| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0033486.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 3.7e-111 | 92.59 | Show/hide |
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| KAA0040693.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 5.4e-110 | 90.74 | Show/hide |
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| KAA0051719.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.2e-110 | 92.13 | Show/hide |
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| KAA0063098.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 5.4e-110 | 92.59 | Show/hide |
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IAS LTQLT+KGTPFV
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| KAA0063793.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 7.1e-110 | 92.13 | Show/hide |
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SU25 Reverse transcriptase | 1.8e-111 | 92.59 | Show/hide |
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| A0A5A7TC72 Ty3-gypsy retrotransposon protein | 2.6e-110 | 90.74 | Show/hide |
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IVFIDDI++YSKTE EHEEH HQ+LETLRAN+LYAKFSKCEFWL+KV+FLGHVVSSEGVSVDP KIEA+ N PR STVSEIRSFLGLAGYYRRFVEDFSR
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| A0A5A7UE01 Reverse transcriptase | 1.5e-110 | 92.13 | Show/hide |
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|
|
| A0A5A7V646 Reverse transcriptase | 2.6e-110 | 92.59 | Show/hide |
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|
|
| A0A5A7V6R2 Reverse transcriptase | 3.4e-110 | 92.13 | Show/hide |
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 2.4e-44 | 39.05 | Show/hide |
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R+ IDYR+LN++T+ + +P+P +D++ +L F+ IDL G+HQ+ + + KT F +++GHYE++ M FGL NAPA F MN + + L+ +
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V++DDI+++S + EH + + E L L + KCEF ++ +FLGHV++ +G+ +P KIEAI P + EI++FLGL GYYR+F+ +F+ I
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A +T+ KK
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|
|
| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 9.7e-46 | 40.09 | Show/hide |
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R+ IDYR+LN++TI + YP+P +D++ +L F+ IDL G+HQ+ + + I KT F ++ GHYE++ M FGL NAPA F MN + + L+ +
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V++DDI+I+S + EH + L L + KCEF K+ +FLGH+V+ +G+ +P K++AI++ P + EIR+FLGL GYYR+F+ +++ I
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Query: ASLLTQLTKKGT
A +T KK T
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|
|
| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 1.9e-41 | 42.79 | Show/hide |
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RLC+DYR LNK TI + +PLPRID+L ++ A +F+ +DL SGYHQ+ + D KT F + G YE+ VM FGL NAP+ F M F+D FV
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V++DDILI+S++ EH +H +LE L+ L K KC+F ++ FLG+ + + ++ K AI + P TV + + FLG+ YYRRF+ + S+I
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Query: A
A
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|
|
| Q8I7P9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus | 2.7e-43 | 37.32 | Show/hide |
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R+ +D++ LN VTI + YP+P I+ L A F+ +DL SG+HQ+ +++SDIPKT F + G YEF+ + FGL NAPA+F +++ + ++ +
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V+IDDI+++S+ H ++ +L +L L K F +V FLG++V+++G+ DP K+ AI +P ++V E++ FLG+ YYR+F++D++++
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Query: ASLLTQLTK
A LT LT+
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|
|
| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 1.9e-41 | 42.79 | Show/hide |
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RLC+DYR LNK TI + +PLPRID+L ++ A +F+ +DL SGYHQ+ + D KT F + G YE+ VM FGL NAP+ F M F+D FV
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Query: VFIDDILIYSKTEAEHEEHFHQILETLRANRLYAKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSEGVSVDPAKIEAIINLPRLSTVSEIRSFLGLAGYYRRFVEDFSRI
V++DDILI+S++ EH +H +LE L+ L K KC+F ++ FLG+ + + ++ K AI + P TV + + FLG+ YYRRF+ + S+I
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Query: A
A
Subjt: A
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