; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc04g0101451 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc04g0101451
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionAnkyrin repeat-containing protein
Genome locationCMiso1.1chr04:17786974..17788470
RNA-Seq ExpressionCmc04g0101451
SyntenyCmc04g0101451
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR026961 - PGG domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058460.1 ankyrin repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]2.9e-62100Show/hide
Query:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF
        MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF
Subjt:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF

Query:  PLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQG
        PLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQG
Subjt:  PLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQG

XP_004141216.1 uncharacterized protein LOC101203970 [Cucumis sativus]7.7e-7175.49Show/hide
Query:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDP--RSFNSSSYFDYGPYYIPSIQL----TAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVIL
        MLVATVIATVTFQAG+NPPGGVWQ DTPFNSS YFNNDP  R FNSSSYF Y PY  P I L     AGTAIMMY +P +Y+ Y  +NTISFLASISVIL
Subjt:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDP--RSFNSSSYFDYGPYYIPSIQL----TAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVIL

Query:  LVVGRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCFK
        L+VGRFPLKNKICSWLLALAM VAV  LG GYF GV MVN YS  NDS S +F  LY L ISCLGLVRV GVWHILSFKLWIVKTLF TF +++KFYC K
Subjt:  LVVGRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCFK

Query:  RTTP
        RTTP
Subjt:  RTTP

XP_008447612.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490026 [Cucumis melo]4.7e-3649Show/hide
Query:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPY----YI---PSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVI
        MLVATVIATVTFQ GVNPPGGVWQ DTPF  S   N     F S  Y D+G Y    Y+    S+   AGT +M + +P   + Y  +NT+SFLAS+SVI
Subjt:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPY----YI---PSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVI

Query:  LLVVGRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCF
        L++V RFPLKN+ICSWLL L M +AV +L  GY LGV+MVN  ++       +  +  L VI   G+V +  +W I S  +W+VKTL  +FT++VK + F
Subjt:  LLVVGRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCF

XP_008464012.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501999 isoform X1 [Cucumis melo]1.6e-105100Show/hide
Query:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF
        MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF
Subjt:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF

Query:  PLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCFKRTTP
        PLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCFKRTTP
Subjt:  PLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCFKRTTP

XP_011649355.1 uncharacterized protein LOC101212496 [Cucumis sativus]3.7e-3347.03Show/hide
Query:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYI-----PSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILL
        MLVATVIATVTFQ GVNPPGGVWQ DTPF  S  FN+  ++  +  Y ++G Y +      ++   AGT +M   +P+ Y+ Y  +NT+SFLAS++VIL+
Subjt:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYI-----PSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILL

Query:  VVGRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTL
        +V RFPLKN+ICSWLLA AM +AV +L  GY LGV+MV+  ++ +      + +  L +I  LG+V +  +  I    +W+VKTL
Subjt:  VVGRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LCQ0 ANK_REP_REGION domain-containing protein9.0e-3348.28Show/hide
Query:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNS-----SSYFDYGPYYIPSIQLT----AGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASIS
        MLVATVIATVTFQ GVNPPGG+WQ DT FN S  FNN   S+N      S Y D      P+  LT    AGT +M Y +P  Y  Y  +NTISFLAS+S
Subjt:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNS-----SSYFDYGPYYIPSIQLT----AGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASIS

Query:  VILLVVGRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVN-----KYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTT
        VIL++VGRFPLKN+I SW+L+L M  AV +L  GY +GV+M+N      Y  FN+  +    +L   V   LG+V + G+W +  F    +K+LF  FT+
Subjt:  VILLVVGRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVN-----KYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTT

Query:  QVK
        ++K
Subjt:  QVK

A0A0A0LFQ3 ANK_REP_REGION domain-containing protein3.7e-7175.49Show/hide
Query:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDP--RSFNSSSYFDYGPYYIPSIQL----TAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVIL
        MLVATVIATVTFQAG+NPPGGVWQ DTPFNSS YFNNDP  R FNSSSYF Y PY  P I L     AGTAIMMY +P +Y+ Y  +NTISFLASISVIL
Subjt:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDP--RSFNSSSYFDYGPYYIPSIQL----TAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVIL

Query:  LVVGRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCFK
        L+VGRFPLKNKICSWLLALAM VAV  LG GYF GV MVN YS  NDS S +F  LY L ISCLGLVRV GVWHILSFKLWIVKTLF TF +++KFYC K
Subjt:  LVVGRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCFK

Query:  RTTP
        RTTP
Subjt:  RTTP

A0A1S3BIS1 uncharacterized protein LOC1034900262.3e-3649Show/hide
Query:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPY----YI---PSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVI
        MLVATVIATVTFQ GVNPPGGVWQ DTPF  S   N     F S  Y D+G Y    Y+    S+   AGT +M + +P   + Y  +NT+SFLAS+SVI
Subjt:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPY----YI---PSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVI

Query:  LLVVGRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCF
        L++V RFPLKN+ICSWLL L M +AV +L  GY LGV+MVN  ++       +  +  L VI   G+V +  +W I S  +W+VKTL  +FT++VK + F
Subjt:  LLVVGRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCF

A0A1S3CM14 uncharacterized protein LOC103501999 isoform X18.0e-106100Show/hide
Query:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF
        MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF
Subjt:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF

Query:  PLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCFKRTTP
        PLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCFKRTTP
Subjt:  PLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCFKRTTP

A0A5D3CAD4 Ankyrin repeat-containing protein1.4e-62100Show/hide
Query:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF
        MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF
Subjt:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF

Query:  PLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQG
        PLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQG
Subjt:  PLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G13950.1 unknown protein4.3e-1134.3Show/hide
Query:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHM---NTISFLASISVILLVV
        M+ ATVIA ++FQ  VNPPGGVWQ D   N S  F N   +              P  +  AGTA++ Y E  K  AY  M   +T+SF  S+S+ILLV+
Subjt:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHM---NTISFLASISVILLVV

Query:  GRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNK----YSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAG
            L+N++   +L   M VAV  +   +F  + +V        Y    + G F++++ ++I  + LVR  G
Subjt:  GRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNK----YSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAG

AT4G13266.1 unknown protein8.4e-0729.05Show/hide
Query:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHM---NTISFLASISVILLVV
        ++ ATVIA ++F   VNPPGGVWQ           + D  S   ++      +   + +   GT+I+ +  P K   Y  M   N +SF AS+ +I LV+
Subjt:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHM---NTISFLASISVILLVV

Query:  GRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDS----FSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSF
          F  +N++   ++ + M VAV  +   +F    +V     F +     + G + LL +LVI  + LVR   +W ++ F
Subjt:  GRFPLKNKICSWLLALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDS----FSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSF

AT5G51160.1 Ankyrin repeat family protein9.3e-0628.45Show/hide
Query:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF
        ++VA+++AT TFQA + PPGG WQ D+   +      +  + N  ++             TAG +IM       +T +   NTI F  S+S++ ++   F
Subjt:  MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRF

Query:  PLKNKICSWLLALAMS
        PL+ ++   ++A+  S
Subjt:  PLKNKICSWLLALAMS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTGTGGCTACGGTCATTGCTACCGTCACTTTTCAAGCCGGAGTGAACCCTCCTGGTGGCGTTTGGCAACCAGACACTCCATTTAATTCTTCCTACTACTTCAATAA
TGATCCAAGATCATTTAATTCTTCCAGCTACTTCGATTATGGTCCATATTATATACCGAGCATACAATTAACAGCTGGAACTGCAATCATGATGTATTTAGAACCCGACA
AATATACGGCTTACACACACATGAATACAATCTCGTTCTTGGCATCTATAAGTGTGATTTTGTTGGTCGTTGGCCGGTTTCCTTTGAAAAATAAGATCTGTAGCTGGCTG
TTGGCACTGGCCATGTCTGTTGCGGTGGCGGCCTTAGGACAGGGGTATTTTCTAGGAGTTGAGATGGTTAACAAATATTCGTACTTTAATGATTCTTTCAGTGGATCATT
CTATTTGTTATATTTATTAGTTATCTCTTGCCTTGGGCTAGTCAGAGTGGCGGGTGTATGGCACATCCTTTCCTTTAAGTTATGGATTGTCAAGACCTTATTCCGCACTT
TCACCACTCAGGTTAAATTCTACTGCTTCAAACGCACCACACCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTTGTGGCTACGGTCATTGCTACCGTCACTTTTCAAGCCGGAGTGAACCCTCCTGGTGGCGTTTGGCAACCAGACACTCCATTTAATTCTTCCTACTACTTCAATAA
TGATCCAAGATCATTTAATTCTTCCAGCTACTTCGATTATGGTCCATATTATATACCGAGCATACAATTAACAGCTGGAACTGCAATCATGATGTATTTAGAACCCGACA
AATATACGGCTTACACACACATGAATACAATCTCGTTCTTGGCATCTATAAGTGTGATTTTGTTGGTCGTTGGCCGGTTTCCTTTGAAAAATAAGATCTGTAGCTGGCTG
TTGGCACTGGCCATGTCTGTTGCGGTGGCGGCCTTAGGACAGGGGTATTTTCTAGGAGTTGAGATGGTTAACAAATATTCGTACTTTAATGATTCTTTCAGTGGATCATT
CTATTTGTTATATTTATTAGTTATCTCTTGCCTTGGGCTAGTCAGAGTGGCGGGTGTATGGCACATCCTTTCCTTTAAGTTATGGATTGTCAAGACCTTATTCCGCACTT
TCACCACTCAGGTTAAATTCTACTGCTTCAAACGCACCACACCTTGAAGATACTCTCAATCAGGTGGTGAAGCTTCTGGATTGGGTGGTGAAGACGTCAGTTCACATGTT
GACCTCTCCTTTTCCAGAGTCCTATAATTAATTAAAAACTTCAACCATCTATTTAACTAAACACTTAGAGTAGGATATTTAAATAATTAGTTAATATAAATGGTGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLVATVIATVTFQAGVNPPGGVWQPDTPFNSSYYFNNDPRSFNSSSYFDYGPYYIPSIQLTAGTAIMMYLEPDKYTAYTHMNTISFLASISVILLVVGRFPLKNKICSWL
LALAMSVAVAALGQGYFLGVEMVNKYSYFNDSFSGSFYLLYLLVISCLGLVRVAGVWHILSFKLWIVKTLFRTFTTQVKFYCFKRTTP