFF GY GW+ +QL+ EI   YW V
Subjt:  TNIDLATTFSECSLHFGGPLEASMFLLK-----TGEKSKLHGFEEVMPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV

Query:  AACSSNLIGGSSSDSSSEGLWEEILQLMG
        AACSS ++   S+   S GLW+E+L L+G
Subjt:  AACSSNLIGGSSSDSSSEGLWEEILQLMG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCTCTTTGCTGCCAATGTCAAGAACACCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACTCCTCCTTCTCCCTTTTCACTCAAACACTCCTTTCCTGATAGACCCATTTCTTGCTC
TCTGGCGATGACTTCGAGGAGATTCTCTTCTTCATATCCCTTTGGCGCTGAACTTCTCCGCTTGCTTGAGATCCGTGTTTTCAAGCCCAAGCTTTCCTCTCCCGCTTTTC
TCGTGCGAGCCACTGCCAAGAAGAATCACGACAATTCTCCATCTCCTGAAAATGGAGATCACTCTGTTCCTGGAGATGACGCTAAATCAAAGAATATTTCTGATGGCAAC
GAAAGTAATGAAACTTCTTCCAAGAAACCACATCATGTAAATTTGGACTGGCGAGAATTCAGAGCGAACCTATTTGCTCGTGAGCAGGCAGAAAAGGTCGAAGCTGATGT
GGAAACCCAGACTGCAAATGCTCACGAGTCTAAGGGTCTTGCGCTGAAGTGGGCACATCCTATTCCTATGCCTGAGACTGGCTGTGTGCTTGTTGCCACCGAGAAGTTGG
ATGGTGTTCGCACTTTTGAGCGAACTGTCGTCCTTCTCCTCAGATCTGGAAGCAGACACCCTCAGGAGGGACCGTTTGGTGTCGTGATAAATAGGCCACTCCACAAAAAG
ATCAAGCATATGAAACCAACCAATATTGACTTAGCAACTACATTTTCCGAGTGCTCTCTACATTTTGGGGGGCCTCTTGAGGCGAGCATGTTTTTGCTGAAAACAGGAGA
AAAATCGAAACTCCATGGGTTTGAAGAAGTGATGCCAGGCCTCTGCTTTGGTGCTCGAAACAGCCTAGATGAAGCTGCAGTGCTGGTGAAGAAGGGAATCCTTAAACCTC
AGGACTTCAGATTCTTTGTGGGTTATGCTGGTTGGCAACTGGATCAGTTGAGGGAGGAGATTGAATCAGATTACTGGTATGTGGCAGCTTGTAGCTCAAATCTAATTGGT
GGAAGCTCATCAGATTCCTCATCAGAGGGACTATGGGAAGAGATTTTGCAGTTAATGGGTGGTCACTATTCAGAGTTGAGCAGAAAGCCTAAGCAAGATATGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGGACCAAAGAAGTAAGTTAGAGTGAGTAAGTAAGTAGAACAACATTCCGTTAGACAATGGCATATTCGGTGTGTATGTGTATCGCTCTACATCATTTTCACTCTCTTC
TCTCTCTGCCCTTACCTTAACTGTTAGCTGCTCATTGTTTGGCTTTCAATCTTCAATATATATCGCCTAAATATTCTCTCTATTTTCTTCTTCTTACTCCTCTGGATTGG
ATCATCGTTTCCGACGCCTTCTTCCCACCAAAAAAATCCCTTTCGGATATGGATCTCTTTGCTGCCAATGTCAAGAACACCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACTCCTCCTTC
TCCCTTTTCACTCAAACACTCCTTTCCTGATAGACCCATTTCTTGCTCTCTGGCGATGACTTCGAGGAGATTCTCTTCTTCATATCCCTTTGGCGCTGAACTTCTCCGCT
TGCTTGAGATCCGTGTTTTCAAGCCCAAGCTTTCCTCTCCCGCTTTTCTCGTGCGAGCCACTGCCAAGAAGAATCACGACAATTCTCCATCTCCTGAAAATGGAGATCAC
TCTGTTCCTGGAGATGACGCTAAATCAAAGAATATTTCTGATGGCAACGAAAGTAATGAAACTTCTTCCAAGAAACCACATCATGTAAATTTGGACTGGCGAGAATTCAG
AGCGAACCTATTTGCTCGTGAGCAGGCAGAAAAGGTCGAAGCTGATGTGGAAACCCAGACTGCAAATGCTCACGAGTCTAAGGGTCTTGCGCTGAAGTGGGCACATCCTA
TTCCTATGCCTGAGACTGGCTGTGTGCTTGTTGCCACCGAGAAGTTGGATGGTGTTCGCACTTTTGAGCGAACTGTCGTCCTTCTCCTCAGATCTGGAAGCAGACACCCT
CAGGAGGGACCGTTTGGTGTCGTGATAAATAGGCCACTCCACAAAAAGATCAAGCATATGAAACCAACCAATATTGACTTAGCAACTACATTTTCCGAGTGCTCTCTACA
TTTTGGGGGGCCTCTTGAGGCGAGCATGTTTTTGCTGAAAACAGGAGAAAAATCGAAACTCCATGGGTTTGAAGAAGTGATGCCAGGCCTCTGCTTTGGTGCTCGAAACA
GCCTAGATGAAGCTGCAGTGCTGGTGAAGAAGGGAATCCTTAAACCTCAGGACTTCAGATTCTTTGTGGGTTATGCTGGTTGGCAACTGGATCAGTTGAGGGAGGAGATT
GAATCAGATTACTGGTATGTGGCAGCTTGTAGCTCAAATCTAATTGGTGGAAGCTCATCAGATTCCTCATCAGAGGGACTATGGGAAGAGATTTTGCAGTTAATGGGTGG
TCACTATTCAGAGTTGAGCAGAAAGCCTAAGCAAGATATGTAGTTTACTTATCTGAAGGAAGGAAAGATTGAAAAAACTCCCAAAGTTCAAATGTGTAATCTACGTTAAA
GCCAAATGTACAGAAGTTAGCTGGCTTTCGAAATTTAGCAGACGGACAGCTACTACCTTTTTATAGCCTACTTCTAAATGTAATTTATGTATATCCTGTTCACATTTGCT
TAATTCAATAGTCTTTTTAGAATATGCCTACATAAATTTTTACA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLFAANVKNTAAAAAATPPSPFSLKHSFPDRPISCSLAMTSRRFSSSYPFGAELLRLLEIRVFKPKLSSPAFLVRATAKKNHDNSPSPENGDHSVPGDDAKSKNISDGN
ESNETSSKKPHHVNLDWREFRANLFAREQAEKVEADVETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKK
IKHMKPTNIDLATTFSECSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVMPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIG
GSSSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPKQDM