; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc03g0071371 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc03g0071371
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionReverse transcriptase
Genome locationCMiso1.1chr03:17601518..17602186
RNA-Seq ExpressionCmc03g0071371
SyntenyCmc03g0071371
Gene Ontology termsGO:0006278 - RNA-dependent DNA biosynthetic process (biological process)
GO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0015074 - DNA integration (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0003964 - RNA-directed DNA polymerase activity (molecular function)
GO:0004190 - aspartic-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR041588 - Integrase zinc-binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0035204.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-11494.14Show/hide
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KAA0039191.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa]2.7e-12098.65Show/hide
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KAA0041490.1 hypothetical protein E6C27_scaffold6G00780 [Cucumis melo var. makuwa]2.6e-11595.5Show/hide
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TYK08868.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-11595.95Show/hide
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TYK24364.1 putative polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]2.6e-11595.5Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SVA8 Reverse transcriptase6.2e-11594.14Show/hide
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A0A5A7TC42 Pol protein1.3e-12098.65Show/hide
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A0A5A7TDX1 Reverse transcriptase1.2e-11595.5Show/hide
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A0A5D3CCF0 Pol protein9.5e-11695.95Show/hide
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A0A5D3DL91 Reverse transcriptase1.2e-11595.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein1.2e-1725.88Show/hide
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P0CT35 Transposon Tf2-2 polyprotein1.2e-1725.88Show/hide
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P0CT36 Transposon Tf2-3 polyprotein1.2e-1725.88Show/hide
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P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein1.2e-1725.88Show/hide
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Q9UR07 Transposon Tf2-11 polyprotein1.2e-1725.88Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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