| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0040517.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.8e-142 | 91.7 | Show/hide |
Query: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
LLDS CCNHMTSNYSLMNT SPAKSLPPIYAADGNC+NI PSMNLPHTYCVPNLTFNLV VGQLCDLGL VSFSPNG QVQD QT Q IGTGR
Subjt: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
Query: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQW+LRLGHASPEKLRHLIS+NHLNSTTKFVPFNCLNCKL KQPALSFSTSTSISDKPFDLIH DIWGPAPT
Subjt: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
Query: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
STVHGYRYYV FIDDFSRFTWIYFLKHRS LSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
Subjt: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
|
|
| KAA0047306.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 5.5e-144 | 92.42 | Show/hide |
Query: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
LLDSACCNHMTSNYSLMNT SPAKSLPPIYAADGNC+NI PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNG QVQDPQT Q IGTGR
Subjt: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
Query: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
KVGRLFELLSLQVPSPSSIS PVTDSDTYQW+LRLGHASPEKLRHLI +NHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSF TSTSISDKPFDLIH DIWGPAPT
Subjt: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
Query: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
STVHGYRYYV FIDDFSRFTWIYFLKHRS LSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
Subjt: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
|
|
| KAA0050251.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 2.7e-143 | 91.7 | Show/hide |
Query: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
LLDSACCNHMTSNYSLMNT SPAKSLPPIYAADGNC+NI PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGL V+FSPNG QVQ+PQT Q IGTG
Subjt: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
Query: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
KVGRLFELLSLQVPSPSSISAP+T+SDTYQW+LRLGHASPEKLRHLIS+NHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIH +IWGPAPT
Subjt: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
Query: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
Subjt: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
|
|
| TYJ98155.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 7.1e-144 | 92.06 | Show/hide |
Query: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
LLDSACCNHMTSNYSLMNT SPAKSLPPIYAADGNC+NI PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGL V+FSPNG QVQ+PQT Q IGTG
Subjt: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
Query: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
KVGRLFELLSLQVPSPSSISAP+T+SDTYQW+LRLGHASPEKLRHLIS+NHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIH DIWGPAPT
Subjt: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
Query: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
Subjt: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
|
|
| TYK23446.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 6.0e-143 | 92.06 | Show/hide |
Query: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
LLDSACCNHMTSNYSLMNT SPAKSLPPIYAADGNC+NI PSMNLPHTYCVPNLTFNLV VGQLCDLGL VSFSPNG QVQD QT Q IGTGR
Subjt: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
Query: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQW+LRLGHASPEKLRHLIS+NHLNSTTKFVPFNCLNCKL KQPALSFSTSTSISDKPFDLIH DIWGPAPT
Subjt: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
Query: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
STVHGYRYYV FIDDFSRFTWIYFLKHRS LSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
Subjt: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TG30 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 8.5e-143 | 91.7 | Show/hide |
Query: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
LLDS CCNHMTSNYSLMNT SPAKSLPPIYAADGNC+NI PSMNLPHTYCVPNLTFNLV VGQLCDLGL VSFSPNG QVQD QT Q IGTGR
Subjt: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
Query: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQW+LRLGHASPEKLRHLIS+NHLNSTTKFVPFNCLNCKL KQPALSFSTSTSISDKPFDLIH DIWGPAPT
Subjt: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
Query: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
STVHGYRYYV FIDDFSRFTWIYFLKHRS LSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
Subjt: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
|
|
| A0A5A7TZC4 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 2.6e-144 | 92.42 | Show/hide |
Query: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
LLDSACCNHMTSNYSLMNT SPAKSLPPIYAADGNC+NI PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNG QVQDPQT Q IGTGR
Subjt: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
Query: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
KVGRLFELLSLQVPSPSSIS PVTDSDTYQW+LRLGHASPEKLRHLI +NHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSF TSTSISDKPFDLIH DIWGPAPT
Subjt: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
Query: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
STVHGYRYYV FIDDFSRFTWIYFLKHRS LSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
Subjt: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
|
|
| A0A5A7U9P9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 1.3e-143 | 91.7 | Show/hide |
Query: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
LLDSACCNHMTSNYSLMNT SPAKSLPPIYAADGNC+NI PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGL V+FSPNG QVQ+PQT Q IGTG
Subjt: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
Query: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
KVGRLFELLSLQVPSPSSISAP+T+SDTYQW+LRLGHASPEKLRHLIS+NHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIH +IWGPAPT
Subjt: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
Query: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
Subjt: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
|
|
| A0A5D3BI36 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 3.5e-144 | 92.06 | Show/hide |
Query: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
LLDSACCNHMTSNYSLMNT SPAKSLPPIYAADGNC+NI PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGL V+FSPNG QVQ+PQT Q IGTG
Subjt: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
Query: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
KVGRLFELLSLQVPSPSSISAP+T+SDTYQW+LRLGHASPEKLRHLIS+NHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIH DIWGPAPT
Subjt: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
Query: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
Subjt: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
|
|
| A0A5D3DIH5 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 2.9e-143 | 92.06 | Show/hide |
Query: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
LLDSACCNHMTSNYSLMNT SPAKSLPPIYAADGNC+NI PSMNLPHTYCVPNLTFNLV VGQLCDLGL VSFSPNG QVQD QT Q IGTGR
Subjt: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINI--------PSMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQMIGTGR
Query: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQW+LRLGHASPEKLRHLIS+NHLNSTTKFVPFNCLNCKL KQPALSFSTSTSISDKPFDLIH DIWGPAPT
Subjt: KVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPT
Query: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
STVHGYRYYV FIDDFSRFTWIYFLKHRS LSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
Subjt: STVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQGTLV
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04146 Copia protein | 6.1e-13 | 22.84 | Show/hide |
Query: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPI---YAADGNCI-----NIPSMNLPHTYCVPNLTF------NLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQ
+LDS +H+ ++ SL S + +PP+ A G I I + H + ++ F NL+SV +L + G+++ F +G +
Subjt: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPI---YAADGNCI-----NIPSMNLPHTYCVPNLTF------NLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDPQTRQ
Query: MIGTGRKVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQ-WYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKF--------VPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDK
+ +G L ++ V + + S + ++ W+ R GH S KL + N + + + CLN K A+ P T I +
Subjt: MIGTGRKVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQ-WYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKF--------VPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDK
Query: PFDLIHFDIWGPAPTSTVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQG
P ++H D+ GP T+ Y+V+F+D F+ + Y +K++S++ + +F F+ + L DN EY + + F ++G
Subjt: PFDLIHFDIWGPAPTSTVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQG
|
|
| P10978 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 8.5e-15 | 29.86 | Show/hide |
Query: WYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPTSTVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSE
W+ R+GH S + L+ L + ++ C C KQ +SF TS+ DL++ D+ GP ++ G +Y+V FIDD SR W+Y LK + +
Subjt: WYLRLGHASPEKLRHLISVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHFDIWGPAPTSTVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSE
Query: LSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQG
+ + + +F ++ + +K LR+DN EY + S G
Subjt: LSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQG
|
|
| Q12193 Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein | 1.4e-12 | 23.45 | Show/hide |
Query: MLLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINIP-----------------SMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDP
+LLDS + + ++++S S P I D NIP S+ + HT PN+ ++L+S+ +L + +T F+ N + D
Subjt: MLLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINIP-----------------SMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLGLTVSFSPNGYQVQDP
Query: QTRQMIGTGRKVGRLFELLSLQVPSPSSISAPV-----TDSDTYQW-----YLRLGHASPEKLRHLI---SVNHLNST----TKFVPFNCLNCKLAKQPA
I K G F +S + PS+IS P T T ++ + L HA+ + +R+ + ++ + N + + + + C +C + K
Subjt: QTRQMIGTGRKVGRLFELLSLQVPSPSSISAPV-----TDSDTYQW-----YLRLGHASPEKLRHLI---SVNHLNST----TKFVPFNCLNCKLAKQPA
Query: LSFSTSTSI----SDKPFDLIHFDIWGPAPTSTVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSE--LSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLL
+ + S +PF +H DI+GP Y++ F D+ ++F W+Y L R E + + I+ QF + ++ D EY + TL
Subjt: LSFSTSTSI----SDKPFDLIHFDIWGPAPTSTVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSE--LSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLL
Query: SFLSQQG
FL + G
Subjt: SFLSQQG
|
|
| Q94HW2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 | 7.4e-35 | 32.62 | Show/hide |
Query: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINIP------------SMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDL-GLTVSFSPNGYQVQDPQTRQM
LLDS +H+TS+++ ++ P + ADG+ I I +NL + VPN+ NL+SV +LC+ G++V F P +QV+D T
Subjt: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINIP------------SMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDL-GLTVSFSPNGYQVQDPQTRQM
Query: IGTGRKVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLI---SVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHF
+ G+ L+E S ++P + + W+ RLGH +P L +I S++ LN + KF+ +C +C + K + FS ST S +P + I+
Subjt: IGTGRKVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLI---SVNHLNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIHF
Query: DIWGPAPTSTVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQG
D+W +P + YRYYV+F+D F+R+TW+Y LK +S++ T+I F N++ +F I T +DN E+ L + SQ G
Subjt: DIWGPAPTSTVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQG
|
|
| Q9ZT94 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 | 3.7e-34 | 33.22 | Show/hide |
Query: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINIP------------SMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLG-LTVSFSPNGYQVQDPQTRQM
LLDS +H+TS+++ ++ P + ADG+ I I S++L VPN+ NL+SV +LC+ ++V F P +QV+D T
Subjt: LLDSACCNHMTSNYSLMNTSSPAKSLPPIYAADGNCINIP------------SMNLPHTYCVPNLTFNLVSVGQLCDLG-LTVSFSPNGYQVQDPQTRQM
Query: IGTGRKVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNH----LNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIH
+ G+ L+E + S ++P + + W+ RLGH S L +IS NH LN + K + +C +C + K + FS ST S KP + I+
Subjt: IGTGRKVGRLFELLSLQVPSPSSISAPVTDSDTYQWYLRLGHASPEKLRHLISVNH----LNSTTKFVPFNCLNCKLAKQPALSFSTSTSISDKPFDLIH
Query: FDIWGPAPTSTVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQG
D+W +P ++ YRYYV+F+D F+R+TW+Y LK +S++ T+I F +++ +F I TL +DN E+ L +LSQ G
Subjt: FDIWGPAPTSTVHGYRYYVLFIDDFSRFTWIYFLKHRSELSRTYIEFANMIRTQFSCPIKTLRTDNALEYKDSTLLSFLSQQG
|
|