| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0049776.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.5e-117 | 70.98 | Show/hide |
Query: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
M++ II+PST PYSSPVLLV+KKDGSW+FCVDY ALN VT+PDKFPIPV+EELFDEL+GA +FSKIDLKAGYHQIRM ED+EKT FRTHEGH EF+VM
Subjt: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
Query: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
PFGLTNAPSTFQALMN +FKP+LR K +EEH QHLE+VLE+L+E+ELYAN KC FAKT++ YL H IS KG+EVDPEKIR++KEWP
Subjt: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
Query: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
P NV E+ GFLGLTGYYRRFV+NYGS++APLTQLLK G Y+W AFEKLK AMMT+P+LA+P+F+LPF+IE+DASG+GVGA
Subjt: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
| KAA0066118.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.5e-117 | 70.98 | Show/hide |
Query: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
M+ II+PST PYSSPVLLV+KKDGSW+FCVDY ALN VT+PDKFPIPV+EELFDEL+GA +FSKIDLKAGYHQIRM ED+EKT FRTHEGH EF+VM
Subjt: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
Query: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
PFGLTNAPSTFQALMN +FKP+LR K +EEH QHLE+VLE+L+E+ELYAN KC FAKT++ YL H IS KG+EVDPEKIR++KEWP
Subjt: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
Query: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
P+NV E+ GFLGLTGYYRRFV+NYGS++APLTQLLK G Y+W AFEKLK AMMT+P+LA+P+F+LPF+IE+DASG+GVGA
Subjt: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
| TYK15157.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.5e-117 | 70.98 | Show/hide |
Query: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
M+ II+PST PYSSPVLLV+KKDGSW+FCVDY ALN VT+PDKFPIPV+EELFDEL+GA +FSKIDLKAGYHQIRM ED+EKT FRTHEGH EF+VM
Subjt: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
Query: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
PFGLTNAPSTFQALMN +FKP+LR K +EEH QHLE+VLE+L+E+ELYAN KC FAKT++ YL H IS KG+EVDPEKIR++KEWP
Subjt: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
Query: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
P+NV E+ GFLGLTGYYRRFV+NYGS++APLTQLLK G Y+W AFEKLK AMMT+P+LA+P+F+LPF+IE+DASG+GVGA
Subjt: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
| TYK15990.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.5e-117 | 70.98 | Show/hide |
Query: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
M++ II+PST PYSSPVLLV+KKDGSW+FCVDY ALN VT+PDKFPIPV+EELFDEL+GA +FSKIDLKAGYHQIRM ED+EKT FRTHEGH EF+VM
Subjt: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
Query: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
PFGLTNAPSTFQALMN +FKP+LR K +EEH QHLE+VLE+L+E+ELYAN KC FAKT++ YL H IS KG+EVDPEKIR++KEWP
Subjt: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
Query: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
P NV E+ GFLGLTGYYRRFV+NYGS++APLTQLLK G Y+W AFEKLK AMMT+P+LA+P+F+LPF+IE+DASG+GVGA
Subjt: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
| TYK23090.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.5e-117 | 70.98 | Show/hide |
Query: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
M++ II+PST PYSSPVLLV+KKDGSW+FCVDY ALN VT+PDKFPIPV+EELFDEL+GA +FSKIDLKAGYHQIRM ED+EKT FRTHEGH EF+VM
Subjt: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
Query: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
PFGLTNAPSTFQALMN +FKP+LR K +EEH QHLE+VLE+L+E+ELYAN KC FAKT++ YL H IS KG+EVDPEKIR++KEWP
Subjt: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
Query: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
P NV E+ GFLGLTGYYRRFV+NYGS++APLTQLLK G Y+W AFEKLK AMMT+P+LA+P+F+LPF+IE+DASG+GVGA
Subjt: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7U2S1 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 2.2e-117 | 70.98 | Show/hide |
Query: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
M++ II+PST PYSSPVLLV+KKDGSW+FCVDY ALN VT+PDKFPIPV+EELFDEL+GA +FSKIDLKAGYHQIRM ED+EKT FRTHEGH EF+VM
Subjt: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
Query: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
PFGLTNAPSTFQALMN +FKP+LR K +EEH QHLE+VLE+L+E+ELYAN KC FAKT++ YL H IS KG+EVDPEKIR++KEWP
Subjt: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
Query: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
P NV E+ GFLGLTGYYRRFV+NYGS++APLTQLLK G Y+W AFEKLK AMMT+P+LA+P+F+LPF+IE+DASG+GVGA
Subjt: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
| A0A5A7U6J3 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 2.2e-117 | 70.98 | Show/hide |
Query: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
M++ II+PST PYSSPVLLV+KKDGSW+FCVDY ALN VT+PDKFPIPV+EELFDEL+GA +FSKIDLKAGYHQIRM ED+EKT FRTHEGH EF+VM
Subjt: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
Query: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
PFGLTNAPSTFQALMN +FKP+LR K +EEH QHLE+VLE+L+E+ELYAN KC FAKT++ YL H IS KG+EVDPEKIR++KEWP
Subjt: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
Query: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
P NV E+ GFLGLTGYYRRFV+NYGS++APLTQLLK G Y+W AFEKLK AMMT+P+LA+P+F+LPF+IE+DASG+GVGA
Subjt: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
| A0A5D3CTA1 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 2.2e-117 | 70.98 | Show/hide |
Query: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
M+ II+PST PYSSPVLLV+KKDGSW+FCVDY ALN VT+PDKFPIPV+EELFDEL+GA +FSKIDLKAGYHQIRM ED+EKT FRTHEGH EF+VM
Subjt: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
Query: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
PFGLTNAPSTFQALMN +FKP+LR K +EEH QHLE+VLE+L+E+ELYAN KC FAKT++ YL H IS KG+EVDPEKIR++KEWP
Subjt: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
Query: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
P+NV E+ GFLGLTGYYRRFV+NYGS++APLTQLLK G Y+W AFEKLK AMMT+P+LA+P+F+LPF+IE+DASG+GVGA
Subjt: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
| A0A5D3CXB1 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 2.2e-117 | 70.98 | Show/hide |
Query: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
M++ II+PST PYSSPVLLV+KKDGSW+FCVDY ALN VT+PDKFPIPV+EELFDEL+GA +FSKIDLKAGYHQIRM ED+EKT FRTHEGH EF+VM
Subjt: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
Query: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
PFGLTNAPSTFQALMN +FKP+LR K +EEH QHLE+VLE+L+E+ELYAN KC FAKT++ YL H IS KG+EVDPEKIR++KEWP
Subjt: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
Query: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
P NV E+ GFLGLTGYYRRFV+NYGS++APLTQLLK G Y+W AFEKLK AMMT+P+LA+P+F+LPF+IE+DASG+GVGA
Subjt: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
| A0A5D3DI73 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 2.2e-117 | 70.98 | Show/hide |
Query: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
M++ II+PST PYSSPVLLV+KKDGSW+FCVDY ALN VT+PDKFPIPV+EELFDEL+GA +FSKIDLKAGYHQIRM ED+EKT FRTHEGH EF+VM
Subjt: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVM
Query: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
PFGLTNAPSTFQALMN +FKP+LR K +EEH QHLE+VLE+L+E+ELYAN KC FAKT++ YL H IS KG+EVDPEKIR++KEWP
Subjt: PFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLR--------------KSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWP
Query: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
P NV E+ GFLGLTGYYRRFV+NYGS++APLTQLLK G Y+W AFEKLK AMMT+P+LA+P+F+LPF+IE+DASG+GVGA
Subjt: VPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 2.6e-59 | 41.98 | Show/hide |
Query: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLV-KKKDGS----WQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHC
M+ II+ S PY+SP+ +V KK+D S ++ +DY LN +T+ D+ PIP ++E+ +L + F+ IDL G+HQI M E V KT F T GH
Subjt: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLV-KKKDGS----WQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHC
Query: EFLVMPFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLRK--------------SLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRS
E+L MPFGL NAP+TFQ MN I +P L K SL+EHLQ L LV E L + L KCEF K + +L H+++ G++ +PEKI +
Subjt: EFLVMPFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLRK--------------SLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRS
Query: IKEWPVPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKG-PYEWIAAAHE-AFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
I+++P+PT E+ FLGLTGYYR+F+ N+ +A P+T+ LKK + ++ AF+KLK + PIL +P+F+ F + TDAS +GA
Subjt: IKEWPVPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKG-PYEWIAAAHE-AFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 3.1e-60 | 41.41 | Show/hide |
Query: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKD-----GSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHC
M+ +I+ S PY+SP +V KK ++ +DY LN +TIPD++PIP ++E+ +L F+ IDL G+HQI M +E + KT F T GH
Subjt: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKKD-----GSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHC
Query: EFLVMPFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLRK--------------SLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRS
E+L MPFGL NAP+TFQ MN+I +P L K SL EHL ++LV L + L KCEF K + +L HI++ G++ +P K+++
Subjt: EFLVMPFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLRK--------------SLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRS
Query: IKEWPVPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKK------GPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
I +P+PT E+ FLGLTGYYR+F+ NY +A P+T LKK E+I EAFEKLK ++ PIL LP+F F + TDAS +GA
Subjt: IKEWPVPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKK------GPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 1.1e-52 | 41.37 | Show/hide |
Query: IKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVMPFGLTN
I PS P SSPV+LV KKDG+++ CVDY LN+ TI D FP+P I+ L + A +F+ +DL +GYHQI M +D KT F T G E+ VMPFGL N
Subjt: IKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVMPFGLTN
Query: APSTFQALMNSIFKP------YL------RKSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWPVPTNVHEV
APSTF M F+ YL +S EEH +HL+ VLE L+ L KKC+FA + E+L + I + + K +I+++P P V +
Subjt: APSTFQALMNSIFKP------YL------RKSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWPVPTNVHEV
Query: CGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
FLG+ YYRRF+ N +A P+ QL +W +A EKLK A+ P+L N +++ TDAS G+GA
Subjt: CGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
| Q8I7P9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus | 8.8e-55 | 37.95 | Show/hide |
Query: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKK-----DGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHC
++ II+PS PY+SP+ +V KK + ++ VD+ LN VTIPD +PIP I L A F+ +DL +G+HQI M + D+ KT F T G
Subjt: MMAPDIIKPSTRPYSSPVLLVKKK-----DGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHC
Query: EFLVMPFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLRK--------------SLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRS
EFL +PFGL NAP+ FQ +++ I + ++ K + H ++L LVL L + L N +K F T+VE+L +I++ G++ DP+K+R+
Subjt: EFLVMPFGLTNAPSTFQALMNSIFKPYLRK--------------SLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRS
Query: IKEWPVPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLK------------KGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYG
I E P PT+V E+ FLG+T YYR+F+++Y VA PLT L + K P A ++F LK + + ILA P F+ PF + TDAS +
Subjt: IKEWPVPTNVHEVCGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLK------------KGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYG
Query: VGA
+GA
Subjt: VGA
|
|
| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 5.3e-52 | 41.01 | Show/hide |
Query: IKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVMPFGLTN
I PS P SSPV+LV KKDG+++ CVDY LN+ TI D FP+P I+ L + A +F+ +DL +GYHQI M +D KT F T G E+ VMPFGL N
Subjt: IKPSTRPYSSPVLLVKKKDGSWQFCVDYSALNRVTIPDKFPIPVIEELFDELSGASMFSKIDLKAGYHQIRMCKEDVEKTVFRTHEGHCEFLVMPFGLTN
Query: APSTFQALMNSIFKP------YL------RKSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWPVPTNVHEV
APSTF M F+ YL +S EEH +HL+ VLE L+ L KKC+FA + E+L + I + + K +I+++P P V +
Subjt: APSTFQALMNSIFKP------YL------RKSLEEHLQHLELVLEVLQENELYANTKKCEFAKTKVEYLSHIISGKGVEVDPEKIRSIKEWPVPTNVHEV
Query: CGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
FLG+ YYRRF+ N +A P+ QL +W +A +KLK A+ P+L N +++ TDAS G+GA
Subjt: CGFLGLTGYYRRFVRNYGSVAAPLTQLLKKGPYEWIAAAHEAFEKLKVAMMTVPILALPNFSLPFKIETDASGYGVGA
|
|
