| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0025425.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.4e-89 | 89.39 | Show/hide |
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MD ITGL RT RGF +IWVVVDRL KSAHF+P KSTYTASKWAQLYMSEIVRLHGVP+SIVSDRDARFTSKFWKGLQ AMGTRLDF TAFHPQTDGQTER
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LNQVLEDMLRA ALEFPGSWDSHLHLMEFAYNNS+QATIGM PFEALY KCC SP+CW EVGEQRL GLELVQSTNEAI
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|
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| KAA0031931.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 7.4e-89 | 89.94 | Show/hide |
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MD ITGL RT RGFI+IWVVVDRL KSAHF+P KSTYTASKWAQLYMSEIVRLHGVP+SIV DRDARFTSKFWKGLQ AMGTRLDF TAFHPQTDGQTER
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LNQVLEDMLRA ALEFPGSWDSHLHLMEFAYNNS+QATIGMTPFEALY KCC SPICW EVGEQRL G ELVQSTNEAI
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|
|
| KAA0041424.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 5.7e-89 | 88.83 | Show/hide |
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MD ITGL RT RGF +IWVVVDRL KSAHF+P KSTYTASKWAQLYMSEIVRLHGVP+SIVSDRDARFTSKFWKGLQ AMGTRLDF TAFHPQTDGQTER
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LNQVLEDMLRA ALEFPGSWDSHLHLMEFAYNNS+QATIGM PFEALY KCC SP+CWDEVGEQRL G ELVQSTNEA+
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| KAA0064005.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.7e-88 | 88.83 | Show/hide |
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MD ITGL RT RGF +IWVVVDRL KSAHF+P KSTYTASKWAQLYMSEIVRLHGVP+SIVSDRDARFTSKFWKGLQ AMGTRLDF TAFHPQTDGQTER
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LNQVLEDMLRA ALEFPGSWDSHLHLMEFAYNNS+QATIGMTPFEALY +CC SP+CW EVGEQRL G ELVQSTNEAI
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| TYK11727.1 putative polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.1e-95 | 97.7 | Show/hide |
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GLHRTPRGFIMIWVVVDRLFKSAHFI KKSTYTASKWAQLYMSEIVRLHGVPLSIVSDRDARFTSKFWKGLQAAMGTRLDFGTAFHPQTDGQTERLNQVL
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EDMLRA ALEF GSWDSHLHLMEFAYNNSFQATIGMTPFEALYRKCCGSP+CWDEVGEQRLRGLELVQSTNEAI
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|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SLT0 Pol protein | 2.1e-89 | 89.39 | Show/hide |
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MD ITGL RT RGF +IWVVVDRL KSAHF+P KSTYTASKWAQLYMSEIVRLHGVP+SIVSDRDARFTSKFWKGLQ AMGTRLDF TAFHPQTDGQTER
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LNQVLEDMLRA ALEFPGSWDSHLHLMEFAYNNS+QATIGM PFEALY KCC SP+CW EVGEQRL GLELVQSTNEAI
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| A0A5A7SQU8 Reverse transcriptase | 3.6e-89 | 89.94 | Show/hide |
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MD ITGL RT RGFI+IWVVVDRL KSAHF+P KSTYTASKWAQLYMSEIVRLHGVP+SIV DRDARFTSKFWKGLQ AMGTRLDF TAFHPQTDGQTER
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LNQVLEDMLRA ALEFPGSWDSHLHLMEFAYNNS+QATIGMTPFEALY KCC SPICW EVGEQRL G ELVQSTNEAI
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| A0A5A7TDB5 Pol protein | 2.8e-89 | 88.83 | Show/hide |
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MD ITGL RT RGF +IWVVVDRL KSAHF+P KSTYTASKWAQLYMSEIVRLHGVP+SIVSDRDARFTSKFWKGLQ AMGTRLDF TAFHPQTDGQTER
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LNQVLEDMLRA ALEFPGSWDSHLHLMEFAYNNS+QATIGM PFEALY KCC SP+CWDEVGEQRL G ELVQSTNEA+
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| A0A5A7VDP3 Pol protein | 8.0e-89 | 88.83 | Show/hide |
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MD ITGL RT RGF +IWVVVDRL KSAHF+P KSTYTASKWAQLYMSEIVRLHGVP+SIVSDRDARFTSKFWKGLQ AMGTRLDF TAFHPQTDGQTER
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LNQVLEDMLRA ALEFPGSWDSHLHLMEFAYNNS+QATIGMTPFEALY +CC SP+CW EVGEQRL G ELVQSTNEAI
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| A0A5D3CIH0 Putative polyprotein | 5.2e-96 | 97.7 | Show/hide |
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EDMLRA ALEF GSWDSHLHLMEFAYNNSFQATIGMTPFEALYRKCCGSP+CWDEVGEQRLRGLELVQSTNEAI
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein | 1.3e-24 | 36.91 | Show/hide |
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MD IT L + G+ ++VVVDR K A +P + TA + A+++ ++ G P I++D D FTS+ WK + F + PQTDGQTER
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NQ +E +LR P +W H+ L++ +YNN+ + MTPFE ++R
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| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 1.3e-24 | 36.91 | Show/hide |
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MD IT L + G+ ++VVVDR K A +P + TA + A+++ ++ G P I++D D FTS+ WK + F + PQTDGQTER
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NQ +E +LR P +W H+ L++ +YNN+ + MTPFE ++R
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| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 2.1e-25 | 42.07 | Show/hide |
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MD +TGL T MI VVVDR K AHFI + T A++ L I HG P +I SDRD R T+ ++ L +G + +A HPQTDGQ+ER
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Q L +LRAY +W +L +EF YN++ T+G +PFE
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| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 7.1e-26 | 42.76 | Show/hide |
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MD +TGL T MI VVVDR K AHFI + T A++ L I HG P +I SDRD R T+ ++ L +G + +A HPQTDGQ+ER
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| Q9UR07 Transposon Tf2-11 polyprotein | 1.3e-24 | 36.91 | Show/hide |
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MD IT L + G+ ++VVVDR K A +P + TA + A+++ ++ G P I++D D FTS+ WK + F + PQTDGQTER
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NQ +E +LR P +W H+ L++ +YNN+ + MTPFE ++R
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