| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0025945.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.6e-69 | 90.6 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
MEHKSEALEKFKEYK EVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEH IQ QLSA TPQQN VSERRNRTLLDMV SMMSY Q PSS WGYAVE A+
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCP HVLVT PKKLEPR
Subjt: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
|
|
| KAA0048708.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 9.3e-70 | 90.6 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRS+RGGEYMDLRFQDYMIEHEIQ QLSA TPQQN VSE+RNRTLLDMV SMMSYTQ PSS WGYAVE A+
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSL HFRIWGCP HVLVT PKKLEPR
Subjt: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
|
|
| KAA0059226.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.6e-69 | 90.6 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
MEHKSEALEKFKEYK EVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEH IQ QLSA TPQQN VSERRNRTLLDMV SMMSY Q PSS WGYAVE A+
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCP HVLVT PKKLEPR
Subjt: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
|
|
| TYK02840.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.6e-69 | 90.6 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
MEHKSEALEKFKEYK EVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEH IQ QLSA TPQQN VSERRNRTLLDMV SMMSY Q PSS WGYAVE A+
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCP HVLVT PKKLEPR
Subjt: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
|
|
| TYK04171.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.6e-69 | 86.71 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
MEHKSEALEKFKEYK EVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEH IQ QLSA TPQQN VSERRNRTLLDMV SMMSY Q PSS WGYAVE A+
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPRCIDKCFSLG
HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCP HVLVT PKKLEP C C +G
Subjt: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPRCIDKCFSLG
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TZD0 Gag/pol protein | 7.7e-70 | 90.6 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
MEHKSEALEKFKEYK EVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEH IQ QLSA TPQQN VSERRNRTLLDMV SMMSY Q PSS WGYAVE A+
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCP HVLVT PKKLEPR
Subjt: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
|
|
| A0A5A7U0I1 Gag/pol protein | 4.5e-70 | 90.6 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRS+RGGEYMDLRFQDYMIEHEIQ QLSA TPQQN VSE+RNRTLLDMV SMMSYTQ PSS WGYAVE A+
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSL HFRIWGCP HVLVT PKKLEPR
Subjt: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
|
|
| A0A5A7UYE8 Gag/pol protein | 7.7e-70 | 90.6 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
MEHKSEALEKFKEYK EVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEH IQ QLSA TPQQN VSERRNRTLLDMV SMMSY Q PSS WGYAVE A+
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCP HVLVT PKKLEPR
Subjt: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
|
|
| A0A5D3BUN8 Gag/pol protein | 7.7e-70 | 90.6 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
MEHKSEALEKFKEYK EVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEH IQ QLSA TPQQN VSERRNRTLLDMV SMMSY Q PSS WGYAVE A+
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCP HVLVT PKKLEPR
Subjt: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPR
|
|
| A0A5D3BWT8 Gag/pol protein | 7.7e-70 | 86.71 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
MEHKSEALEKFKEYK EVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEH IQ QLSA TPQQN VSERRNRTLLDMV SMMSY Q PSS WGYAVE A+
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPRCIDKCFSLG
HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCP HVLVT PKKLEP C C +G
Subjt: HILNNVPSKSVSETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPRCIDKCFSLG
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04146 Copia protein | 3.5e-19 | 31.65 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
+++KS+ F+++ A+ E + K+ L D G EY+ + + ++ I + L+ TPQ N VSER RT+ + +M+S + S WG AV A
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSV---SETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPRCIDKCF
+++N +PS+++ S+TP+E+W +KP L H R++G +V + K + + DK F
Subjt: HILNNVPSKSV---SETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPRCIDKCF
|
|
| P10978 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 8.9e-23 | 34.57 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
++ K + + F+++ A VE +K+K LRSD GGEY F++Y H I+ + + TPQ N V+ER NRT+++ V SM+ + P S WG AV+ A
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSVS-ETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPRCIDK---CFSLG
+++N PS ++ E P +W ++ S SH +++GC PK+ + DK C +G
Subjt: HILNNVPSKSVS-ETPFELWRGRKPSLSHFRIWGCPTHVLVTTPKKLEPRCIDK---CFSLG
|
|
| P47024 Transposon Ty4-J Gag-Pol polyprotein | 2.2e-05 | 27 | Show/hide |
Query: VENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAIHILNNVPSKSVSETPFE
VE +K++ + SDRG E+ + + ++Y I I L+++ N +ER RT++ ++++ + W YAV +A +I N + KS + P +
Subjt: VENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAIHILNNVPSKSVSETPFE
|
|
| Q94HW2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 | 5.8e-14 | 30.37 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
++ KS+ E F +K +EN +I SD GGE++ L +Y +H I S TP+ N +SER++R +++ +++S+ P + W YA A+
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSVS-ETPFELWRGRKPSLSHFRIWGC
+++N +P+ + E+PF+ G P+ R++GC
Subjt: HILNNVPSKSVS-ETPFELWRGRKPSLSHFRIWGC
|
|
| Q9ZT94 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 | 4.7e-16 | 31.85 | Show/hide |
Query: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
++ KS+ + F +K+ VEN +I L SD GGE++ LR DY+ +H I S TP+ N +SER++R +++M +++S+ P + W YA A+
Subjt: MEHKSEALEKFKEYKAEVENLLSKKIKILRSDRGGEYMDLRFQDYMIEHEIQFQLSASDTPQQNDVSERRNRTLLDMVSSMMSYTQFPSSSWGYAVEAAI
Query: HILNNVPSKSVS-ETPFELWRGRKPSLSHFRIWGC
+++N +P+ + ++PF+ G+ P+ +++GC
Subjt: HILNNVPSKSVS-ETPFELWRGRKPSLSHFRIWGC
|
|
