; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc03g0073231 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc03g0073231
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCMiso1.1chr03:20657249..20658121
RNA-Seq ExpressionCmc03g0073231
SyntenyCmc03g0073231
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022990795.1 uncharacterized protein LOC111487577 [Cucurbita maxima]1.6e-6284.72Show/hide
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XP_038886392.1 uncharacterized protein LOC120076591 [Benincasa hispida]9.8e-6586.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K8P1 Uncharacterized protein7.6e-7194.2Show/hide
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A0A1S3C3W7 uncharacterized protein LOC1034965801.7e-75100Show/hide
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A0A5A7SQ79 Putative Nucleolar protein 161.7e-75100Show/hide
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A0A6J1C1Z5 uncharacterized protein LOC1110066836.9e-6485.51Show/hide
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A0A6J1JR28 uncharacterized protein LOC1114875777.6e-6384.72Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G49000.1 unknown protein1.2e-0736.76Show/hide
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        T ++   +     +N   E   + E++  +W + ILMGGKC+  DFSGVI YD NG ++   P ++PR
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AT1G71740.1 unknown protein5.8e-2346.34Show/hide
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AT3G14760.1 unknown protein1.2e-0460.71Show/hide
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        +W + ILMG KC+LP FSG+ILYD  G+
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AT3G18560.1 unknown protein3.8e-0644.68Show/hide
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        E++  +W + ILMGGKC+  D+SGVI YD +G+ +   P ++PR  L
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAAGGCAACTGCAAATCATACATTCTTCACAAGGCACAACCCAGGTTGGCATGGCTGGTGTGAGCCTTCTCCTCTGTGCTTTTGCATTGTTCATGTGTGCTTCCCA
TGCCCGAAAATGGCGCCGCCGTTGGAATGCTTGCTTGGATTATGGATACGAGTTTGAGGATCCTGTCATAGAGTTGAACCAAGAAGCAACGGTTGTGACAACGGGACAAG
TGAATGCCACCGAGCCAGAGAATGACAACAATGAGATGTTCTTCAGTAGAGAGCAACAAGCTTCTATATGGCACAAGAACATTCTCATGGGTGGGAAATGCCAGCTACCG
GACTTCTCAGGAGTCATATTATACGACCCCAATGGAAATGTTGTAACCCCTGCCAAAACTCCACGTCCTTTACTCACCTGGAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTCTAATTGCTTCAGAAAAAACAAGCTTAGAAATTACCCCAAGATGGCAAGGCAACTGCAAATCATACATTCTTCACAAGGCACAACCCAGGTTGGCATGGCTGGTGT
GAGCCTTCTCCTCTGTGCTTTTGCATTGTTCATGTGTGCTTCCCATGCCCGAAAATGGCGCCGCCGTTGGAATGCTTGCTTGGATTATGGATACGAGTTTGAGGATCCTG
TCATAGAGTTGAACCAAGAAGCAACGGTTGTGACAACGGGACAAGTGAATGCCACCGAGCCAGAGAATGACAACAATGAGATGTTCTTCAGTAGAGAGCAACAAGCTTCT
ATATGGCACAAGAACATTCTCATGGGTGGGAAATGCCAGCTACCGGACTTCTCAGGAGTCATATTATACGACCCCAATGGAAATGTTGTAACCCCTGCCAAAACTCCACG
TCCTTTACTCACCTGGAAGTGAAGAGGCCTATTCAAAATCACAAGGCGAAAAGCCAAGGATAAAATATGCAGCTCGAAATTTATCTTTTTCATTTGTTTTCCTGTCATCT
CCAAGAGCTTATCACTGTATGCAGATTTGTATCTTTCAAACCCCTGGATTGTATGCAGTCTTGAAATGAAAATGATAATTGTATCACCAAAACACAAAAACTGTTCATTT
GACATAATCTTAAGAAAGAACCGGCTGATGATTGTAAACGTAGATATGACGACTTTAAAAAGTTATTTTCAATCGTCCAAAACAAGTATTTATCAAATTTTAAGTTTCCT
GTGTAGATGGACGAAGTGACTCGACCACATCAGCAAGTTTAGATTTCAGAGCATCTGGAGATTCCATAAGATGGAATGCCTCTTCTTCCTCAATTTCTAGGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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