; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc04g0090851 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc04g0090851
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptionprotein TIFY 8-like
Genome locationCMiso1.1chr04:2980400..2985563
RNA-Seq ExpressionCmc04g0090851
SyntenyCmc04g0090851
Gene Ontology termsGO:0009611 - response to wounding (biological process)
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InterPro domainsIPR010399 - Tify domain
IPR040390 - TIFY/JAZ family


Homology Show/hide homology
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A0A5D3E7X9 Protein TIFY 8-like isoform X18.0e-22298.76Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
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              +  H   +L+NG G     ++ N    + QPPR                                      G Q    +HQ++++  ++ NV P
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Query:  SNISQSAADEGSRTGMKSPGLLSSFNARHDRRHSSQMLLSCDKQKTKTESLAYKSSNSSSPQGLDSDNRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADIIMALAGSN
        S I+Q+AADEGSRTGMK PG+LSSF                    +K ES A   SN+ + + L S  +QMTIFYGGQAHVFDDVHPNKAD+IMALAGS+
Subjt:  SNISQSAADEGSRTGMKSPGLLSSFNARHDRRHSSQMLLSCDKQKTKTESLAYKSSNSSSPQGLDSDNRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADIIMALAGSN

Query:  GGSWSTNLAPK
        GGSWST L+ K
Subjt:  GGSWSTNLAPK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G32570.1 TIFY domain protein 81.9e-4239.87Show/hide
Query:  IFHDFLGIKTKD-ASVLLA--AKTPDVSFSEAS-TPPSALASSSGGRGLISAASDLASENQ-VCDYLEGVPFYSPRNDISGPENGNRIAGIKRGNPDSAF
        +FHDFLG K    AS  +A     PD   ++A+ TP +A ASS+GG G +S+ SDL   +    ++L+G+  + PR+D+SG    NR +G KR N DS F
Subjt:  IFHDFLGIKTKD-ASVLLA--AKTPDVSFSEAS-TPPSALASSSGGRGLISAASDLASENQ-VCDYLEGVPFYSPRNDISGPENGNRIAGIKRGNPDSAF

Query:  MGPYRNQIPH---ILQNGAGGDRPRYNDNEVVYSMQPPRIASSSLTQHSLGTRFNPSVSKWERPIPSNMSSALNSSLGSQFVPRVHQIASNSSREFNVAP
              +  H   +L+NG G     ++ N    + QPPR                                      G Q    +HQ++++  ++ NV P
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Query:  SNISQSAADEGSRTGMKSPGLLSSFNARHDRRHSSQMLLSCDKQKTKTESLAYKSSNSSSPQGLDSDNRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADIIMALAGSN
        S I+Q+AADEGSRTGMK PG+LSSF                    +K ES A   SN+ + + L S  +QMTIFYGGQAHVFDDVHPNKAD+IMALAGS+
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Query:  GGSWSTNLAPK
        GGSWST L+ K
Subjt:  GGSWSTNLAPK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCGTCAAGGCGCTTATTCCGATGCTGGTTACTGCAGCAATGGTGAGAAGAAGAGTACGAGTCAGGTTCCACAGTTAGGTAATGCGATCTTCCATGATTTTCTTGG
CATTAAGACTAAAGATGCTTCCGTACTTTTGGCCGCGAAGACGCCGGATGTAAGCTTCTCAGAGGCATCGACGCCGCCGTCGGCTTTGGCTTCATCCAGTGGCGGCCGTG
GACTCATCTCCGCTGCCTCCGATCTTGCGTCTGAAAATCAGGTTTGTGATTACCTTGAAGGGGTTCCATTCTATAGTCCAAGGAATGATATATCTGGACCTGAAAATGGT
AACCGAATAGCTGGGATTAAACGCGGTAACCCAGATTCTGCTTTCATGGGACCATATAGAAACCAAATTCCTCATATACTACAAAATGGAGCTGGTGGAGATCGACCAAG
ATACAACGATAATGAGGTGGTTTACAGTATGCAGCCACCACGAATTGCTTCTTCTTCCCTCACACAACATTCTCTTGGCACTAGATTCAATCCTAGTGTTTCCAAATGGG
AGAGACCTATTCCATCAAACATGAGTTCTGCACTAAATTCTTCTCTTGGGAGTCAGTTTGTGCCTCGTGTTCATCAAATAGCTTCCAATTCTTCAAGGGAATTTAATGTT
GCTCCTTCCAATATTTCTCAATCTGCTGCTGATGAAGGATCTAGAACTGGGATGAAAAGCCCTGGACTTTTAAGTAGCTTTAATGCTCGACATGATCGAAGACACTCATC
TCAAATGTTGCTAAGTTGCGACAAGCAGAAGACCAAGACCGAAAGTTTGGCATACAAATCTTCTAACTCTTCAAGTCCGCAGGGTCTTGATTCTGACAACAGACAGATGA
CTATTTTCTACGGCGGTCAAGCTCATGTTTTTGATGATGTCCATCCAAACAAGGCTGATATTATAATGGCCTTAGCTGGATCAAATGGGGGCTCTTGGTCAACAAATTTA
GCACCTAAATTAAATGTAACTAGGGTACCTAGTGAGCAAGAATCAGCTAAAGATTATCATGGAAAGTTATATCATAGTTTGATATCCACCAGTCGAGGTGTTGGCGATAC
TCCGATACCGACACAAACAGGTGATCATCCACGCAGTGTTGCAGTGGAAGAGACCCGAAAACCTGTTCGTGCAGCAGATATCAATGCTGAACAGTACAAAGAAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GACAAGCTTGAACATTTTATTTAAGTACAAAATGTTTATATTTTAATTACAAGTAAACCAAATTTAACTAAACAATTTGCAACTCAAAACCCAAAATTTCAATTTTCTCT
TCAATGGACTGAAGAAGTTGTCTGTCTTCATTCAACAAAATCTTCATCATTCATATATCCTTCTCCATGTGATTTTGATTTTGATGAGCTTCACACCTCTTCAAAATTTC
CTTCTTCCGCAACAAAATTCGTTAACGAACTCACTGAATTTATCATCATTTAATCAAATTGCCTCACCGGCGCCGGCGTCGGGAAGTTTTCTCAAGATGCTTTTTCTGTT
CTGTTTATCTCGAGAAAAGAGCCTGATTCTTTTTTCAGTTTCCTCTCTCTTCTGATTCTTTTTACCTTTTTCTTGTTTTTGGTTCTCTGTATGTTTCTTTTCAAAAACCG
AGTTTCTTGTCTTTTGTTGTTCTCTACACTCTTGCTCTTTATGCAGAGTGAAATGGATGCTTTCGTAAAGAGGCATTGCTTGTGGTTCTGTCTCTAATGGCTCGTCAAGG
CGCTTATTCCGATGCTGGTTACTGCAGCAATGGTGAGAAGAAGAGTACGAGTCAGGTTCCACAGTTAGGTAATGCGATCTTCCATGATTTTCTTGGCATTAAGACTAAAG
ATGCTTCCGTACTTTTGGCCGCGAAGACGCCGGATGTAAGCTTCTCAGAGGCATCGACGCCGCCGTCGGCTTTGGCTTCATCCAGTGGCGGCCGTGGACTCATCTCCGCT
GCCTCCGATCTTGCGTCTGAAAATCAGGTTTGTGATTACCTTGAAGGGGTTCCATTCTATAGTCCAAGGAATGATATATCTGGACCTGAAAATGGTAACCGAATAGCTGG
GATTAAACGCGGTAACCCAGATTCTGCTTTCATGGGACCATATAGAAACCAAATTCCTCATATACTACAAAATGGAGCTGGTGGAGATCGACCAAGATACAACGATAATG
AGGTGGTTTACAGTATGCAGCCACCACGAATTGCTTCTTCTTCCCTCACACAACATTCTCTTGGCACTAGATTCAATCCTAGTGTTTCCAAATGGGAGAGACCTATTCCA
TCAAACATGAGTTCTGCACTAAATTCTTCTCTTGGGAGTCAGTTTGTGCCTCGTGTTCATCAAATAGCTTCCAATTCTTCAAGGGAATTTAATGTTGCTCCTTCCAATAT
TTCTCAATCTGCTGCTGATGAAGGATCTAGAACTGGGATGAAAAGCCCTGGACTTTTAAGTAGCTTTAATGCTCGACATGATCGAAGACACTCATCTCAAATGTTGCTAA
GTTGCGACAAGCAGAAGACCAAGACCGAAAGTTTGGCATACAAATCTTCTAACTCTTCAAGTCCGCAGGGTCTTGATTCTGACAACAGACAGATGACTATTTTCTACGGC
GGTCAAGCTCATGTTTTTGATGATGTCCATCCAAACAAGGCTGATATTATAATGGCCTTAGCTGGATCAAATGGGGGCTCTTGGTCAACAAATTTAGCACCTAAATTAAA
TGTAACTAGGGTACCTAGTGAGCAAGAATCAGCTAAAGATTATCATGGAAAGTTATATCATAGTTTGATATCCACCAGTCGAGGTGTTGGCGATACTCCGATACCGACAC
AAACAGGTGATCATCCACGCAGTGTTGCAGTGGAAGAGACCCGAAAACCTGTTCGTGCAGCAGATATCAATGCTGAACAGTACAAAGAAAGCTAAATCGCGACGACAACG
GCTTTCTTTCCATCCCCATCCTGCCCTCGCCACCCTCGTGCCTTCTGTTTGCAGCAAGAGGTAATTAGCCAAAACTCAAGGGTAAAGAGATTTATAATAGAAGGTATTGT
TGTTAAGTCCAGTTTTCATGAGCATTGTCGTTATTTATCTTTTTAGCAAATACAAAAACAGTCAATTGCTTGCTTAAGGGGATGGGGTTCGCTAATATTTGTTTGATGCA
TAAAAGAAGTTGGTTGCCTTCAAAGCGCTATAAAAATTTCCATATTATCTTATGTGAAGAGTAGTGGAAAATTAGGTTATACTTTTTTTTTTTTGCCCCTAATAAATAAG
ATGCAATGTCATGTCATGGATAGACTCTTTCTTTTTAAGGGTATTTTGGTCATTTCAATTTTGAGATTAATGGGTTCTTTGGGTTTTTTTTTCTTGCTCTTTCCTATTTA
AAAAACTCAATTCCCTCCGGCATTGATTTGATTTTTTTTTTTACTTTTAACTTTTAAATTTTAATTTTATCGACCCTAATTTCGTCGAGGTTGATTATTGGTCGGTTAGA
GTAGGTTTTTCGACTAAAACTTCCACTAAATTGATTATGGTGTGTTTAGTAAAAAGTTCAAGTCGGCCTTGGCAGCTGAAGAATGAAAGTTGGTCATTGGTTTAGCTCTT
TGAATTTTTTTTTTTTTTTAATTTCTGATTTGAGATTTTTTGAAACCGATACTGATCAACCCCTCTTATTCTCCTACCAATCGATTTTGGTTCGATTGGTTGGCTGGATT
TATCGGTCTATCATGGTTATAAGTTTTTTTTTTAAAAAAAAATTACCAATAATTCAAGAGTTAAAAATGTGAGAATTCGAAATTTAAGGGAGAAAGTTGTTGTACCAAAC
TTGACCTAAATTACACATTTATGGATTTTTATTAATATTTTAATTTTAGTACCGACTCTATTTATTGGGTTGAGAGTGTAAAATATTTTTAATAATATCTATACCCACAC
ATCTCTTGATCATGTGGACTTTTTGATCTTCAACGCACATGTTGATGTCAGTTAAGCTACATTCATTTAAATAGTATTAACATGTATTGATGATTTATGTACATATTACA
TCTTGTACTTACATTACTTCCATGAGATCATGCAAATTACAAAATCCCAACTATTCTCTTCCACCGTTTAGAAATAACGAAAATTCTAACGATATCTCTCAAAGTTTTCA
TCTAAAACAAATTAGGAATTTGATTGTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MARQGAYSDAGYCSNGEKKSTSQVPQLGNAIFHDFLGIKTKDASVLLAAKTPDVSFSEASTPPSALASSSGGRGLISAASDLASENQVCDYLEGVPFYSPRNDISGPENG
NRIAGIKRGNPDSAFMGPYRNQIPHILQNGAGGDRPRYNDNEVVYSMQPPRIASSSLTQHSLGTRFNPSVSKWERPIPSNMSSALNSSLGSQFVPRVHQIASNSSREFNV
APSNISQSAADEGSRTGMKSPGLLSSFNARHDRRHSSQMLLSCDKQKTKTESLAYKSSNSSSPQGLDSDNRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADIIMALAGSNGGSWSTNL
APKLNVTRVPSEQESAKDYHGKLYHSLISTSRGVGDTPIPTQTGDHPRSVAVEETRKPVRAADINAEQYKES