| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0025443.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.1e-90 | 95.05 | Show/hide |
Query: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP K NVVADALSRK
Subjt: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
Query: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
VAHSA LITKQ PLLRDFERAEIAVSVGEV SQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDF ISSD GL+F
Subjt: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
|
|
| KAA0050011.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 8.1e-91 | 95.6 | Show/hide |
Query: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
MQQG+VVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQI TDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCE+LYHPGK NVVADALSRK
Subjt: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
Query: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
VAHSAALITKQ PLLRDFERAEIAVSVGEV SQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSD GL F
Subjt: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
|
|
| KAA0063370.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.1e-90 | 94.51 | Show/hide |
Query: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
MQQGKVVAYASRQLK HEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGK NVVADALSRK
Subjt: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
Query: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
VAHSAALITKQ PLLRDFERAEIAVSVGEV SQLAQLSVQPTLRQ+IIVAQLNDPYLVEKRR+VETGQGE+FSISSD GL+F
Subjt: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
|
|
| TYK04739.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.1e-90 | 95.05 | Show/hide |
Query: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP K NVVADALSRK
Subjt: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
Query: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
VAHSA LITKQ PLLRDFERAEIAVSVGEV SQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDF ISSD GL+F
Subjt: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
|
|
| TYK19164.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.0e-90 | 94.51 | Show/hide |
Query: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
MQQGKVVAYA RQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFT+KELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGK NVV DALSRK
Subjt: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
Query: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
VAHSAALITKQ PLLRDFERAEIAVSVGEV SQLA+LSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSD GL+F
Subjt: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SLA1 Pol protein | 1.5e-90 | 95.05 | Show/hide |
Query: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP K NVVADALSRK
Subjt: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
Query: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
VAHSA LITKQ PLLRDFERAEIAVSVGEV SQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDF ISSD GL+F
Subjt: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
|
|
| A0A5A7U8T4 Pol protein | 3.9e-91 | 95.6 | Show/hide |
Query: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
MQQG+VVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQI TDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCE+LYHPGK NVVADALSRK
Subjt: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
Query: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
VAHSAALITKQ PLLRDFERAEIAVSVGEV SQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSD GL F
Subjt: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
|
|
| A0A5A7V809 Reverse transcriptase | 1.5e-90 | 94.51 | Show/hide |
Query: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
MQQGKVVAYASRQLK HEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGK NVVADALSRK
Subjt: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
Query: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
VAHSAALITKQ PLLRDFERAEIAVSVGEV SQLAQLSVQPTLRQ+IIVAQLNDPYLVEKRR+VETGQGE+FSISSD GL+F
Subjt: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
|
|
| A0A5D3C2W7 Pol protein | 1.5e-90 | 95.05 | Show/hide |
Query: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP K NVVADALSRK
Subjt: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
Query: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
VAHSA LITKQ PLLRDFERAEIAVSVGEV SQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDF ISSD GL+F
Subjt: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
|
|
| A0A5D3D6H0 Pol protein | 1.9e-90 | 94.51 | Show/hide |
Query: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
MQQGKVVAYA RQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFT+KELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGK NVV DALSRK
Subjt: MQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
Query: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
VAHSAALITKQ PLLRDFERAEIAVSVGEV SQLA+LSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSD GL+F
Subjt: VAHSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDYGLIF
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 3.6e-17 | 44.9 | Show/hide |
Query: QQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSR
Q G ++Y SR L HE NY T + EL A+V+A K +RHYL G +I +DH+ L + + K+ N + RW + ++D +I Y GKEN VADALSR
Subjt: QQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSR
|
|
| P10401 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon gypsy | 4.7e-17 | 43 | Show/hide |
Query: QQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEK-IQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
Q+G+ + SR LK EQNY T++ EL A+V+AL +++LYG + I IFTDH+ L + + N + +RW + ++ ++ Y PGKEN VADALSR+
Subjt: QQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEK-IQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRK
|
|
| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 5.7e-15 | 42.86 | Show/hide |
Query: QQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSR
Q G +++ SR L HE NY + EL A+V+A K +RHYL G + I +DH+ L++ KE + RW + +Y +I Y GKEN VADALSR
Subjt: QQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSR
|
|
| Q8I7P9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus | 2.1e-17 | 43.62 | Show/hide |
Query: VAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGE-KIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSR
+AY SR L E+NY T + E+ A++++L R YLYG I+++TDH+ L + + N + +RW +++Y+CE++Y PGK NVVADALSR
Subjt: VAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGE-KIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSR
|
|
| Q9UR07 Transposon Tf2-11 polyprotein | 1.6e-12 | 30.46 | Show/hide |
Query: VAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYG--EKIQIFTDHKSLKYFFTQKE--LNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRKVA
V Y S ++ + NY D E+ A++ +LK WRHYL E +I TDH++L T + N R RW ++D++ EI Y PG N +ADALSR
Subjt: VAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYG--EKIQIFTDHKSLKYFFTQKE--LNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKENVVADALSRKVA
Query: HSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGED
++ + P+ +D E I + + Q+S+ + +++ ND L+ E +R+ E Q +D
Subjt: HSAALITKQVPLLRDFERAEIAVSVGEVASQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGED
|
|
