; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc03g0065931 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc03g0065931
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionGag/pol protein
Genome locationCMiso1.1chr03:7657394..7657759
RNA-Seq ExpressionCmc03g0065931
SyntenyCmc03g0065931
Gene Ontology termsGO:0015074 - DNA integration (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001584 - Integrase, catalytic core
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily
IPR036397 - Ribonuclease H superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P04146 Copia protein2.9e-1537.27Show/hide
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P10978 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-942.2e-2645Show/hide
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        +++ VRSM+  A+LP SFWG
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Q12491 Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein2.0e-0827.93Show/hide
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Q94HW2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE17.2e-1433.94Show/hide
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Q9ZT94 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE22.0e-1637.61Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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