| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
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| ADJ18449.1 gag/pol protein, partial [Bryonia dioica] | 8.1e-108 | 75.84 | Show/hide |
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E+KAEVENE KTIKT RSDRGGEYMD +FQDYLIE GIQSQ SAPSTPQQNGVSERRN++LLDM GYALET I+ILNNVPSKSV
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Query: ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQNPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEEISKNTTDRPS
ETPYELWK RK +LR+FRIWGCPAHVLVQNPKKLE RSKLCLFV YPKES+G LFY PQ+NKVFV TNATFLEE H RNHQ SK+VL+E+ KN TD+PS
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Query: SSTKVVDKTRIIGQTHPSQELGEPRRSGKIVRQPDRYFGLSETQIIIPDDGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
SSTKVVDK I Q+H SQEL PRRSG++V QP+RY GL ETQIIIPDDG+EDPLTYKQAMNDVD DQ
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| KAA0037569.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 5.2e-99 | 72.49 | Show/hide |
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E+KAEVENES KTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLI+HGIQSQ SAPSTPQQNGVSERRNQ+LLDM GYALETTIYILNNVP KSVS
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Query: ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQNPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEEISKNTTDRPS
ET YELWK RK +LRHFRIWGCPAHVLVQNPK LERR KLCLFV YPKESKG LFYDPQ+N RPS
Subjt: ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQNPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEEISKNTTDRPS
Query: SSTKVVDKTRIIGQTHPSQELGEPRRSGKIVRQPDRYFGLSETQIIIPDDGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
SSTKVVDKT IGQTHPSQELGEPRRSG++VRQPDRY GLSE QIIIPDDGIEDPLT+KQAMNDVDCD+
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| KAA0062742.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.7e-97 | 72.49 | Show/hide |
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E+KA+VENES EHGIQSQ SAPSTPQQNGVSERRN++LLDM GYALETTIYILNNVPSKS S
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Query: ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQNPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEEISKNTTDRPS
E P+ELWK RKG+L HFRIWGC AHVLVQNPKKLE SKLCLFV YPKESKG LFYDPQ+NKVFV TNATFLEE HIRNHQT SKLVLEEIS +TDRPS
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Query: SSTKVVDKTRIIGQTHPSQELGEPRRSGKIVRQPDRYFGLSETQIIIPDDGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
TKVVDKTR IGQTH SQEL EPRRSG++VRQPDRY LSE QIIIP+DGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
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| TYK03644.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.2e-105 | 82.38 | Show/hide |
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MDLRFQDYLIEHGIQSQ SAPS PQQNGV +RRN+ LLDM YALETTIYILNNVPSKSVSETPYELWK RKG+LRHFRIWGCPAH
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V VQNPKKLERRSKLCLFV YPKESKG LFYDPQ+NKVFV TNATFLEE HIRNHQT SKLVLEEISKNTTDRPSS TKVVDKTR IGQTH QELG+PR
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Query: RSGKIVRQPDRYFGLSETQIIIPDDGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
RSG++VRQ DRY GLSE QIIIPDDGIEDPLTYK AMNDVD DQ
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| TYK30724.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 6.0e-119 | 82.16 | Show/hide |
Query: EHKAEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLDM---------------GYALETTIYILNNVPSKSVS
E+KAEVENES KTIKT RSDRG EYMDLRFQDYLIEH IQSQ SAP+TPQQNGVSERRN++LLDM GYALETTIYILNNVPSKSVS
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Query: ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQNPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEEISKNTTDRPS
ETPYELWK RKG+LRHFRIWGCP+HVLVQNP KLE RSKLCLFV YPKESKG LFYDPQ+NKVFV NATFLEEYHIRNHQT +KLVLEEISKN TDRPS
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Query: SSTKVVDKTRIIGQTHPSQELGEPRRSGKIVRQPDRYFGLSETQIIIPDDGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
S TKVVDKTR IGQTHPSQELGE RRS ++VRQP+RY GLSE +IIIP+DGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7T8E8 Gag/pol protein | 2.5e-99 | 72.49 | Show/hide |
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E+KAEVENES KTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLI+HGIQSQ SAPSTPQQNGVSERRNQ+LLDM GYALETTIYILNNVP KSVS
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Query: ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQNPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEEISKNTTDRPS
ET YELWK RK +LRHFRIWGCPAHVLVQNPK LERR KLCLFV YPKESKG LFYDPQ+N RPS
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Query: SSTKVVDKTRIIGQTHPSQELGEPRRSGKIVRQPDRYFGLSETQIIIPDDGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
SSTKVVDKT IGQTHPSQELGEPRRSG++VRQPDRY GLSE QIIIPDDGIEDPLT+KQAMNDVDCD+
Subjt: SSTKVVDKTRIIGQTHPSQELGEPRRSGKIVRQPDRYFGLSETQIIIPDDGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
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| A0A5D3BX45 Gag/pol protein | 1.1e-105 | 82.38 | Show/hide |
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MDLRFQDYLIEHGIQSQ SAPS PQQNGV +RRN+ LLDM YALETTIYILNNVPSKSVSETPYELWK RKG+LRHFRIWGCPAH
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V VQNPKKLERRSKLCLFV YPKESKG LFYDPQ+NKVFV TNATFLEE HIRNHQT SKLVLEEISKNTTDRPSS TKVVDKTR IGQTH QELG+PR
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Query: RSGKIVRQPDRYFGLSETQIIIPDDGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
RSG++VRQ DRY GLSE QIIIPDDGIEDPLTYK AMNDVD DQ
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| A0A5D3DFR5 Gag/pol protein | 8.2e-98 | 72.49 | Show/hide |
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E+KA+VENES EHGIQSQ SAPSTPQQNGVSERRN++LLDM GYALETTIYILNNVPSKS S
Subjt: EHKAEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLDM---------------GYALETTIYILNNVPSKSVS
Query: ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQNPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEEISKNTTDRPS
E P+ELWK RKG+L HFRIWGC AHVLVQNPKKLE SKLCLFV YPKESKG LFYDPQ+NKVFV TNATFLEE HIRNHQT SKLVLEEIS +TDRPS
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Query: SSTKVVDKTRIIGQTHPSQELGEPRRSGKIVRQPDRYFGLSETQIIIPDDGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
TKVVDKTR IGQTH SQEL EPRRSG++VRQPDRY LSE QIIIP+DGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
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| A0A5D3E496 Gag/pol protein | 2.9e-119 | 82.16 | Show/hide |
Query: EHKAEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLDM---------------GYALETTIYILNNVPSKSVS
E+KAEVENES KTIKT RSDRG EYMDLRFQDYLIEH IQSQ SAP+TPQQNGVSERRN++LLDM GYALETTIYILNNVPSKSVS
Subjt: EHKAEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLDM---------------GYALETTIYILNNVPSKSVS
Query: ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQNPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEEISKNTTDRPS
ETPYELWK RKG+LRHFRIWGCP+HVLVQNP KLE RSKLCLFV YPKESKG LFYDPQ+NKVFV NATFLEEYHIRNHQT +KLVLEEISKN TDRPS
Subjt: ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQNPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEEISKNTTDRPS
Query: SSTKVVDKTRIIGQTHPSQELGEPRRSGKIVRQPDRYFGLSETQIIIPDDGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
S TKVVDKTR IGQTHPSQELGE RRS ++VRQP+RY GLSE +IIIP+DGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
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| E2GK51 Gag/pol protein (Fragment) | 3.9e-108 | 75.84 | Show/hide |
Query: EHKAEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLDM---------------GYALETTIYILNNVPSKSVS
E+KAEVENE KTIKT RSDRGGEYMD +FQDYLIE GIQSQ SAPSTPQQNGVSERRN++LLDM GYALET I+ILNNVPSKSV
Subjt: EHKAEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLDM---------------GYALETTIYILNNVPSKSVS
Query: ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQNPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEEISKNTTDRPS
ETPYELWK RK +LR+FRIWGCPAHVLVQNPKKLE RSKLCLFV YPKES+G LFY PQ+NKVFV TNATFLEE H RNHQ SK+VL+E+ KN TD+PS
Subjt: ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQNPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEEISKNTTDRPS
Query: SSTKVVDKTRIIGQTHPSQELGEPRRSGKIVRQPDRYFGLSETQIIIPDDGIEDPLTYKQAMNDVDCDQ
SSTKVVDK I Q+H SQEL PRRSG++V QP+RY GL ETQIIIPDDG+EDPLTYKQAMNDVD DQ
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04146 Copia protein | 9.8e-16 | 25.1 | Show/hide |
Query: FQDYLIEHKAEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLD---------------MGYALETTIYILNNV
FQD++ + +A + K + + D G EY+ + + ++ GI + P TPQ NGVSER +++ + G A+ T Y++N +
Subjt: FQDYLIEHKAEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLD---------------MGYALETTIYILNNV
Query: PSKSV---SETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQNPK-KLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEE
PS+++ S+TPYE+W +K L+H R++G +V ++N + K + +S +FV Y E G +D K V + E + + + V +
Subjt: PSKSV---SETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQNPK-KLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEE
Query: ISKNTTDR--PSSSTKVV-----------DKTRIIGQTHPSQELGEPRRSGKIVR
SK + ++ P+ S K++ D + + + S+ P S KI++
Subjt: ISKNTTDR--PSSSTKVV-----------DKTRIIGQTHPSQELGEPRRSGKIVR
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| P10978 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 9.8e-24 | 29.92 | Show/hide |
Query: AEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLD---------------MGYALETTIYILNNVPSKSVS-ET
A VE E+ + +K RSD GGEY F++Y HGI+ + + P TPQ NGV+ER N+++++ G A++T Y++N PS ++ E
Subjt: AEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLD---------------MGYALETTIYILNNVPSKSVS-ET
Query: PYELWKRRKGNLRHFRIWGCP--AHVLVQNPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEEISKNTTDRPS
P +W ++ + H +++GC AHV + KL+ +S C+F+ Y E G +DP K KV + F E +R S+ V I N PS
Subjt: PYELWKRRKGNLRHFRIWGCP--AHVLVQNPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLEEYHIRNHQTHSKLVLEEISKNTTDRPS
Query: SSTKVVDKTRIIGQTHPSQELGEPRRSGKIVRQPDRYFGLSETQIIIPDDGIED
+S + T T E GE + G+++ Q ++ D+G+E+
Subjt: SSTKVVDKTRIIGQTHPSQELGEPRRSGKIVRQPDRYFGLSETQIIIPDDGIED
|
|
| Q94HW2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 | 5.4e-14 | 27.07 | Show/hide |
Query: QDYLIEHKAEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLDMG---------------YALETTIYILNNVP
++ I K +EN I TF SD GGE++ L +Y +HGI S P TP+ NG+SER+++ +++ G YA +Y++N +P
Subjt: QDYLIEHKAEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLDMG---------------YALETTIYILNNVP
Query: SKSVS-ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQ--NPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLE
+ + E+P++ N R++GC + ++ N KL+ +S+ C+F+ Y L Q +++++ + F E
Subjt: SKSVS-ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQ--NPKKLERRSKLCLFVYYPKESKGCLFYDPQKNKVFVLTNATFLE
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| Q9ZT94 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 | 2.9e-15 | 32.47 | Show/hide |
Query: QDYLIEHKAEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLDMG---------------YALETTIYILNNVP
+D I K+ VEN I T SD GGE++ LR DYL +HGI S P TP+ NG+SER+++ +++MG YA +Y++N +P
Subjt: QDYLIEHKAEVENESAKTIKTFRSDRGGEYMDLRFQDYLIEHGIQSQHSAPSTPQQNGVSERRNQSLLDMG---------------YALETTIYILNNVP
Query: SKSVS-ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQ--NPKKLERRSKLCLFVYY
+ + ++P++ + N +++GC + ++ N KLE +SK C F+ Y
Subjt: SKSVS-ETPYELWKRRKGNLRHFRIWGCPAHVLVQ--NPKKLERRSKLCLFVYY
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