; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc03g0068031 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc03g0068031
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptiontetrapyrrole-binding protein, chloroplastic
Genome locationCMiso1.1chr03:11455564..11457099
RNA-Seq ExpressionCmc03g0068031
SyntenyCmc03g0068031
Gene Ontology termsGO:0010019 - chloroplast-nucleus signaling pathway (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0046906 - tetrapyrrole binding (molecular function)
InterPro domainsIPR008629 - GUN4-like
IPR037215 - GUN4-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140886.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Cucumis sativus]5.1e-12393.08Show/hide
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XP_008445737.1 PREDICTED: tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Cucumis melo]2.4e-13399.22Show/hide
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XP_022953248.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]7.3e-10681.32Show/hide
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XP_023547651.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.6e-10681.15Show/hide
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XP_038884158.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Benincasa hispida]2.1e-12191.47Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCD2 GUN4 domain-containing protein2.5e-12393.08Show/hide
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A0A1S3BE43 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic1.2e-13399.22Show/hide
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A0A5A7SPC7 Tetrapyrrole-binding protein1.2e-13399.22Show/hide
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A0A6J1GMW2 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like3.6e-10681.32Show/hide
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        NALRG QLM+NIL+HPAFEEDAIE   +E  A DENGG KKGLK+++ER+FKRDYSF
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A0A6J1JPI7 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like1.4e-10580.08Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O19887 Uncharacterized protein ycf531.5e-2134.51Show/hide
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        ++ L+ LL+A +F +A++ T+++L+ LAG+ + +R ++YF++V  I  + +  ++ LW+ +S G FG+S+QKRI+  VNK++ K + K+GW+        
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Query:  QYNYRAFPTEFIWELTEETPEGHLPLTNALRGIQLMSNILNH
           +  +P EF+W +    P GHLPL N LRG+ ++  I ++
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P51202 Uncharacterized protein ycf531.4e-2237.5Show/hide
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        ++  + + +L  LL   +   AD+ T++ LI LAG     R ++YF++++ I  EDL+ ID LW  HS GKFG+ VQ++I+  + K++ + + K+GW   
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           EI +   R +P EF W  T   P+GHLPL N LRG+Q++S + +H A++
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P72583 Ycf53-like protein1.5e-2439.75Show/hide
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        G F L S  +  I +  L   L ++DF  ADE TR  L  LAG GA +R ++YF+EV+   A DL  I+ LW  HS+G FG+SVQ+R++    K+FTKL+
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Query:  MKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEETPEGHLPLTNALRGIQLMSNILNHPAFEE
         K+GW            +  +P  F W+L+   P+GHLPL N LRG+++  ++  HP + +
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Q1XDT5 Uncharacterized protein ycf537.8e-2640.79Show/hide
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        ++  +++ +L  LL  +D  KAD+ T++ LI LAG  A  R ++YF++++ I A+DL+ ID LW  HS GKFG  VQ++I+  V KD+ K + K+GW   
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Query:  LDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEETPEGHLPLTNALRGIQLMSNILNHPAFE
           E+++   R +P EF W      P GHLPL N LRG+Q++S +  H A+E
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Q9LX31 Tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic2.3e-5449.61Show/hide
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        PS  H HR NL   S    ++L LK  ++AA        ++T+++T+++SA +  + S ++  ++ I FD L+  L  ++FR+ADEETRRLLI ++G+ A
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        +KRGYV+FSEV+ I+ EDL+AID+LW KHSDG+FGYSVQ++I+ KV KDFT+ F+K+ WMK LDTE+ QYNYRAFP EF WEL +ETP GHLPLTNALRG
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         QL+  +L+HPAF   A +  GE +   +    + K    +   +R+FK +YSF
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G59400.1 enzyme binding;tetrapyrrole binding1.7e-5549.61Show/hide
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        PS  H HR NL   S    ++L LK  ++AA        ++T+++T+++SA +  + S ++  ++ I FD L+  L  ++FR+ADEETRRLLI ++G+ A
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Query:  LKRGYVYFSEVQFIAAEDLKAIDDLWQKHSDGKFGYSVQKRIFEKVNKDFTKLFMKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEETPEGHLPLTNALRG
        +KRGYV+FSEV+ I+ EDL+AID+LW KHSDG+FGYSVQ++I+ KV KDFT+ F+K+ WMK LDTE+ QYNYRAFP EF WEL +ETP GHLPLTNALRG
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         QL+  +L+HPAF   A +  GE +   +    + K    +   +R+FK +YSF
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCTTCCCACTCTCTCCCATCTCTCCGCCCCTCTCTCCGCCACCCTCACCGCCCTAACCTCTCTCCCACCTCCTTCTCCTCTTCCTCCACTCTCTTCCTCAAACC
AGCTTCCACCGCCGCCGTCACCACCACCACTACCGCCGCCACTTCCTCTCTCTCCGCCGCAGCTGCCGGCTCCTTCTCTCTCTCCTCAGACACCTCCTCCGCCATCTCTT
TCGACGAGCTCGACCGCCTCCTAGCCGCCAAAGACTTCCGGAAAGCCGACGAGGAGACCCGCCGGCTTCTGATCGCCCTTGCCGGCGACGGCGCCCTGAAAAGAGGGTAC
GTCTATTTCTCTGAAGTTCAATTCATTGCCGCCGAGGATCTGAAAGCCATTGACGATTTGTGGCAGAAACACAGCGATGGGAAATTTGGGTACAGCGTACAGAAACGGAT
TTTCGAGAAAGTGAACAAAGATTTCACGAAATTGTTTATGAAACTTGGGTGGATGAAGAAGCTGGATACTGAAATTGAGCAGTACAATTACAGAGCATTTCCGACGGAGT
TTATTTGGGAGCTGACGGAGGAGACGCCTGAAGGGCATCTGCCATTGACTAATGCTTTGAGAGGGATACAGTTAATGAGCAATATTTTGAACCATCCGGCGTTTGAGGAG
GACGCCATTGAAGAGAAAGGTGAAGAAAAATTTGCAGGGGATGAAAATGGAGGATTGAAGAAAGGATTGAAATCGATTACTGAGAGGCTTTTCAAAAGGGATTATAGCTT
TTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACATGAGAATAACAAAAAGAGTTCAATAGCAATAATATTAAAAATGTTTTTGTTGAGAGGGATGGAGAGAGATCCAACCTCACCCTTAACTAACCAATCAAAAGCCTCA
ATTGAATCCTTTTTGATGAGAAACTCTGTTTCCCTTTCACTTCCACTCATTCCTTATCTCTCAATCAAAATTCTCTCAAAACCCCAAAACCCCTCTTTTTCACATTTTCA
ATTTTCATTAACTTTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCTCATGGCAGCTTCCCACTCTCTCCCATCTCTCCGCCCCTCTCTCCGCCACCCTCACCGCCCT
AACCTCTCTCCCACCTCCTTCTCCTCTTCCTCCACTCTCTTCCTCAAACCAGCTTCCACCGCCGCCGTCACCACCACCACTACCGCCGCCACTTCCTCTCTCTCCGCCGC
AGCTGCCGGCTCCTTCTCTCTCTCCTCAGACACCTCCTCCGCCATCTCTTTCGACGAGCTCGACCGCCTCCTAGCCGCCAAAGACTTCCGGAAAGCCGACGAGGAGACCC
GCCGGCTTCTGATCGCCCTTGCCGGCGACGGCGCCCTGAAAAGAGGGTACGTCTATTTCTCTGAAGTTCAATTCATTGCCGCCGAGGATCTGAAAGCCATTGACGATTTG
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GCTGGATACTGAAATTGAGCAGTACAATTACAGAGCATTTCCGACGGAGTTTATTTGGGAGCTGACGGAGGAGACGCCTGAAGGGCATCTGCCATTGACTAATGCTTTGA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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