; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc03g0076971 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc03g0076971
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionRWP-RK domain-containing protein
Genome locationCMiso1.1chr03:24086234..24087652
RNA-Seq ExpressionCmc03g0076971
SyntenyCmc03g0076971
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003035 - RWP-RK domain
IPR044607 - Transcription factor RKD-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8647226.1 hypothetical protein Csa_019049 [Cucumis sativus]8.6e-6097.62Show/hide
Query:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPP-RRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG
        MEQ TPDCQNEPPEQPEEQPP RRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG
Subjt:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPP-RRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG

Query:  DTRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
        DTRVRAEAEIERVQKEL DFCARIRI
Subjt:  DTRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI

XP_008445526.1 PREDICTED: protein RKD2-like isoform X1 [Cucumis melo]2.4e-62100Show/hide
Query:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD
        MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD
Subjt:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD

Query:  TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
        TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
Subjt:  TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI

XP_008445527.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103488516 isoform X2 [Cucumis melo]2.4e-62100Show/hide
Query:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD
        MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD
Subjt:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD

Query:  TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
        TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
Subjt:  TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI

XP_031744044.1 protein RKD3 isoform X1 [Cucumis sativus]8.6e-6097.62Show/hide
Query:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPP-RRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG
        MEQ TPDCQNEPPEQPEEQPP RRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG
Subjt:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPP-RRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG

Query:  DTRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
        DTRVRAEAEIERVQKEL DFCARIRI
Subjt:  DTRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI

XP_031744045.1 protein RKD4 isoform X2 [Cucumis sativus]8.6e-6097.62Show/hide
Query:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPP-RRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG
        MEQ TPDCQNEPPEQPEEQPP RRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG
Subjt:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPP-RRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG

Query:  DTRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
        DTRVRAEAEIERVQKEL DFCARIRI
Subjt:  DTRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGT8 RWP-RK domain-containing protein4.2e-6097.62Show/hide
Query:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPP-RRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG
        MEQ TPDCQNEPPEQPEEQPP RRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG
Subjt:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPP-RRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG

Query:  DTRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
        DTRVRAEAEIERVQKEL DFCARIRI
Subjt:  DTRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI

A0A1S3BCG6 protein RKD2-like isoform X11.2e-62100Show/hide
Query:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD
        MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD
Subjt:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD

Query:  TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
        TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
Subjt:  TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI

A0A1S3BCY1 uncharacterized protein LOC103488516 isoform X21.2e-62100Show/hide
Query:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD
        MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD
Subjt:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD

Query:  TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
        TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
Subjt:  TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI

A0A5A7V999 Protein RKD2-like isoform X11.2e-62100Show/hide
Query:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD
        MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD
Subjt:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD

Query:  TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
        TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
Subjt:  TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI

A0A6J1BQU6 protein RKD3-like1.4e-5288.8Show/hide
Query:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD
        M+Q  P+ QNEPP    E+PPRRPSLAAQR RTGRMTVNDVW+YLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD
Subjt:  MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGD

Query:  TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI
        TR RAEAEIERVQKELADFCA IRI
Subjt:  TRVRAEAEIERVQKELADFCARIRI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0JC27 Protein NLP24.0e-0735.87Show/hide
Query:  PEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVN-DVW-EYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGDTR
        PE  E+  P     A +++ T    ++ DV  +Y    + +A+K L VC T LK+ICR  G+SRWP RKI    R +  ++  +NS +G  R
Subjt:  PEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVN-DVW-EYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGDTR

Q84TH9 Protein NLP76.7e-0742.11Show/hide
Query:  EYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG
        +Y    + +A+K L VC T +K+ICR+ G+SRWP RKI+   R I  L+  + S  G
Subjt:  EYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG

Q9FGD1 Protein RKD38.0e-0835.44Show/hide
Query:  EYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGDT---RVRAEAEIERVQKELAD
        +Y ++PI++A+K+LN+  T+LKK CR  G+ RWP+RK+ S    IA L+  + ++ G T   ++R   E+  ++K++ +
Subjt:  EYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGDT---RVRAEAEIERVQKELAD

Q9M1B0 Protein NLP98.8e-0735.94Show/hide
Query:  MTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG
        +++N + +Y    + +A+K L VC T LK+ICR+ G+ RWP RKI    R +  ++  ++S  G
Subjt:  MTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG

Q9M9U9 Protein RKD18.8e-0731.94Show/hide
Query:  YLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGDTRVRAEAEIERVQKE
        Y ++PI++A+++LN+  T+LKK CR  G+ RWP+RK+ S ++ I+ ++        +   +    +E+++KE
Subjt:  YLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGDTRVRAEAEIERVQKE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18790.1 RWP-RK domain-containing protein6.3e-0831.94Show/hide
Query:  YLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGDTRVRAEAEIERVQKE
        Y ++PI++A+++LN+  T+LKK CR  G+ RWP+RK+ S ++ I+ ++        +   +    +E+++KE
Subjt:  YLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGDTRVRAEAEIERVQKE

AT3G59580.1 Plant regulator RWP-RK family protein6.3e-0835.94Show/hide
Query:  MTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG
        +++N + +Y    + +A+K L VC T LK+ICR+ G+ RWP RKI    R +  ++  ++S  G
Subjt:  MTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG

AT3G59580.2 Plant regulator RWP-RK family protein6.3e-0835.94Show/hide
Query:  MTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG
        +++N + +Y    + +A+K L VC T LK+ICR+ G+ RWP RKI    R +  ++  ++S  G
Subjt:  MTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG

AT4G24020.1 NIN like protein 74.8e-0842.11Show/hide
Query:  EYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG
        +Y    + +A+K L VC T +K+ICR+ G+SRWP RKI+   R I  L+  + S  G
Subjt:  EYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYG

AT5G66990.1 RWP-RK domain-containing protein5.7e-0935.44Show/hide
Query:  EYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGDT---RVRAEAEIERVQKELAD
        +Y ++PI++A+K+LN+  T+LKK CR  G+ RWP+RK+ S    IA L+  + ++ G T   ++R   E+  ++K++ +
Subjt:  EYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGDT---RVRAEAEIERVQKELAD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAACAAACCACTCCAGACTGCCAAAATGAGCCGCCGGAGCAACCGGAGGAGCAGCCTCCAAGACGACCCTCCCTTGCTGCACAGCGACAAAGGACGGGAAGA
ATGACGGTGAATGACGTGTGGGAATATCTTCATCTACCAATATCAGAAGCTTCAAAAAAACTGAATGTGTGTAATACAGTATTGAAGAAAATATGCCGTCGGAGC
GGTCTTAGCCGGTGGCCTTACAGAAAGATACGTAGTTATGAGAGGCGAATAGCAGCACTGAGAGCCACCATGAATTCAAGCTACGGAGATACGAGAGTTCGAGCC
GAAGCCGAGATCGAAAGGGTTCAAAAAGAACTTGCTGATTTTTGTGCACGAATCAGGATTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAGCAGAAAACTAGAGATTCATGGTAGGCTAGGGATGATTAGCCATGCAATATTGGAGCATAAACCCATTGTTAATGTGGATAATATAAGTCCTCAGTATCAAAT
GTTCGATTTTTGCGAGAAAAGCTGTGAGGAGATAAAGCAATTTCTACTACAGTATTGTCTGAAGCAAATATTGGAAGATTACAATATGATTCCAGATCCAATGTC
CAATTTCTACGATGCCCTTTGTGTTGGAATTGATTGGTTTGAAAATCTCAATACTGATGGTTTCTTTCAACTCTCTCCTGACAATTCTGGTTCGTAATTTTCTTT
TTTTCCTTCCAAATTTTAATTAATTATAATCTTCAATTTCATTTATCACACCTTCCTCCGTTTATTGTTTTTGAAGAAGATGAAGAAATGGAACAAACCACTCCA
GACTGCCAAAATGAGCCGCCGGAGCAACCGGAGGAGCAGCCTCCAAGACGACCCTCCCTTGCTGCACAGCGACAAAGGACGGGAAGAATGACGGTGAATGACGTG
TGGGAATATCTTCATCTACCAATATCAGAAGCTTCAAAAAAACTGAATGTGTGTAATACAGTATTGAAGAAAATATGCCGTCGGAGCGGTCTTAGCCGGTGGCCT
TACAGAAAGATACGTAGTTATGAGAGGCGAATAGCAGCACTGAGAGCCACCATGAATTCAAGCTACGGAGATACGAGAGTTCGAGCCGAAGCCGAGATCGAAAGG
GTTCAAAAAGAACTTGCTGATTTTTGTGCACGAATCAGGATTTGAGTTTTCTTCCCCTCACTTTTTTGTACATTTTCACTTGAGTTCTTTTGTGTTTTGTGGTCA
TTTTAGGTTATGGCTTTTAGCTTTTGTTGAGCGAAAAGTATAGTTAGTCGAAACTAAAATTTTGATTATGTATAATTTAGCACATTACTATTTATTTGCGTTTGA
ATCTGCATTCATGCATGTGATTTTCATATAATTTGAAAAACTAAGGCTCGTTTGTTTAAGAACATGAAATTACTATCGTAAGCCCCAAGTTATTTAGTTGTAACT
GTTTTTTATTATAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEQTTPDCQNEPPEQPEEQPPRRPSLAAQRQRTGRMTVNDVWEYLHLPISEASKKLNVCNTVLKKICRRSGLSRWPYRKIRSYERRIAALRATMNSSYGDTRVRA
EAEIERVQKELADFCARIRI