; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc03g0063721 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc03g0063721
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionCopia protein
Genome locationCMiso1.1chr03:4254368..4255176
RNA-Seq ExpressionCmc03g0063721
SyntenyCmc03g0063721
Gene Ontology termsGO:0006259 - DNA metabolic process (biological process)
GO:0016779 - nucleotidyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0051133.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]9.2e-4461.35Show/hide
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KAA0057477.1 Copia protein [Cucumis melo var. makuwa]6.6e-5080.8Show/hide
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TYJ96769.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]2.7e-4360.74Show/hide
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TYK30173.1 Copia protein [Cucumis melo var. makuwa]6.6e-5080.8Show/hide
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XP_022154602.1 uncharacterized protein LOC111021822 [Momordica charantia]3.1e-4770.07Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7U5H7 Putative mitochondrial protein4.4e-4461.35Show/hide
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A0A5A7US38 Copia protein3.2e-5080.8Show/hide
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A0A5D3BCJ6 Putative mitochondrial protein1.3e-4360.74Show/hide
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A0A5D3E251 Copia protein3.2e-5080.8Show/hide
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A0A6J1DM39 uncharacterized protein LOC1110218221.5e-4770.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P04146 Copia protein4.5e-1734.92Show/hide
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        NL+ W++K+Q++ A SSTE+E+  L     + +W+  LL+ ++  +     ++ DN    ++A NP  H R KHI+I   F  +QV    + ++YIP+ +
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        QLAD  TKP   + F  LR KL +++
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P10978 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-945.6e-1235.96Show/hide
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        +SW SK Q   A S+TE+E+        ++IW+ + L EL   +H K  +++CD+ SA  L+ N ++HARTKHI++   +I + V   +L+V  I +++ 
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Query:  LADCLTKPFTHSHF
         AD LTK    + F
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Q94HW2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE12.5e-2846.56Show/hide
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        + DQLAD LTKP + + F    SK+ V  +P
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Q9ZT94 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE25.6e-2845.8Show/hide
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        + DQLAD LTKP +   F     K+ VI++P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G23160.1 cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 84.3e-1544.44Show/hide
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ATMG00810.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein4.4e-0448.65Show/hide
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        +G N++SWS+K+Q   +RSSTE+E+R LA  A+++ W
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTAATAATTTGGTTTCTTGGTCTTCAAAGAAACAAAGTGCTGCAGCTCGTTCAAGCACCGAATCGGAACATCGTGTATTAGCACATGTTGCATCGAAAATTATTTG
GGTCACTCAACTACTTTCTGAACTCTCTACTCTGATTCATACTAAACCTATTTTGTGGTGTGATAACATTAGTGCAGAGGCGCTTGCAACCAATCCTGTCTTTCATGCTA
GAACTAAGCACATTGAGATAGATGTGTTTTTCATTTATGATCAAGTTCTTCGCGGTGCACTTGAAGTTCAATATATACCTTCATCCGATCAATTGGCAGATTGTCTTACA
AAGCCTTTTACCCATTCTCACTTTTATTATTTGAGGTCCAAACTCAGGGTAATTGAATTACCCTCTCGTTTGAGGGAGAATATTAGAAAAGGTTGTCACACAAGCAATAC
ACATGGATCCTCAACAAATGCCATCTCATCATTCTCACGGAATTATAAAAAATTCCAGAACATTCAAATGGTTAGAAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCTAGTCTGTTGCTGCATACTGTGTTTTTATGGGTAATAATTTGGTTTCTTGGTCTTCAAAGAAACAAAGTGCTGCAGCTCGTTCAAGCACCGAATCGGAACATCGTGTA
TTAGCACATGTTGCATCGAAAATTATTTGGGTCACTCAACTACTTTCTGAACTCTCTACTCTGATTCATACTAAACCTATTTTGTGGTGTGATAACATTAGTGCAGAGGC
GCTTGCAACCAATCCTGTCTTTCATGCTAGAACTAAGCACATTGAGATAGATGTGTTTTTCATTTATGATCAAGTTCTTCGCGGTGCACTTGAAGTTCAATATATACCTT
CATCCGATCAATTGGCAGATTGTCTTACAAAGCCTTTTACCCATTCTCACTTTTATTATTTGAGGTCCAAACTCAGGGTAATTGAATTACCCTCTCGTTTGAGGGAGAAT
ATTAGAAAAGGTTGTCACACAAGCAATACACATGGATCCTCAACAAATGCCATCTCATCATTCTCACGGAATTATAAAAAATTCCAGAACATTCAAATGGTTAGAAATTA
GTTGAAGGAAGATTTCTTTACCAATTACTTGCTTACACTTGTATAAATTGTATTGGGTCTTTACTATTATTTTATTATTTTCTTTTCCATCATTCTAGAGTTTACCACTG
TATAAATGCATCCTTATCTTCATTCATTAATACAAGAGAAAAGGAAGAAATATTATCTCTTCAGAAAAATCTTTCTCCAAACCGATCCTTTCTCCACGTGGTAATTAAAA
TCCTTCAATTTTTGTATAGTTTGTATAAAAAAAAATGGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGNNLVSWSSKKQSAAARSSTESEHRVLAHVASKIIWVTQLLSELSTLIHTKPILWCDNISAEALATNPVFHARTKHIEIDVFFIYDQVLRGALEVQYIPSSDQLADCLT
KPFTHSHFYYLRSKLRVIELPSRLRENIRKGCHTSNTHGSSTNAISSFSRNYKKFQNIQMVRN