; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc03g0086461 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc03g0086461
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptionethylene-responsive transcription factor ESR1
Genome locationCMiso1.1chr03:29680639..29681643
RNA-Seq ExpressionCmc03g0086461
SyntenyCmc03g0086461
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001471 - AP2/ERF domain
IPR016177 - DNA-binding domain superfamily
IPR036955 - AP2/ERF domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0061059.1 ethylene-responsive transcription factor ESR1 [Cucumis melo var. makuwa]4.3e-18399.7Show/hide
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KAG6598241.1 Ethylene-responsive transcription factor ESR2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-9360.45Show/hide
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XP_004143060.1 ethylene-responsive transcription factor ESR2 [Cucumis sativus]2.1e-16191.1Show/hide
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XP_008444372.1 PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor ESR1 [Cucumis melo]8.7e-184100Show/hide
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XP_038886431.1 ethylene-responsive transcription factor ESR2-like [Benincasa hispida]1.9e-13881.69Show/hide
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           N  NT + NQ+APD  RLFGD      HNLILDD+ QCPELL PFP KLQNA
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMT0 AP2/ERF domain-containing transcription factor1.0e-16191.1Show/hide
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A0A1S3BAY0 ethylene-responsive transcription factor ESR14.2e-184100Show/hide
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A0A5A7V5R7 Ethylene-responsive transcription factor ESR12.1e-18399.7Show/hide
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A0A6J1HFS9 ethylene-responsive transcription factor ESR2-like1.7e-9262.65Show/hide
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        SD+Y+IPRFNFP +    LPR+N+SNWP+FSTP+RG DFLWSG AQRINTASPTLDMLLLRDFLNFPS+N ++   PS   NT  T        + +   
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        PPPPP++       YSS+FLPKDSPDSGLLEE+IHGFFPKS  SN N +   D   +   N+++     +LDLLDY        FN              
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         R+FG+  N++LDDIFQCPE+LN F +KL+NA
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A0A6J1K7P9 ethylene-responsive transcription factor ESR2-like1.0e-9261.52Show/hide
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        + TTTTT   T+++ LKRTLRDHNS++ TMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPP PHS+ 
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Query:  SDDYLIPRFNFPPKH--SLPRLNSSNWPIFSTPNRGPDFLWSGHAQRINTASPTLDMLLLRDFLNFPSSNYNHSSKPSYPINTTTTTTTNNNNSSTTKIT
        SD+Y+IPRFNFP +    LPR+N+SNWP+FSTP+RG +FLWSG AQRINTASPTLDMLLLRDFLNFPS+N ++   PS             NN++ TKI 
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Query:  PPPPPEN-------YSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPKSHDSN-NINNSDDYFNNNDENKNANLSGHNLDLLDYQLADENFNNNNTALINQDAPDHGR
          PPP++       YSS+FLPKDSPDSGLLEE+IHGFFPKS +SN N ++  D   +   ++++     +LDLLDY          + ++  +      R
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         FG+  N+++DDIFQCPE+LN F +KL+NA
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FYK5 Ethylene-responsive transcription factor ESR24.0e-2237.89Show/hide
Query:  KCNATTPTTPTATTTTTTTTTTTTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNF
        + ++T P +P   TT    +    +  S             T+RYRGVRRRPWGRYAAEIRDP SKERRWLGTFDTAEEAA AYDCAAR+MRGLKARTNF
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Query:  VYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSSNWPIFSTPNRGPDFLWSGHAQRINTASPTLDMLLLRDFLNFPSSNYNHSSKPSYP------INT
        VYP                          +P L+S +  IFS                    SP ++M LLRD LN  S + +  +  +YP      +N 
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Query:  TTTTTTNNNNSSTTKITPPP------PPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPK
            +  N N     ++P          E+  S     +   SGLL+E++ GF PK
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Q9FZ90 Ethylene-responsive transcription factor ERF0873.4e-2158.42Show/hide
Query:  MRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLS------SDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSS
        ++Y GVRRRPWGRYAAEIR+P +KER WLGTFDTAEEAA AYD AARS+RGL ARTNFVY   P      S      S  ++   FN  P   L   NS+
Subjt:  MRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLS------SDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSS

Query:  N
        N
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Q9M644 Ethylene-responsive transcription factor LEP5.2e-2257.63Show/hide
Query:  TTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRF
        TT+S S K+     +   GT R+ GVRRRPWGRYAAEIRDP +KER WLGTFDTAEEAA AYD AARSMRG +ARTNFVY   PP     SS    I   
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Query:  NFPPKHSLPRLNSSNWPI
        + PP    P    SN P+
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Q9MAI5 Ethylene-responsive transcription factor 89.8e-2159.34Show/hide
Query:  NSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNF-VYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRFNFPP
        ++++  +RYRGVR+RPWGRYAAEIRDP  K R WLGTFDTA++AARAYD AAR  RG+KA+TNF V   S P   S   D     RF  PP
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Q9SAD4 Ethylene-responsive transcription factor ESR14.6e-2642.98Show/hide
Query:  PTTPTATTTTTTTTTTTTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSP
        P T   T  T +  +     SS   T+    + S T RYRGVRRRPWGRYAAEIRDP SKERRWLGTFDTAE+AA AYD AAR+ RG KARTNF YP++ 
Subjt:  PTTPTATTTTTTTTTTTTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSP

Query:  PAPHSLSSDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSSNWPIFSTP--NRGPDFLWSGHAQRI-NTASPTLDMLLLRDFLNFPSSNYNHSSKPSYPINTTTTTTTNNN
          P          PRF+F  K S P   S+  P+ S P  +   +F  +  AQRI NT S     + LRD         + SS+ + P N +   ++++ 
Subjt:  PAPHSLSSDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSSNWPIFSTP--NRGPDFLWSGHAQRI-NTASPTLDMLLLRDFLNFPSSNYNHSSKPSYPINTTTTTTTNNN

Query:  NSSTTKITPPPPPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPKS
        ++S T        EN  S F P++S D+GLL+EV+  F  K+
Subjt:  NSSTTKITPPPPPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPKS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12980.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein3.2e-2742.98Show/hide
Query:  PTTPTATTTTTTTTTTTTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSP
        P T   T  T +  +     SS   T+    + S T RYRGVRRRPWGRYAAEIRDP SKERRWLGTFDTAE+AA AYD AAR+ RG KARTNF YP++ 
Subjt:  PTTPTATTTTTTTTTTTTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSP

Query:  PAPHSLSSDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSSNWPIFSTP--NRGPDFLWSGHAQRI-NTASPTLDMLLLRDFLNFPSSNYNHSSKPSYPINTTTTTTTNNN
          P          PRF+F  K S P   S+  P+ S P  +   +F  +  AQRI NT S     + LRD         + SS+ + P N +   ++++ 
Subjt:  PAPHSLSSDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSSNWPIFSTP--NRGPDFLWSGHAQRI-NTASPTLDMLLLRDFLNFPSSNYNHSSKPSYPINTTTTTTTNNN

Query:  NSSTTKITPPPPPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPKS
        ++S T        EN  S F P++S D+GLL+EV+  F  K+
Subjt:  NSSTTKITPPPPPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPKS

AT1G24590.1 DORNROSCHEN-like2.8e-2337.89Show/hide
Query:  KCNATTPTTPTATTTTTTTTTTTTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNF
        + ++T P +P   TT    +    +  S             T+RYRGVRRRPWGRYAAEIRDP SKERRWLGTFDTAEEAA AYDCAAR+MRGLKARTNF
Subjt:  KCNATTPTTPTATTTTTTTTTTTTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNF

Query:  VYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSSNWPIFSTPNRGPDFLWSGHAQRINTASPTLDMLLLRDFLNFPSSNYNHSSKPSYP------INT
        VYP                          +P L+S +  IFS                    SP ++M LLRD LN  S + +  +  +YP      +N 
Subjt:  VYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSSNWPIFSTPNRGPDFLWSGHAQRINTASPTLDMLLLRDFLNFPSSNYNHSSKPSYP------INT

Query:  TTTTTTNNNNSSTTKITPPP------PPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPK
            +  N N     ++P          E+  S     +   SGLL+E++ GF PK
Subjt:  TTTTTTNNNNSSTTKITPPP------PPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPK

AT1G28160.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein2.4e-2258.42Show/hide
Query:  MRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLS------SDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSS
        ++Y GVRRRPWGRYAAEIR+P +KER WLGTFDTAEEAA AYD AARS+RGL ARTNFVY   P      S      S  ++   FN  P   L   NS+
Subjt:  MRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLS------SDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSS

Query:  N
        N
Subjt:  N

AT1G53170.1 ethylene response factor 87.0e-2259.34Show/hide
Query:  NSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNF-VYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRFNFPP
        ++++  +RYRGVR+RPWGRYAAEIRDP  K R WLGTFDTA++AARAYD AAR  RG+KA+TNF V   S P   S   D     RF  PP
Subjt:  NSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNF-VYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRFNFPP

AT5G13910.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein3.7e-2357.63Show/hide
Query:  TTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRF
        TT+S S K+     +   GT R+ GVRRRPWGRYAAEIRDP +KER WLGTFDTAEEAA AYD AARSMRG +ARTNFVY   PP     SS    I   
Subjt:  TTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRF

Query:  NFPPKHSLPRLNSSNWPI
        + PP    P    SN P+
Subjt:  NFPPKHSLPRLNSSNWPI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGTGCAATGCCACCACTCCCACCACTCCCACCGCCACAACAACGACAACCACCACCACCACCACCACCACCACCAGTAGTAGTCTCAAGCGAACCCTCCGA
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TGGCTTGGAACTTTCGACACTGCTGAAGAAGCTGCACGTGCCTACGACTGCGCTGCACGCTCCATGCGTGGCCTGAAAGCTCGCACCAATTTCGTTTACCCTTCA
TCTCCACCCGCCCCTCATTCCCTCTCCTCCGACGATTACTTAATCCCTCGCTTCAATTTCCCTCCTAAACACTCTCTCCCTCGCCTTAACTCCTCTAACTGGCCC
ATTTTTTCAACTCCAAATCGTGGGCCTGACTTCCTATGGTCCGGTCATGCACAGCGGATCAACACCGCTTCTCCCACTCTCGACATGCTTCTCCTTCGTGATTTC
CTCAATTTCCCTTCTTCCAATTATAACCATTCCTCCAAACCCTCTTATCCTATTAATACCACCACCACTACTACTACTAATAATAATAATAGCAGCACTACCAAA
ATAACTCCTCCTCCTCCTCCTGAAAATTACTCCTCTGAATTTCTCCCCAAGGACTCCCCTGATTCCGGTTTATTGGAAGAGGTAATTCACGGCTTCTTTCCCAAA
TCACATGATTCCAACAATATCAACAACTCTGACGATTATTTCAACAATAACGACGAAAACAAGAACGCCAATCTCAGTGGTCATAATTTGGACTTATTGGATTAC
CAATTGGCCGACGAAAACTTCAACAACAACAACACCGCCTTGATTAATCAAGATGCTCCCGATCACGGCCGTCTGTTTGGCGACGCTCACAACTTGATTCTGGAT
GATATTTTCCAATGTCCAGAGCTTTTAAACCCTTTTCCTTCTAAACTCCAAAACGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TCTCCACCCGCCCCTCATTCCCTCTCCTCCGACGATTACTTAATCCCTCGCTTCAATTTCCCTCCTAAACACTCTCTCCCTCGCCTTAACTCCTCTAACTGGCCC
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CTCAATTTCCCTTCTTCCAATTATAACCATTCCTCCAAACCCTCTTATCCTATTAATACCACCACCACTACTACTACTAATAATAATAATAGCAGCACTACCAAA
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GATATTTTCCAATGTCCAGAGCTTTTAAACCCTTTTCCTTCTAAACTCCAAAACGCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKCNATTPTTPTATTTTTTTTTTTTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPS
SPPAPHSLSSDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSSNWPIFSTPNRGPDFLWSGHAQRINTASPTLDMLLLRDFLNFPSSNYNHSSKPSYPINTTTTTTTNNNNSSTTK
ITPPPPPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPKSHDSNNINNSDDYFNNNDENKNANLSGHNLDLLDYQLADENFNNNNTALINQDAPDHGRLFGDAHNLILD
DIFQCPELLNPFPSKLQNA