; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc03g0063581 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc03g0063581
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptionlight-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic
Genome locationCMiso1.1chr03:4110173..4118812
RNA-Seq ExpressionCmc03g0063581
SyntenyCmc03g0063581
Gene Ontology termsGO:0006850 - mitochondrial pyruvate transmembrane transport (biological process)
GO:0009642 - response to light intensity (biological process)
GO:0010207 - photosystem II assembly (biological process)
GO:0016310 - phosphorylation (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
GO:0050833 - pyruvate transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7016405.1 Light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.2e-7487.11Show/hide
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XP_004140959.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucumis sativus]6.5e-7589.53Show/hide
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XP_008441491.1 PREDICTED: proline-rich receptor-like protein kinase PERK14 [Cucumis melo]7.9e-8999.48Show/hide
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XP_023551626.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.2e-7487.11Show/hide
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XP_038884716.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Benincasa hispida]3.8e-7588.14Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBA0 Uncharacterized protein3.2e-7589.53Show/hide
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A0A1S3B3J8 proline-rich receptor-like protein kinase PERK143.8e-8999.48Show/hide
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A0A6J1FIC8 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic4.6e-7486.6Show/hide
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A0A6J1HG91 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic3.0e-6578.28Show/hide
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A0A6J1K1U3 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic3.9e-7386.08Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FEC1 Light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic3.7e-4164.41Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G34000.1 one-helix protein 22.7e-4264.41Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTCCTTCTCTCAGAGACCCCTCGCCGCCCTCTCCCCCTTCGCCCACGCCTCCTCTCAAGCCTTCTCCTCCCTCGCAATCGCCTCCCTCACCGGTTTTGAAACAGGATAAT
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GAATGAAATTTCTAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTCGCTGTTGGATTACTGACTGAGTATGCAACTGGTTCAAACTTTGTTGATCAAGTAAAGATCCTTCTCTCAA
ATTTTGGGATAATAGATCTCGAATGA
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ATATCCCCTCAAATCCCAATCCATTTCTCTTAACCAAATCCATTTTTCATCTTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTCCTTTTTGACTTCAATTCCCAATTCCTTCGATTCTT
CCATTTCACTTCCACTCACAATTTTCTGAAATGTCAGGGGCTTGTTCAATCCCCTTCGCCAACATCAAAATCCCCTCCACTTCTTCCTCACCGGCCGCCACCGCCTCTGC
CGCTTCTCCCTCCGCCTCCGCCTCCTCTTCCGCTTCTTCTTCATCCTCCCTTCACTCTTCCCTCCGATTCCCCTCCTCCAAGCCCTTCCTCTTCACCATTCGAAGCTCTC
AGACCGAAGGCCCTCTTCGGAGACCCTCCGCTCCTTCTCTCAGAGACCCCTCGCCGCCCTCTCCCCCTTCGCCCACGCCTCCTCTCAAGCCTTCTCCTCCCTCGCAATCG
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TCAGGGACCGTTCTTTGGCTTCATCGGGAAGAATGAAATTTCTAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTCGCTGTTGGATTACTGACTGAGTATGCAACTGGTTCAAACT
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CTACATGATGTAATTCATCCTATAGTCTTTATGAGAGTTTTGTTGTCTGTTACACTTAATTACCATTCAAGTATGTGTGCTCCTTGCAATACTTACTGTTTTTCTGTTAT
ATATAAAAATCTTCCCTTTTTTATGAGTCTTTGTAATTCTAATGCACTGGGAGCATATTTCTTGTTCACACCTTGCCAAAATTCTGTACCTTCATTTATTGGAGGTTCCA
TTTACATAATAAAAACCTTGTAACTATGATTCATTTCTTCTTACTTCTATTACTAGCATTACTTCCTGTTGCGTCTTTTTATCAACTAGAGATAGTTCCGCCTCTGACTG
TCGTTTGTGTTTCTGTCGGTAGTTTCCTTATGTATTTAGCCTTTGACTTACTGTCTTTCCCTCTCAACTCATTCTTTGTTGTATACAGTTGCCTAGTTTGAAACTTGATT
GAGCAGTAGAATGGTTGTTTGCTCTCTTACAAACTTGAATGAAATCTTTACCCTAGGAGTGTGAATCATTAGAGTTGGATTGAGTTGAATTTTTAAAAGAATTTATTTTT
TTAGTTCATTGGTTTAGTTCACAATTTGGTTCAACCTAAACTAAACCAAAAATTAACTTCATTATTTGTTTCTCATTCATCGTTGTGTTCATTCTCACTTCTCTGGTTCT
TCTTTGTATCTTTTGTTTGTTGTTGGCCTTCATCATCATCTTTCAACATCTCTATCTATATCAATATCCCTTGTTTCATTCTCTCCCTGTTCTTGAATGGAGTTGTCGAT
CATCCACTACTCTTTCTTGTCGGGAGCTTCCAACCATCATTTTTTGTACCATCTATAACGATTGTGTTTTTATTTCTCTTCGTTATTTTTTCAAGTTCTGACCATAAAAA
CTTTAAACTTTTTATTGGATAGTTGGAGTTTAATGTCTTAAACAACTTAACTATACTCATATTAGAAGATTTTAAAAAACTTGAAAACTTTGTTGACCCAAAAATGAGTA
AAAATAAATTTAATATTATATCATTCCATGGAAATGAAATTACAAAGTAGCATAAAACTCATGATGAACAAGTTTGAGTTAGATTAAGATTGTGATTGAAAAATTCAAAT
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ACAATTGAAAGAAATGTTGTGGTGCATCTCATCCACACGAAATGCCGATGCCAAAACTACTGATCGAGCTTTTCCTGAACAACTGTGATATCGAGCTTATCTTGATACTC
GTCATCGTTGCGCAACTTCACGTCGCAAATCCGATCCAATAACTCGACCACATTAGACATAGGAGGCCTTTCTCTAGACTTCTCACTCGTGCACAAACAAGCGATCCTAA
AATACTCCTTCACATTGGCCTCTACTAATTCGTCGTTCGAAATATTAGCATCAACCATTTCCATATGTCTATTTTGGGCCACTAAAATCCTAGCCCATTCTATTAAGCCC
ACTTCTCTTTCGTCCAACAACATGGGCAAATTGGGCCTTTGGCCCATTGCAACTTCGAACATCAAAATCCCAAAACTGTACACGTCAGCCTTCACCGTGGCCACCGTCAC
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CCTCGAATTCAGAGTCCAATAAGACATTACCGGCCTTAATATCTCTATGGATAATGGGCTGAGGAAGGCCATGTAAATAGGAAAGCCCATTAGCAACCCCTCTCATGATC
TTCAATCTGGTATCCCATGGCAATGGCTGCCGCGAGGGCAAATAGCCATCGGAATCCTGATCGTCGGAGGAGGTTTCGTACAAGCAATTATCGAGACTTCCTCTCTCGAT
GAATTCGTAGATCAAGAGCCTATCGGGGCCGGAAACACAGTATCCCAAGATTTTAACAATATTCCGATGGCGGAGTTTACCTAGAGTTTCCATCTCGGCTCGGAATTCTC
TGAATCCTTGGAAGGCGTCAGGATTGAGTCTCTTGATAGCGACGGTAGCGCCGGAGGAGAGACGAGCTTTGTAAACGAGGCCGAAGGAGCCATCGCCGACGACTAAATCG
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