| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0025979.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 2.2e-111 | 94.44 | Show/hide |
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IAT LTQLTRK APFV
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|
|
| KAA0042119.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.9e-111 | 93.98 | Show/hide |
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IATPLTQLTRKGAPFV
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|
|
| KAA0046185.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.9e-111 | 93.52 | Show/hide |
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IATPLTQLTRKGAPFV
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|
|
| KAA0052348.1 putative gag-pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 9.8e-112 | 93.52 | Show/hide |
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IATPLTQLTRK APFV
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|
|
| TYK01903.1 putative gag-pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 9.8e-112 | 93.52 | Show/hide |
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IATPLTQLTRK APFV
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|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SL46 Reverse transcriptase | 1.1e-111 | 94.44 | Show/hide |
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IAT LTQLTRK APFV
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|
| A0A5A7TLA3 Pol protein | 1.4e-111 | 93.98 | Show/hide |
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|
|
| A0A5A7TXM6 Reverse transcriptase | 2.4e-111 | 93.52 | Show/hide |
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MRLCIDY+ELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDGDVPK AFRSRY HYEFIVMSFGL NAP VFMDLMN+VFREFLDTFV
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IVFIDDILIYSKTE EHEEHLRMVLQTLRDNK YAKFSKCEFWLKQVSFLGH+ SKAGV VDPAKIEAVT W RP+TVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSR
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|
|
| A0A5A7UAV9 Reverse transcriptase | 4.8e-112 | 93.52 | Show/hide |
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MRLCIDY+ELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDGDVPK+AFRSRY HYEFIVMSFGL NAPTVFMDLMN+VFREFLDTFV
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IVFIDDILIYSKTE EHEEHLRMVLQTLRDNK YAKFSKCEFWLKQVSFLGHV SKAGVYVDPAKIEA+TSWPRP TVS+V SFLGLAGYYR+FVENFSR
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IATPLTQLTRK APFV
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|
|
| A0A5D3BQD5 Reverse transcriptase | 4.8e-112 | 93.52 | Show/hide |
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MRLCIDY+ELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDGDVPK+AFRSRY HYEFIVMSFGL NAPTVFMDLMN+VFREFLDTFV
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 2.0e-46 | 40 | Show/hide |
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R+ IDY++LN++TV +R+P+P +D++ +L F+ IDL G+HQ+ + V K AF +++ HYE++ M FGL NAP F MN + R L+ +
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V++DDI+++S + EH + L +V + L + KCEF ++ +FLGHV + G+ +P KIEA+ +P PT E+++FLGL GYYR+F+ NF+ I
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Query: ATPLTQLTRK
A P+T+ +K
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|
|
| P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein | 1.7e-42 | 39.34 | Show/hide |
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+R+ +DYK LNK N YPLP I+ L ++QG+T+F+K+DL+S YH +R++ GD K+AFR +E++VM +G+ AP F +N + E ++ V
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Query: IVFIDDILIYSKTEVEHEEHLRMVLQTLRDNKFYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVASKAGVYVDPAKIEAVTSWPRPTTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSR
+ ++DDILI+SK+E EH +H++ VLQ L++ +KCEF QV F+G+ S+ G I+ V W +P E+R FLG Y R+F+ S+
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Query: IATPLTQLTRK
+ PL L +K
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|
|
| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 1.7e-42 | 39.34 | Show/hide |
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+R+ +DYK LNK N YPLP I+ L ++QG+T+F+K+DL+S YH +R++ GD K+AFR +E++VM +G+ AP F +N + E ++ V
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+ ++DDILI+SK+E EH +H++ VLQ L++ +KCEF QV F+G+ S+ G I+ V W +P E+R FLG Y R+F+ S+
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Query: IATPLTQLTRK
+ PL L +K
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|
|
| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 1.0e-47 | 39.52 | Show/hide |
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R+ IDY++LN++T+ +RYP+P +D++ +L F+ IDL G+HQ+ + + + K AF ++ HYE++ M FGL NAP F MN + R L+ +
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V++DDI+I+S + EH +++V L D + KCEF K+ +FLGH+ + G+ +P K++A+ S+P PT E+R+FLGL GYYR+F+ N++ I
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Query: ATPLTQLTRK
A P+T +K
Subjt: ATPLTQLTRK
|
|
| Q8I7P9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus | 8.3e-45 | 38.76 | Show/hide |
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R+ +D+K LN VT+ + YP+P I+ L A F+ +DL SG+HQ+ +K+ D+PK AF + YEF+ + FGL NAP +F +++ + RE +
Subjt: RLCIDYKELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDGDVPKMAFRSRYRHYEFIVMSFGLMNAPTVFMDLMNKVFREFLDTFVI
Query: VFIDDILIYSKTEVEHEEHLRMVLQTLRDNKFYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVASKAGVYVDPAKIEAVTSWPRPTTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRI
V+IDDI+++S+ H ++LR+VL +L K F QV FLG++ + G+ DP K+ A++ P PT+V E++ FLG+ YYR+F+++++++
Subjt: VFIDDILIYSKTEVEHEEHLRMVLQTLRDNKFYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVASKAGVYVDPAKIEAVTSWPRPTTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRI
Query: ATPLTQLTR
A PLT LTR
Subjt: ATPLTQLTR
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