; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc04g0091541 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc04g0091541
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionLYR motif-containing protein 2
Genome locationCMiso1.1chr04:3421866..3425357
RNA-Seq ExpressionCmc04g0091541
SyntenyCmc04g0091541
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008011 - Complex 1 LYR protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063314.1 LYR motif-containing protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-35100Show/hide
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XP_023535371.1 uncharacterized protein LOC111796833 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.0e-2679.01Show/hide
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A0A1S3CRB8 LYR motif-containing protein 23.9e-3598.77Show/hide
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A0A5A7V7X8 LYR motif-containing protein 27.9e-36100Show/hide
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A0A5D3E7B8 LYR motif-containing protein 23.9e-3598.77Show/hide
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A0A6J1F8N3 uncharacterized protein LOC1114433217.4e-2679.01Show/hide
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A0A6J1IFA5 uncharacterized protein LOC1114764182.2e-2579.01Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5RES3 LYR motif-containing protein 22.6e-0436.62Show/hide
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Q8R033 LYR motif-containing protein 27.7e-0436.62Show/hide
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Q9NU23 LYR motif-containing protein 23.5e-0436.62Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G76065.1 LYR family of Fe/S cluster biogenesis protein2.4e-2471.05Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTCTTCTCCCATGATTTACGTGAATTTATTCTTCGAGCAAGAGTGTTGAAACTGTATAGACAGGGTTTAAGAACAGCTCGGAAAGCACCTGTTGATGGTCGAGATGA
ATTGAGGCATATGATGAGAGAAGAAATGGAGAAGAACAGAAAGTGTAATGATAGACAGAAAATAAGATTTTTGTTGAGCGAAGGAATAGAGAGATTGAAGCAATTAGATG
AGATGTTGGATATGCAAGGCCATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCAATATCAAAATCGGTCTTCCGTCGTTGAATCCTCAAAGAAATCGGAACCGAACGACAGAAATGATTATACCTCCGATTGAATCAAGCAGGGAATTCGCTTCACTTTA
ATCTGCACCATCAGTGTTATCCTCTTCATTTTGATCATTAAGGAAAGAGAAATCGCGATGGTCTTCTCCCATGATTTACGTGAATTTATTCTTCGAGCAAGAGTGTTGAA
ACTGTATAGACAGGGTTTAAGAACAGCTCGGAAAGCACCTGTTGATGGTCGAGATGAATTGAGGCATATGATGAGAGAAGAAATGGAGAAGAACAGAAAGTGTAATGATA
GACAGAAAATAAGATTTTTGTTGAGCGAAGGAATAGAGAGATTGAAGCAATTAGATGAGATGTTGGATATGCAAGGCCATTAACTAGAGATCTTTCTTTTCTTTCTTTTT
TTATTAATTTTGATTATTGGGAGTTAAGTTTTTCTCCAATCATTTTGGAGTGTCTCATAGAAAGGAATGTTGTTTTAGGGGAAGGATATGAGTTTGGTTTAGGGCTAATC
TTCAAGTTATTGTAATCAAATTGTGATTAAGGTACAAAGGAGTTATGAATTCCACTTCCCACATTATTTGTATCAGTTTGATTTTTATGTTAGGTTTTGAAATAAGAAAC
TGAAATCATCTAAAATTGAGATGAATATGTGGGATTATTGACTGAGACCCAAAAATTTCACCAGTGTTACGAAATATTGAACCTACCATTCCTTGTATGTAAAGATGATT
TCTAAAATTGATTAATACTCCTAACTTAAACTAATCATTTGATTTTTTTGGTTCTCTTTAAAACTGGACTTATAAATGTTCCTTTGCATGAAATTGGCTGTCAAATTTTA
GTGCTTTTAAAACCAAACCAAAGTCAAAATTTGAAAGCTAAACAAATTTAATTTTTAAAACTACATTTTTCTATATGGAATTTGGGTAATGATGGATTATTTTTAGTTGC
AAAATATGGAAATCATGGTAATTAAATTAAACAAAATGTACTTTTTATACCTTACGGGTTTAAATGTATTTAGATGATATTATTGTGGAGGAAAAACACATACTCAAAAA
TTGATAATCTGAGGATAAGCAATAATAAAACAATTTAAAAGGGTAATTAATTATCCATTACAATAACCATTTGTAATTAATCATCCATTATAATTTGATCATACTGAATC
TTCAAAATTTGCCCCTACAAAAAATCATAGGCTGCTAACAAATTCTAGTATATTCTCGGTACCTTTTGCTTTCTGATTTTGATTTTGCTGTAGAGATCTCTCGTAGAACA
GACTAGTGGCTTCAACCCAATTCCTCACTTCTTGTTTAGGATCTTCTCAAATCTGAAACCGGCTCAATGATCCAAAGAAATACGAGATGCCTCTGTCTGTAGATTGATTC
ATATCAGTAACACCGTTTTCAACTACTATAACTTCTGATCTCGAAGCTTTTGCGATTGCGAATACAAATTTGAAAGTAAAAGAAGCCAGTTATTCTACAGGTTCCTTGAG
GCAAACCCTCTCTCAACCATCTTATCCACCAATTCCTCGTGCTTCTTCAACTGTCCTGCCTCTCTTAGCTGTTCCAAAACCATCTTATACAAAGACATGCTGGGTTTTAG
GTTTTTCTCTTCGATCATTTCCCTGAAGAACTTGTAAGCATTGTTCCAATGCCCCATCCCACAATATAATGTTATCAGTTCTCGGTATGTATTAACGTTAGGCTCAACTT
CTTCCTCGTCCATCTCCTTCTTCAACTTGAAAATCATGTCAGCAGATTTCGGTACAGCAAACATTCGCATCAAGATATTGTATGTCGCTGTATTTGGCTTACATCCTACA
TCCTTCATCCTAGCAAACATCCGATGTGCACCATTTACATCTTGCGACTTTGCGATACACCTGAATATAGGGTTGAAAGACGACGCATCTGGGGTGCAACCATTCTTAAT
CATTGAGTTGAGGACTTTTATAGCCTCTCCAAGATTCTCATCCTTGCAATGAGTCTCGATGAGGAAGTTATAAGTAATTAAGTCAGCAGCACAACGCAATCTCCTCATTT
GGTTATAAACTTGCAGCACCTTCTCTGTTCTACCAGCTCTCACATGAACTCTTATAAGATTGTTAAATGTAACTGAATTTGGATTGCAACCAGCATTAAGCATCTCAGCG
AAAACATCATGGGCACGAGTAATTTGACCAGATCTACACAATGCATCAATCACAATGCTATAAGTATAAACATTAGGGCTAATACCTGCCATCTTCATCTCTTTAAATAC
CCTTTCAGCCTCTGAGATATCACCTGCTCGACACCATCCATGAACTAAGCTAGTGTACACAACAACATCAGGTTCGAATTTATGTTTTAGATTATCAAAAAATGATTGGG
CTTCAACTGCCCTTCTCTTCTTGCACAGAATGCTGATAACAATGGAGAAAGCAACGGTGTCAGCAGTACAGCCATACTCCTCCATGCGATTAAATGCATGAACTGCCTCC
GCCGCCAATCCAGCTCTCACATACCGCCGCACAAGAATCGAGAAAGTTTCGACAGTAATTTCTACATTTCTAGCTTTCATCAAATCAATCAAATACCAAGCTAATCCGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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