| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AAO45752.1 pol protein [Cucumis melo subsp. melo] | 8.7e-133 | 99.17 | Show/hide |
Query: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Subjt: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Query: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
TAFRSRYGHY+FIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWL+QVSFLGHVVSKAG
Subjt: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
Query: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
Subjt: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
|
|
| KAA0048687.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.9e-133 | 99.58 | Show/hide |
Query: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Subjt: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Query: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWL+QVSFLGHVVSKAG
Subjt: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
Query: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
Subjt: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
|
|
| KAA0062245.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 5.1e-133 | 99.17 | Show/hide |
Query: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Subjt: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Query: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWL+QVSFLGHVVSKAG
Subjt: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
Query: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
VSVDPAKIEAVTGWTRPST+SEVRSFLGLAGYYRRFVENF
Subjt: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
|
|
| KAA0066266.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.9e-133 | 99.58 | Show/hide |
Query: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Subjt: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Query: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWL+QVSFLGHVVSKAG
Subjt: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
Query: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
Subjt: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
|
|
| TYK01613.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.9e-133 | 99.58 | Show/hide |
Query: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Subjt: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Query: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWL+QVSFLGHVVSKAG
Subjt: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
Query: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
Subjt: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7U330 Reverse transcriptase | 1.9e-133 | 99.58 | Show/hide |
Query: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Subjt: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Query: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWL+QVSFLGHVVSKAG
Subjt: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
Query: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
Subjt: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
|
|
| A0A5A7V8L8 Pol protein | 2.5e-133 | 99.17 | Show/hide |
Query: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Subjt: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Query: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWL+QVSFLGHVVSKAG
Subjt: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
Query: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
VSVDPAKIEAVTGWTRPST+SEVRSFLGLAGYYRRFVENF
Subjt: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
|
|
| A0A5A7VIT9 Reverse transcriptase | 1.9e-133 | 99.58 | Show/hide |
Query: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Subjt: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Query: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWL+QVSFLGHVVSKAG
Subjt: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
Query: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
Subjt: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
|
|
| A0A5D3BPI1 Reverse transcriptase | 1.9e-133 | 99.58 | Show/hide |
Query: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Subjt: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Query: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWL+QVSFLGHVVSKAG
Subjt: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
Query: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
Subjt: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
|
|
| Q84KB0 Pol protein | 4.2e-133 | 99.17 | Show/hide |
Query: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Subjt: MAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPK
Query: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
TAFRSRYGHY+FIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWL+QVSFLGHVVSKAG
Subjt: TAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAG
Query: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
Subjt: VSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 2.9e-54 | 41.84 | Show/hide |
Query: KELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFV-KKKDGS----MRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPKT
+E++ Q+Q++L++G IR S SP+ +P+ V KK+D S R+ IDYR+LN++TV +R+P+P +D++ +L F+ IDL G+HQ+ + E V KT
Subjt: KELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFV-KKKDGS----MRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPKT
Query: AFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAGV
AF +++GHYE++ M FGL NAPA F MN + R L+ +V++DDI+++S + EH + L +V + L L + KCEF Q+ +FLGHV++ G+
Subjt: AFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAGV
Query: SVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
+P KIEA+ + P+ E+++FLGL GYYR+F+ NF
Subjt: SVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
|
|
| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 4.9e-54 | 40.34 | Show/hide |
Query: ELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKD-----GSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPKTA
E++ Q+QE+L++G IR S SP+ +P V KK R+ IDYR+LN++T+ +RYP+P +D++ +L F+ IDL G+HQ+ + +E + KTA
Subjt: ELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKD-----GSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPKTA
Query: FRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAGVS
F ++ GHYE++ M FGL NAPA F MN + R L+ +V++DDI+I+S + EH +++V L D L + KCEF ++ +FLGH+V+ G+
Subjt: FRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAGVS
Query: VDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
+P K++A+ + P+ E+R+FLGL GYYR+F+ N+
Subjt: VDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
|
|
| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 2.1e-52 | 43.78 | Show/hide |
Query: KELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPKTAFRSR
+E+ +Q+LLD FI PS SP +PV+ V KKDG+ RLC+DYR LNK T+ + +PLPRID+L ++ A +F+ +DL SGYHQ+ ++ +D KTAF +
Subjt: KELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPKTAFRSR
Query: YGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAGVSVDPA
G YE+ VM FGL NAP+ F M FR+ FV V++DDILI+S++ EH +HL VL+ L++ L K KC+F ++ FLG+ + ++
Subjt: YGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAGVSVDPA
Query: KIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVEN
K A+ + P TV + + FLG+ YYRRF+ N
Subjt: KIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVEN
|
|
| Q8I7P9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus | 1.2e-49 | 38.66 | Show/hide |
Query: ELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKK-----DGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPKTA
E++ Q+ ELL G IRPS SP+ +P+ V KK + R+ +D++ LN VT+ + YP+P I+ L A F+ +DL SG+HQ+ +K+ D+PKTA
Subjt: ELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKK-----DGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPKTA
Query: FRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAGVS
F + G YEF+ + FGL NAPA+F +++ + RE + V+IDDI+++S+ H ++LR+VL +L L K F QV FLG++V+ G+
Subjt: FRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAGVS
Query: VDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
DP K+ A++ P++V E++ FLG+ YYR+F++++
Subjt: VDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENF
|
|
| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 2.1e-52 | 43.78 | Show/hide |
Query: KELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPKTAFRSR
+E+ +Q+LLD FI PS SP +PV+ V KKDG+ RLC+DYR LNK T+ + +PLPRID+L ++ A +F+ +DL SGYHQ+ ++ +D KTAF +
Subjt: KELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDEDVPKTAFRSR
Query: YGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAGVSVDPA
G YE+ VM FGL NAP+ F M FR+ FV V++DDILI+S++ EH +HL VL+ L++ L K KC+F ++ FLG+ + ++
Subjt: YGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLQQVSFLGHVVSKAGVSVDPA
Query: KIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVEN
K A+ + P TV + + FLG+ YYRRF+ N
Subjt: KIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVEN
|
|
